Claim Missing Document
Check
Articles

Found 36 Documents
Search

ISOLASI DAN UJI TOKSISITAS SENYAWA AKTIF DARI EKSTRAK METILENA KLORIDA (MTC) LENGKUAS PUTIH (Alpinia galanga (L)Willd) Jayanti, Nolika Wiji; Astuti, Maria Dewi; Komari, Noer; Rosyidah, Kholifatu
CHEMISTRY PROGRESS Vol 5, No 2 (2012)
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/cp.5.2.2012.774

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk melakukan karakterisasi senyawa hasil isolasi ekstrak metilena klorida lengkuas putih, Alpinia galanga (L) Willd berdasarkan data spektra UV-Vis dan spektra IR, serta menentukan nilai Lethal Concentration (LC)50 senyawa aktif hasil isolasi. Pemisahan ekstrak metilena kloridamenggunakan kromatografi kolom gravitasi (KKG) menghasilkan 220 vial yang digabung menjadi 12 fraksi gabungan (fraksi A-L). Uji Brine Shrimps Lethality Test (BSLT) menunjukkan fraksi I berpotensi sebagai antikanker. Fraksi I dimurnikan lebih lanjut menggunakan Kromatografi Lapis Tipis (KLT) preparatif hingga didapatkan 3 fraksi (I1, I2, dan I3). Fraksi I1 dan I2 diuji kemurniannya dengan KLT tiga sistem eluen dan KLT dua dimensi, menghasilkan senyawa murni, I1 dan I2. Senyawa I1 didapat sebanyak 3,67 mg padatan berwarna kuning dan senyawa I2 didapat sebanyak 6,97 mg padatan berwarna putih. Spektra UV-Vis senyawa I1 menunjukkan adanya cincin aromatik. Spektra IR senyawa I1 menunjukkan adanya gugus –OH, -C=O, -CH alifatik dan –C-O. Senyawa I1 diduga kuat sebagai senyawa flavonoid golongan flavon. Spektra UV-Vis senyawa I2 menunjukkan adanya kromofor -C=C yang tidak terkonjugasi. Spektra IR senyawa I2 menunjukkan adanya gugus –CH alifatik, –C=O, –C=C dan –C–O. Senyawa I2 diduga kuat golongan triterpenoid. Uji toksisitas dilakukan pada senyawa I2 dengan metode Brine Shrimps Lethality Test (BSLT) diperoleh nilai LC50 sebesar 62,4979 ppm. Senyawa I2 berpotensi sebagai antikanker.Penelitian ini bertujuan untuk melakukan karakterisasi senyawa hasil isolasi ekstrak metilena klorida lengkuas putih, Alpinia galanga (L) Willd berdasarkan data spektra UV-Vis dan spektra IR, serta menentukan nilai Lethal Concentration (LC)50 senyawa aktif hasil isolasi. Pemisahan ekstrak metilena kloridamenggunakan kromatografi kolom gravitasi (KKG) menghasilkan 220 vial yang digabung menjadi 12 fraksi gabungan (fraksi A-L). Uji Brine Shrimps Lethality Test (BSLT) menunjukkan fraksi I berpotensi sebagai antikanker. Fraksi I dimurnikan lebih lanjut menggunakan Kromatografi Lapis Tipis (KLT) preparatif hingga didapatkan 3 fraksi (I1, I2, dan I3). Fraksi I1 dan I2 diuji kemurniannya dengan KLT tiga sistem eluen dan KLT dua dimensi, menghasilkan senyawa murni, I1 dan I2. Senyawa I1 didapat sebanyak 3,67 mg padatan berwarna kuning dan senyawa I2 didapat sebanyak 6,97 mg padatan berwarna putih. Spektra UV-Vis senyawa I1 menunjukkan adanya cincin aromatik. Spektra IR senyawa I1 menunjukkan adanya gugus –OH, -C=O, -CH alifatik dan –C-O. Senyawa I1 diduga kuat sebagai senyawa flavonoid golongan flavon. Spektra UV-Vis senyawa I2 menunjukkan adanya kromofor -C=C yang tidak terkonjugasi. Spektra IR senyawa I2 menunjukkan adanya gugus –CH alifatik, –C=O, –C=C dan –C–O. Senyawa I2 diduga kuat golongan triterpenoid. Uji toksisitas dilakukan pada senyawa I2 dengan metode Brine Shrimps Lethality Test (BSLT) diperoleh nilai LC50 sebesar 62,4979 ppm. Senyawa I2 berpotensi sebagai antikanker.
Pemodelan Protein dengan Homology Modeling menggunakan SWISS-MODEL: Protein Modeling with Homology Modeling using SWISS-MODEL Komari, Noer; Hadi, Samsul; Suhartono, Eko
Jurnal Jejaring Matematika dan Sains Vol. 2 No. 2 (2020): Edisi Desember 2020
Publisher : Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Palangka Raya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36873/jjms.2020.v2.i2.408

