Agustina L.N. Aminin
Department Of Chemistry, Faculty Of Sciences And Mathematics, Universitas Diponegoro, Jl. Prof. Soedarto No.50275, Tembalang, Semarang City, Central Java, 50275

Published : 31 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 31 Documents
Search

Pemurnian DNA Plasmid Puc19 Menggunakan Kolom Silika dengan Denaturan Urea Aini, Annisa Nur; Sarjono, Purbowatiningrum Ria; Aminin, Agustina L. N.
JURNAL SAINS DAN MATEMATIKA Volume 19 Issue 2 Year 2011
Publisher : JURNAL SAINS DAN MATEMATIKA

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (4773.098 KB)

Abstract

Pemurnian DNA plasmid berbasis silika didasarkan pada fakta bahwa DNA dapat dimurnikan menggunakan fase padat seperti silika dengan adanya denaturan. Adsorpsi DNA pada permukaan silika merupakan alternatif metode pemurnian yang efektif dan efisien dibandingkan metode pemurnian konvensional. Prinsip metode ini adalah pengikatan molekul air oleh denaturan dan adanya ikatan hidrogen antara gugus fosfat DNA dengan gugus silanol (SiOH-) pada permukaan silika. DNA plasmid pUC19 diisolasi dari sel inang E.coli JM109 menggunakan metode lisis alkali dan dimurnikan dengan dua metode, yaitu ekstraksi fenol-khloroform dan kolom silika. Hasil kemurnian DNA plasmid menggunakan kolom dengan silika 5 mg pada konsentrasi urea 6 M sebesar 1,36. Nilai tersebut lebih tinggi dibandingkan hasil pemurnian dengan ekstraksi fenol:kloroform-isoamil alkohol yaitu sebesar 1,28. Variasi konsentrasi urea 5-9 M pada kolom dengan silika gel 5 mg dan 25 mg digunakan untuk mengetahui profil kapasitas urea sebagai agen denaturan pada pemurnian DNA plasmid. Hasil analisis secara spektrofotometri menunjukkan nilai kemurnian DNA plasmid pada konsentrasi urea 6-8 M berada pada kisaran 1,33 dan 1,48. Konsentrasi DNA plasmid tertinggi diperoleh pada kolom silika gel 25 mg dengan urea 8 M, sebesar 645 μg/mL.   Keywords: DNA plasmid, pemurnian, kolom  silika gel, denaturan, urea
Isolasi dan Karakterisasi Selulase dari Bakteri Selulolitik Termofilik Kompos Pertanian Desa Bayat, Klaten, Jawa Tengah Alam, Moch Syaiful; Sarjono, Purbowatiningrum Ria; Aminin, Agustina L. N.
JURNAL SAINS DAN MATEMATIKA Volume 21 Issue 2 Year 2013
Publisher : JURNAL SAINS DAN MATEMATIKA

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (4033.545 KB)

Abstract

Hidrolisis selulosa secara enzimatik dilakukan oleh selulase. Selulase termostabil lebih disukai oleh industri karena mempunyai aktifitas optimum pada suhu tinggi dan tahan kontaminan. Selulase termostabil dapat diisolasi dari bakteri yang berasal dari kompos termofilik. Penelitian ini bertujuan mendapatkan isolat bakteri selulolitik termofilik dari kompos pertanian fase termofil, mendapatkan selulase termostabil dan mendapatkan data karakteristik selulase termostabil yang meliputi pH dan suhu optimum. Hasil penelitian mendapatkan dua isolat bakteri selulolitik (KB dan KK), dimana isolat  KB relatif lebih optimal tumbuh dibanding KK. Unit aktifitas spesifik selulase tertinggi isolate KB didapatkan pada 20-40% amonium sulfat sebesar 5,539 unit/mg, dengan aktifitas optimum pada suhu 55 oC dan pH 8.   Kata kunci: selulase, bakteri selulolitik, kompos termofilik
Profil Kandungan Protein dan Tekstur Tahu Akibat Penambahan Fitat pada Proses Pembuatan Tahu Sarjono, Purbowatiningrum Ria; Mulyani, Nies Suci; Aminin, Agustina L. N.; Wuryanti, Wuryanti
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 9, No 1 (2006): Volume 9 Issue 1 Year 2006
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (28.786 KB) | DOI: 10.14710/jksa.9.1.6-9

Abstract

Telah dilakukan penelitian yang bertujuan untuk mempelajari profil kandungan protein dan tekstur tahu akibat penambahan fitat pada proses pembuatan tahu dengan koagulan asam asetat. Fitat merupakan senyawa monoinositol heksafosfat yang terdapat pada biji-bijian berkisar 1-5 % (b/b) dan dikenal sebagai antioksidan alami. Oleh karena itu diupayakan untuk memanfaatkan fitat kedalam proses pengolahan makanan untuk meningkatkan produknya.Pada penelitian ini tekstur tahu diukur dengan alat Penetrometer dan kadar protein dengan metode Kjeldahl pada variasi pH penggumpalan protein susu kedelai tanpa penambahan fitat dan dengan penambahan fitat.Hasil penelitian menunjukkan bahwa variasi pH penggumpalan protein susu kedelai yang ditambahi fitat ternyata mempengaruhi gumpalan tahu yang terbentuk. Jika dibandingkan dengan tahu tanpa penambahan fitat maka terjadi penurunan berat protein tahu pada pH titik isoelektrik (4,5) yaitu dari 8,131 g menjadi 6,273 g. Bertambahnya konsentrasi fitat hingga 0,05 % (b/v) menyebabkan naiknya kekerasan tahu dari 3,02 cm menjadi 1,88 cm. Diatas konsentrasi tersebut kekerasan tahu menurun. Dari hasil tersebut dapat disimpulkan bahwa penambahan fitat akan menyebabkan meningkatnya kekerasan tahu namun dapat menurunkan kadar protein tahu.Kata kunci: tahu, fitat, titik isoelektrik.
Antioxidant activity of soybean and gembus tempeh Sunarti Sunarti; Rosyida Awalia Safitri; Agustina LN Aminin; Mohammad Sulchan; Banundari Rahmawati
International Journal of Public Health Science (IJPHS) Vol 10, No 1: March 2021
Publisher : Intelektual Pustaka Media Utama

