Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2019 - 2024
0.92
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Journal of Tropical Life Science : International Journal of Theoretical, Experimental, and Applied Life Sciences El-Hayah : Jurnal Biologi Biotropika Journal of Food and Life Sciences Jurnal Teknologi Pertanian Proceeding International Conference on Global Resource Conservation AGRIVITA, Journal of Agricultural Science Biopendix: Jurnal Biologi, Pendidikan dan Terapan JSMARTech : Journal of Smart Bioprospecting and Technology Indian Journal of Forensic Medicine & Toxicology
Estri Laras Arumingtyas
Unknown Affiliation
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemistry Computer Science & IT Education Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Materials Science & Nanotechnology Medicine & Pharmacology Neuroscience Public Health Other

Published : 20 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search
Journal : Biotropika

 1 
Keragaman Morfologi Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) KR 11 Mutan EMS (Ethyl Methanesulfonate) berdasarkan Panduan Karakterisasi Kenaf Hakin, Rikza; Arumingtyas, Estri Laras
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 2, No 1 (2014)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (327.779 KB)

Abstract

Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) merupakan salah satu sumber serat yang cukup potensial untuk dimanfaatkan secara optimal. Peningkatan pemanfaatan tanaman kenaf dapat dilakukan dengan menghasilkan varietas baru kenaf, salah satunya menggunakan EMS. Tujuan dari penelitian ini ialah mengetahui keragaman tanaman kenaf hasil mutasi EMS berdasarkan Panduan Karakterisasi Kenaf yang dikeluarkan oleh Departemen Pertanian. Penelitian dilakukan menggunakan 6 genotip berbeda, yaitu satu control (KR 11) dan lima genotip mutan EMS. Metode yang digunakan ialah melakukan pengamatan pada karakter morfologi yang meliputi karakter kualitatif dan kuantitatif dari karakter daun, bunga maupun karakter batang. Pengamatan karakter daun dilakukan pada saat tanaman berbunga pertama, karakter pembungaan diamati pada saat tanaman mengalami umur berbunga 50% serta karakter batang diamati pada saat panen. Hasil pengamatan kemudian disesuaikan dengan character state yang ditentukan dari Panduan Karakterisasi Kenaf dan dianalisis menggunakan software Clad97. Berdasarkan panduan tersebut, mutan yang memiliki keragaman paling rendah terhadap KR 11 ialah genotip mutan mutan 1 dengan nilai similaritas sebesar 94.4% sedangkan mutan dengan keragaman paling tinggi ditunjukkan oleh genotip mutan 4 dengan nilai similaritas sebesar 67.5%.
GENETIC ANALYSIS AND MOLECULAR INTERACTION OF UGPase IN SOME TUBER PLANTS RELATED TO GLUCOMANNAN PRODUCTION Ulum, Badiul; Arumingtyas, Estri Laras; Kurniawan, Nia
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 1, No 3 (2013)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (248.915 KB)

Abstract

UGPase is an enzyme that affect the conformation of polysaccharide with β 1-4 bond. There are some differences interaction of UGPase enzyme with UDP-Glucose substrate in some tuber plants. So, the aim of this research are to observe the interaction of UGPase and UDP-G in some tuber plants and to observe the relationship among tuber plant based on UGPase sequence. Result of molecular docking shows the catalytic domain interaction of UGPase and UDP-G in substrate binding loop, lower energy free obtain from A. konjac is -5.06 kcal/mol, following by I. batatas and S. tuberosum is -4,60 dan -3,73 kcal/mol respectively. Interaction was stabilize by some interaction type, there are electrostatic and hydrogen in A. konjac and I. batatas, and hydrophobic in S. tuberosum. Sequence alignment of UGPase shows I. batatas and S. tuberosum relatively close than to A. konjac.   Key words: interaction, UDP-Glucose, UGPase
GENETIC ANALYSIS AND MOLECULAR INTERACTION OF UGPase IN SOME TUBER PLANTS RELATED TO GLUCOMANNAN PRODUCTION Badiul Ulum; Estri Laras Arumingtyas; Nia Kurniawan
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 1, No 3 (2013)
Publisher : University of Brawijaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