Abstract

The three-dimensional (3D) structure of proteins is necessary to understand the properties and functions of proteins. Determining protein structure by laboratory equipment is quite complicated and expensive. An alternative method to predict the 3D structure of proteins in the in silico method. One of the in silico methods is homology modeling. Homology modeling is done using the SWISS-MODEL server. Proteins that will be modeled in the 3D structure are proteins that do not yet have a structure in the RCSB PDB database. Protein sequences were obtained from the UniProt database with code A0A0B6VWS2. The results showed that there were two models selected, namely model-1 with the PDB code template 1q0e and model-2 with the PDB code template 3gtv. The results of sequence alignment and model visualization show that model-1 and model-2 are identical. The evaluation and assessment of model-1 on the Ramachandran Plot have a Favored area of ??97.36%, a MolProbity score of 0.79, and a QMEAN value is 1.13. Model-1 is a good 3D protein structure model.
Kajian Termodinamika Adsorpsi Hibrida Merkapto-Silika dari Abu Sekam Padi Terhadap Ion Co(II) Dwi Rasy Mujiyanti; Noer Komari; Ningtyas Indah Sari
Jurnal Kimia Valensi Jurnal Valensi Volume 3, No.2, November 2013
Publisher : Syarif Hidayatullah State Islamic University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (341.2 KB) | DOI: 10.15408/jkv.v3i2.500

Abstract

AbstrakTelah dilakukan penelitian tentang kajian termodinamika adsorpsi hibrida merkapto-silika dari abu sekam padi terhadap ion Co(II). Penelitian ini bertujuan untuk menentukan kapasitas dan energi adsorpsi hibrida merkapto-silika (HMS) dan silika gel (SG) terhadap ion Co(II). Pada penelitian ini, silika gel dibuat menggunakan natrium silikat dari abu sekam padi. Selanjutnya, senyawa organik 3-(trimetoksisilil)-1-propantiol diimobilisasi pada SG menghasilkan HMS. Adsorben dikarakterisasi menggunakan difraktometer sinar-X dan spektrofotometer FTIR. Larutan Co(II) kemudian dikontakkan dengan SG dan HMS pada variasi pH, waktu, dan konsentrasi awal. Hasil penelitian kapasitas adsorpsi yang diperoleh HMS hampir tiga kali lebih besar dibandingkan dengan SG, dengan besarnya kapasitas adsorpsi masing-masing yaitu 250,00 mg/g dan 90,91 mg/g. Sedangkan energi adsorpsi yang diperoleh adalah 51,69 KJ/mol untuk SG, dan 23,65 KJ/mol untuk HMS.Kata kunci : sekam padi, hibrida merkapto-silika, adsorpsi, ion Co(II)AbstractA research on the study of the thermodynamics of adsorption mercapto-silica hybrid from rice husk ash to the ions Co (II) has been done. This study aims to determine capacity and energy adsorption of hybrid mercapto-silica (HMS) and silica gel (SG) to the ions Co (II) . In this study, silica gel was made using sodium silicate from rice husk ash. Furthermore, the organic compound 3-(trimethoxysilil )-1-prophantiol immobilized on SG to HMS produced. Adsorbents were characterized using X-ray diffraction and FTIR spectrophotometer. Solution of Co (II) is then contacted with the SG and HMS at the variation of pH, time , and initial concentration. The results obtained by HMS adsorption capacity is almost three times larger than the SG, the magnitude of adsorption capacity of each is 250.00 mg / g and 90.91 mg / g . While the adsorption energy obtained is 51.69 KJ / mol for SG , and 23.65 KJ / mol for HMS.Keywords : rice husk, mercapto-silica hybrid , adsorption , ion Co(II)
Adsorpsi Pb2+ dan Zn2+ pada Biomassa Imperata cylindrica Noer Komari; Umi Baroroh Lili Utami; Noor Malinda
Jurnal Kimia Valensi Jurnal Valensi Volume 2, No.5, November 2012
Publisher : Syarif Hidayatullah State Islamic University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/jkv.v2i5.298

