Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

DEVELOPMENT OF REAL TIME POLYMERASE CHAIN REACTION FOR DETECTION OF Salmonella typhimurium AND Salmonella enteritidis IN FISH Tuti Hartati Siregar; Jennifer Elliman; Leigh Owens
Squalen, Buletin Pascapanen dan Bioteknologi Kelautan dan Perikanan Vol 7, No 2 (2012): August 2012
Publisher : Research and Development Center for Marine and Fisheries Product Processing and Biotechnol

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15578/squalen.v7i2.21

Abstract

Previously designed endpoint PCR has been adapted for use with real time PCR to detect the presence of Salmonella typhimurium and Salmonella enteritidis  in fish. Optimization of a standard curve in the presence of herring sperm DNA as background matrix indicated that the real time PCR highly efficient with the Pearson coefficient of determination (R2) value = 0.99937 and slope (M) value = -3.44. An enrichment method (overnight culture) significantly increased (p0.05) the sensitivity of real time PCR. Comparison of real time PCR and the conventional isolation method based on biochemical tests has been conducted. In terms of their sensitivity, real time PCR and the conventional methods are not significantly different in the level of confidence 95%. Both real time PCR with enrichment method and conventional biochemical method can detect the presence of Salmonella spp. in spiked sample. However the direct extraction method was only detecting the presence of Salmonella in higher concentration. While the sensitivity both conventional and real time PCR are similar, the real time PCR has an advantage to detect the pathogen qualitatively and quantitatively depending on processing method.
Kandungan Logam Berat pada Beberapa Lokasi Perairan Indonesia pada Tahun 2001 sampai dengan 2005 Tuti Hartati Siregar; Jovita Tri Murtini
Squalen, Buletin Pascapanen dan Bioteknologi Kelautan dan Perikanan Vol 3, No 1 (2008): June 2008
Publisher : Research and Development Center for Marine and Fisheries Product Processing and Biotechnol

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15578/squalen.v3i1.165

Abstract

Logam  berat merupakan  salah  satu  bahan  pencemar  yang  perlu  diwaspadai. Di  Indonesia, pencemaran  logam  berat  dapat berasal  dari  limbah  industri,    pertanian maupun  rumah  tangga. Oleh  karena  itu, Balai Besar Riset Pengolahan  Produk  dan Bioteknologi Kelautan dan  Perikanan telah melakukan penelitian monitoring residu logam berat pada biota maupun perairan di beberapa lokasi selama 5  tahun  yaitu dari  tahun 2001  sampai dengan 2005.  Tulisan  ini merupakan  review dari hasil penelitian  tersebut.   Pada tahun 2001, Perairan Dadap, Cilincing, Demak, dan Pasuruan telah  tercemar  oleh  logam Hg, sementara Perairan Tanjung  Pasir dan Blanakan belum  tercemar dengan residu Hg di bawah 2 ppb. Pada tahun 2002, perairan  laut di Sumatera yang diwakili oleh Perairan Mentok, Perairan Tanjung Balai, Perairan Tanjung  Jabung Timur, dan Perairan Bagan Siapi-api  terbukti masih  aman untuk  kebutuhan  perikanan dengan  residu Hg  kurang  dari  2  ppb. Kerang  yang  hidup  di  perairan  tersebut  juga masih  aman  untuk  dikonsumsi. Ambang  batas residu logam dalam produk perikanan adalah Hg 500 ppb, Cd 1.000 ppb,Pb 2.000 ppb, dan Cu 20.000 ppb. Pada  tahun  2002,  perairan Sidoarjo  juga masih dalam  batas  aman  dengan  residu Hg kurang dari 2 ppb,  tetapi Perairan Pasuruan  telah  tercemar oleh  logam Hg  dengan  residu Hg di atas 2 ppb. Pada  tahun 2002, kerang yang hidup di perairan Jawa dan Bali masih aman untuk dikonsumsi. Pada  tahun  2003,  perairan di Kalimantan  dan Sulawesi masih  dalam  batas  aman, begitu  juga  dengan  biota  yang  hidup  di  perairan  tersebut masih  aman  untuk  dikonsumsi. Pada tahun 2005, Muara Sungai Kahayan dan Muara Sungai Barito  telah  tercemar oleh  logam Cd dan Cu,  tetapi  ikan  yang  hidup  di  dalamnya masih  aman  untuk  dikonsumsi.  Pada  tahun  tersebut Waduk Saguling  telah  tercemar oleh  logam Pb, Cd, dan Cu sementara Waduk Cirata  tercemar oleh  logam Hg dan Waduk  Jatiluhur  tercemar  oleh  logam Cu dan Cd.  Ikan  yang  hidup di  ketiga waduk  tersebut masih  aman  untuk  dikonsumsi.