UGPase is an enzyme that affect the conformation of polysaccharide with β 1-4 bond. There are some differences interaction of UGPase enzyme with UDP-Glucose substrate in some tuber plants. So, the aim of this research are to observe the interaction of UGPase and UDP-G in some tuber plants and to observe the relationship among tuber plant based on UGPase sequence. Result of molecular docking shows the catalytic domain interaction of UGPase and UDP-G in substrate binding loop, lower energy free obtain from A. konjac is -5.06 kcal/mol, following by I. batatas and S. tuberosum is -4,60 dan -3,73 kcal/mol respectively. Interaction was stabilize by some interaction type, there are electrostatic and hydrogen in A. konjac and I. batatas, and hydrophobic in S. tuberosum. Sequence alignment of UGPase shows I. batatas and S. tuberosum relatively close than to A. konjac.   Key words: interaction, UDP-Glucose, UGPase
Keragaman Morfologi Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) KR 11 Mutan EMS (Ethyl Methanesulfonate) berdasarkan Panduan Karakterisasi Kenaf Rikza Hakin; Estri Laras Arumingtyas
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 2, No 1 (2014)
Publisher : University of Brawijaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) merupakan salah satu sumber serat yang cukup potensial untuk dimanfaatkan secara optimal. Peningkatan pemanfaatan tanaman kenaf dapat dilakukan dengan menghasilkan varietas baru kenaf, salah satunya menggunakan EMS. Tujuan dari penelitian ini ialah mengetahui keragaman tanaman kenaf hasil mutasi EMS berdasarkan Panduan Karakterisasi Kenaf yang dikeluarkan oleh Departemen Pertanian. Penelitian dilakukan menggunakan 6 genotip berbeda, yaitu satu control (KR 11) dan lima genotip mutan EMS. Metode yang digunakan ialah melakukan pengamatan pada karakter morfologi yang meliputi karakter kualitatif dan kuantitatif dari karakter daun, bunga maupun karakter batang. Pengamatan karakter daun dilakukan pada saat tanaman berbunga pertama, karakter pembungaan diamati pada saat tanaman mengalami umur berbunga 50% serta karakter batang diamati pada saat panen. Hasil pengamatan kemudian disesuaikan dengan character state yang ditentukan dari Panduan Karakterisasi Kenaf dan dianalisis menggunakan software Clad97. Berdasarkan panduan tersebut, mutan yang memiliki keragaman paling rendah terhadap KR 11 ialah genotip mutan mutan 1 dengan nilai similaritas sebesar 94.4% sedangkan mutan dengan keragaman paling tinggi ditunjukkan oleh genotip mutan 4 dengan nilai similaritas sebesar 67.5%.
Co-Authors A.A. Ketut Agung Cahyawan W Andayani, Dian Wuri Andy Soegianto Apriyono Rahadiantoro Apriyono Rahadiantoro, Apriyono Arik Arubil Fatinah Badiul Ulum Badiul Ulum Catur Retnaningdyah Dedi Dedi Dr.Ir. Yunianta, DEA Dwinianti, Edia Fitri Edi Priyo Utomo Elok Zubaidah Evika Sandi Savitri Fatinah, Arik Arubil Filza Yulina Ade Hermalina Sinay Ihwan Ihwan Joni Kusnadi Luchman Hakim Mochammad Roviq Nia Kurniawan Noor Hidayat, Noor Nunung Harijati Nur Basuki Retno Mastuti Rikza Hakin Rodiyati Azrianingsih Rodiyati Azrianingsih Sari, Dewi Ratih Tirto Serafinah Indriyani Siti Muslichah Sundari Sundari Tatik Wardiyati Wahyu Widoretno