Abstract

Metode alternatif untuk mengatasi pencemaran logam berat adalah biosorpsi menggunakan biomassa sebagai adsorben. Telah dilakukan penelitian kajian adsorpsi campuran Pb2+ dan Zn2+ pada biomassa Imperata cylindrica sebagai adsorben. Tujuan penelitian adalah mengetahui kemampuan biomassa mengadsorpsi Pb2+ dan Zn2+. Preparasi biomassa dilakukan dengan aktivasi menggunakan asam nitrat dan amonium hidroksida. Adsorpsi dilakukan dengan sistem batch. Parameter yang diukur adalah pH optimum, waktu kontak optimum, kapasitas adsorpsi dan recovery ion logam. Analisis kadar logam dilakukan dengan menggunakan Spektrofotometer Serapan Atom (AAS). Hasil penelitian menunjukkan pH optimum adsorpsi Pb2+ dan Zn2+ masing-masing pada pH 5 dan pH 6. Waktu kontak optimum adsorpsi Pb2+ dan Zn2+ masing masing pada 40 menit dan 30 pertama. Kapasitas adsorpsi Pb2+ dan Zn2+ pada konsentrasi awal 10 ppm masing-masing adalah 90,95% dan 43,60%. Recovery Pb2+ dan Zn2+ masing-masing 84,45% dan 57,13%.
PEMBUATAN HAND SANITIZER ALAMI DI DESA CEMPAKA BARU KOTA BANJARBARU Noer Komari; Dwi Rasy Mujiyanti; Dewi Umaningrum; Dahlena Ariyani
Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat (MEDITEG) Vol 6 No 1 (2021): Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat (MEDITEG)
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat (P3M) Politeknik Negeri Tanah Laut (Politala)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.34128/mediteg.v6i1.81

Abstract

The spread of Covid-19 was out of control and spread throughout Indonesia, including Banjarbaru which had a red zone. Desa Cempaka Baru Kota Banjarbaru is a transmigration settlement that is still safe against Covid-19. Even though it is safe, the community is quite at high risk of contracting it. People are required to comply with health protocols, especially cleaning their hands, including using a hand sanitizer. The demand for hand sanitizers in the market is increasing and the price is also rising, so an alternative is needed to make your own hand sanitizer. The aim of the activity is to educate village communities to make hand sanitizers by utilizing materials around their environment. The activity stages include socialization, implementation of making hand sanitizers, and evaluation. Assistance in the form of hand sanitizer products, hand washing stations, and banners advising the prevention of Covid-19 transmission were also provided to the public. The process of making hand sanitizers was demonstrated by students who helped with activities and involved 15 women who were members of the “Sasirangan Working Group”. The service product is a natural hand sanitizer made from lemongrass and betel leaves. The community was very enthusiastic about participating in this activity and promised to make their own later.
Pemodelan Protein dengan Homology Modeling menggunakan SWISS-MODEL: Protein Modeling with Homology Modeling using SWISS-MODEL Noer Komari; Samsul Hadi; Eko Suhartono
Jurnal Jejaring Matematika dan Sains Vol. 2 No. 2 (2020): Edisi Desember 2020
Publisher : Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Palangka Raya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36873/jjms.2020.v2.i2.408

Abstract

The three-dimensional (3D) structure of proteins is necessary to understand the properties and functions of proteins. Determining protein structure by laboratory equipment is quite complicated and expensive. An alternative method to predict the 3D structure of proteins in the in silico method. One of the in silico methods is homology modeling. Homology modeling is done using the SWISS-MODEL server. Proteins that will be modeled in the 3D structure are proteins that do not yet have a structure in the RCSB PDB database. Protein sequences were obtained from the UniProt database with code A0A0B6VWS2. The results showed that there were two models selected, namely model-1 with the PDB code template 1q0e and model-2 with the PDB code template 3gtv. The results of sequence alignment and model visualization show that model-1 and model-2 are identical. The evaluation and assessment of model-1 on the Ramachandran Plot have a Favored area of ??97.36%, a MolProbity score of 0.79, and a QMEAN value is 1.13. Model-1 is a good 3D protein structure model.
Hesperidin Interaction with HMG-CoA-Reductase Enzyme in Hypercholesterolemia: A Study in Silico Annisa Rizqi Dwi Oktaviani; Veronica Shania Aprillia; Eko Suhartono; Noer Komari
Berkala Kedokteran Vol 17, No 2 (2021)
Publisher : Fakultas Kedokteran Universitas Lambung Mangkurat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (402.773 KB) | DOI: 10.20527/jbk.v17i2.11692

Abstract

Abstract: Dyslipidemia is a degenerative disease occurred with increased levels of fat and cholesterol levels in blood. One of the proteins used as anti-cholesterol is an HMG-CoA-Reductase. Hesperidin in orange peel can reduce cholesterol levels by interacting with HMG-CoA-Reductase. To prove this, an in silico method was used by using swissdock.ch (http://swissdock.ch/docking#). The receptor protein in dyslipidemia was obtained from the RCSB Protein Data Bank (https://www.rcsb.org) namely HMG-CoA-reductase receptor with code PDB: 1HW9. The natural ligand, hesperidin, was obtained from PubChem with code: 10621 (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/). Protein was prepared by omitting the natural ligand residues present in the protein. Ligand and protein preparations were used by the chimera 1.15. The result of this study indicated that the interaction of hesperidin with several amino acid recidues was predicted to provide inhibitory activity on HMG-CoA reductase as the protein target. Inhibition of HMG-CoA reductase will reduce mevalonate synthesis so that cholesterol levels will decrease.  Keywords: hesperidin, HMG-CoA-Reductase, cholesterol, dyslhahipidemia
Penambatan Molekul Kandungan Eurycoma longifolia Jack. (Pasak bumi) terhadap Human Phosphodiesterase 5 Samsul Hadi; Khoerul Anwar; Amalia Khairunnisa; Noer Komari
Jurnal Pharmascience Vol 7, No 2 (2020): Jurnal Pharmascience
Publisher : Program Studi Farmasi FMIPA Universitas Lambung Mangkurat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20527/jps.v7i2.8731

Abstract

Pasak bumi sebagai obat tradisional pria telah digunakan oleh masyarakat melayu, khususnya orang Sumatra dan kalimantan, akan tetapi mekanisme secara molekuler belum dikatahui dengan jelas. Salah satu pendekatan yang dapat digunakan untuk mengetahui mekanisme pasak bumi sebagai obat tradisional yang bermanfaat mengatasi disfungsi ereksi adalah penambatan molekul. Penambatan melekul dilakukan dengan cara melihat interaksi ligand dengan reseptor. Ligand yang berasal dari pasak bumi adalah 5-methoxycanthin-6-one, 9-methoxycanthin-6-one, eurycomalactone, eurycomalide A, eurycomanone, eurycomaoside, laurycolactone A, longilactone, niloticin, picrasidine O. Sehingga kesepuluh ligand ini didocking menggunakan salah satu aplikasi docking yaitu PLANTS 1.1 untuk melihat ikatan dengan PDE5. Sebelum dilakukan docking terhadap ligand pasak bumi, terlebih dahulu dilakukan docking terhadap ligand Sildenafil untuk melhat nilai RMSD. RMSD ini diperlukan sebagai alat validasi metode, berdasarkan percobaan, nilai RMSD dari Sildenafil adalah 1,2517 A0. Hasil terbaik dari penambatan molekul pasak bumi adalah niloticin dengan skor doking -97,8802, sehingga nilai interaksinya terhadap reseptor sebesar 93,71% dari Sildenafil.Pasak bumi as traditional male medicine has been used by Malay people, especially Sumatra and Borneo people, but the molecular mechanism is not yet known clearly. One approach that can be used to determine the mechanism of the Pasak Bumi as a traditional medicine that is useful to overcome erectile dysfunction is docking molecules. Molecular docking is done by looking at the interaction of ligands with receptors. Ligands originating from the Pasak Bumi are 5-methoxycanthin-6-one, 9-methoxycanthin-6-one, eurycomalactone, eurycomalide A, eurycomanone, eurycomaoside, laurycolactone A, longilactone, niloticin, picrasidine O. docking application namely PLANTS 1.1 to see the bond with PDE5. Before docking Pasak Bumi ligand, it is first docking Sildenafil ligand to see the RMSD value. The RMSD is needed as a method validation method, based on experiments, the RMSD value of Sildenafil is 1.2517 A0. The best results from docking of the Pasak bumi molecule is niloticin with a doctor score of -97.8802, so interaction skor to the receptor is 93.71% of Sildenafil.Keywords: Pasak Bumi, PDE5, PLANTS
Molecular docking of phytosterols in Stenochlaena palustris as anti-breast cancer Dona Marisa; Lisda Hayatie; Siti Juliati; Eko Suhartono; Noer Komari
Acta Biochimica Indonesiana Vol. 4 No. 2 (2021): Acta Biochimica Indonesiana
Publisher : Indonesian Society for Biochemistry and Molecular Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.32889/actabioina.59

Abstract

Background: Stenochlaena palustris, also known as kelakai or lemidi, is frequently linked to anti-inflammatory, anti-bacterial, anti-fungal, and antioxidant properties. S. palustris phytosterols are suggested to suppress the progression of breast cancer. Objective: The objective of this study is to evaluate the potential of phytosterols found in S. palustris to act as estrogen receptor (ER) inhibitors. Methods: Phytosterols (alpha-tocopherol, beta-sitosterol, campesterol, stigmasterol, fucosterol) were docked to estrogen receptor (PDB ID: 7KBS). Molecular docking parameters included Gibb's free energy and interactions between ligand and protein. ADMET properties were analyzed using pkCSM and SwissADME. Results: Alpha-tocopherol showed the highest interaction with the estrogen receptor with ΔG value -8. 9254 kcal/mol (the native ligand, raloxifene, had a G value of -12.052 kcal/mol). Leu387 (hydrogen bond); Phe404 (Phi-phi-T shaped), Leu391, Leu346, Trp383, Leu354, Ala350, Leu525, Leu349 (Alkyl) were among the residues by which a-tocopherol interacted with ER. Alpha-tocopherol has no hepatotoxicity and no skin sensitization. Conclusion: By suppressing ERa, phytosterols from S. palustris may have potential anti-breast cancer activity and may be used to prevent estrogen-dependent human cancers like breast cancer.
PENGARUH pH, KADAR GULA, BERAT DAN WAKTU INKUBASI SEL RAGI IMOBIL TERHADAP EFISIENSI FERMENTASI LIMBAH NENAS MENJADI BIOETANOL Erfanur Adlhani; Noer Komari; Abdullah Abdullah
Jurnal Teknologi Agro-Industri Vol 1 No 1 (2014)
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat, Politeknik Negeri Tanah Laut

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (142.04 KB) | DOI: 10.34128/jtai.v1i1.25

Abstract

Etanol merupakan produk industri kimia yang kebutuhannya diperkirakan akan semakin meningkat pada masa mendatang. Bioetanol adalah etanol yang dihasilkan melalui proses fermentasi gula dari sumber karbohidrat menggunakan bantuan mikroorganisme. Salah satu sumber karbohidrat yang potensial adalah limbah nenas. Penelitian ini ingin mengetahui penggunaan limbah nenas untuk memproduksi bioetanol menggunakan sel ragi imobil. Sel ragi imobil telah terbukti dapat meningkatkan kadar bioetanol. Metode imobilisasi yang digunakan adalah entrapment (penjeratan) dalam matriks agar-agar. Beberapa parameter yang diteliti adalah pH, kadar gula dalam limbah nenas, perbandingan berat limbah nenas dan sel ragi, waktu inkubasi serta uji stabilitas sel ragi imobil. Hasil penelitian menunjukkan pH optimum sel ragi imobil berada pada pH = 6, kadar gula optimum 24,4 g (dalam 200 g limbah nenas), perbandingan berat optimum limbah nenas terhadap sel ragi 1 : 0,5, waktu inkubasi 3 hari dan sel ragi imobil tidak mengalami penurunan aktivitas yang berarti setelah penggunaan sebanyak 3 kali secara berkesinambungan dengan nilai efisiensi fermentasi sebesar 38,48% (b/b). Dalam penelitian ini dilakukan juga proses fermentasi limbah nenas dengan sel ragi tanpa diimobilisasi sebagai pembanding, dan hasil yang diperoleh menunjukkan pH optimum sel ragi berada pada pH = 5, kadar gula optimum 24,4 g (dalam 200 g limbah nenas), perbandingan berat optimum limbah nenas terhadap sel ragi 1 : 0,5, dan waktu inkubasi optimum 3 hari dengan nilai efisiensi fermentasi sebesar 37,79% (b/b).