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.11591/ijphs.v10i1.20511

Abstract

Soybean tempeh and gembus tempeh are traditional foods that have long been known in Indonesia, which in a modern way are classified as functional food. Various studies related to the antioxidant activity of soybean and gembus tempeh has been reported. This study aimed to compare the antioxidant capacity of soybean tempeh and gembus tempeh that are circulating in the community. The results of the research are expected to be an evaluation of soybean tempeh and gembus tempeh quality available in the market. The results of this research are expected to be an evaluation of soybean tempeh and gembus tempeh quality available in the market. The research design was a cross-sectional experimental study to measure antioxidants activity of 31 soybeans tempeh and 29 gembus tempeh. Sample of this study was selected through simple random sampling technique. The measurement of antioxidant activity carried out was the 2.2-diphenyl 1-picrylhydrazyl (DPPH) method; ethanol extraction of 95%. Results revealed that the antioxidant activity of gembus tempeh was significantly higher than soybean tempeh; (32.521; 19.831) vs., (17.016; 13.195), respectively.
Genetic Diversity and Connectivity of Sea Urchin Tripneustes gratilla in Region Surrounding Cenderawasih Bay, Papua-Indonesia and Indo-Pacific Abdul Hamid A. Toha; Ambariyanto Ambariyanto; Widodo Widodo; Luchman Hakim; Sutiman B. Sumitro; Agustina L. N. Aminin
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 29 No. 2 (2022): March 2022
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.4308/hjb.29.2.155-163

Abstract

Cenderawasih Bay has extremely high biodiversity with an enormous amount of endemic species due to geography isolation. Tripneustes gratilla is one of the species that is abundant in the bay. The species has ecological value that is suitable for bio-indicators of the environmental condition. Since the Bay relatively isolated area, then we examined the impact of the geographical conditions on genetic diversity and connectivity of Tripneustes gratilla among populations in the region surrounding Cenderawasih Bay based on the mitochondrial cytochrome c-oxidase-1 gene. Results of the study showed that genetic variation of the species within the population is high; despite the genetic variation among populations was low. The data suggested that the entire population of T. gratilla were closed connected, homogeneous, and shared polymorphic profile. Then we assumed the gene flow occurred for a long time among populations without geographical barriers. This information is a warrant to develop an effective strategy to maintain biodiversity in the Cenderawasih Bay.
16S Ribosomal RNA-Based Analysis of Thermophilic Bacteria in Gedongsongo Hot Spring AGUSTINA LULUSTYANINGATI NURUL AMININ1; FIDA MADAYANTI; PINGKAN ADITIAWATI; . AKHMALOKA
Microbiology Indonesia Vol. 1 No. 1 (2007): April 2007
Publisher : Indonesian Society for microbiology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (444.526 KB) | DOI: 10.5454/mi.1.1.9

Abstract

Denaturing gradient gel electrophoresis was used to identify the bacterial community at the Gedongsongo (WGS-2) hot spring. The bacterial samples were obtained from both culture dependent and independent strategies. Partial 16S rRNA genes were amplified by a set of primers to produce at around 400 bp fragments, including the highly variable V9 region of the 16S rRNA genes. The DGGE profiles showed that there were a few distinct bands, namely G1-G3, and G8-G12, which represent the predominant bacteria in natural habitat and the medium.Further analysis of these bands showed that most of them, except for G7, have a high homology to the 16S rRNA gene sequences of Thermus sp. As for G7, the highest homology was shown to unculturable bacteria. In addition to the distinct bands in DGGE, there were other three thin bands, namely G4, G5, and G6, which possibly represent non dominant microorganisms in the natural habitat, but could grow on GS-A medium. Further analysis of these bands showed that G6 has 80% similarity to the 16S rRNA of Burkholderia sp., while G4 and G5 have a high homology to each other but only contained 10-15% homology to the sequences of 16S rRNA from unculturable microorganisms. The phylogenetic analyses of the last organisms showed that there was branching from Burkholderia. From all the data obtained it was suggested that the WGS-2 hot spring was predominantly occupied by the genus Thermus. In addition, there were a few novel microorganisms found in the hot spring.
The Comparison of Spectrophotometric and TLC-Densitometric for DPPH Radical Scavenging Activity Analysis of Three Medicinal Plant Extracts Bambang Cahyono; Christina Setyadewi M.; M. Suzery; Agustina L. N. Aminin
JKPK (Jurnal Kimia dan Pendidikan Kimia) Vol 5, No 2 (2020): JKPK (Jurnal Kimia dan Pendidikan Kimia)
Publisher : Program Studi Pendidikan Kimia FKIP Universitas Sebelas Maret

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20961/jkpk.v5i2.40370

Abstract

In this research, Thin Layer Chromatography-Densitometry has proven to be a good method for analyzing 1, 1 diphenyl 2-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging activity, since this approach displayed the similar trends with UV-Vis spectrophotometric method. Three medicinal plants collected from Semarang used to evaluate both methods.  The IC50 value ranged from 25.26 - 4913.74 ppm shown by UV-Vis spectrophotometric and 24.74 – 4674.61 ppm using TLC-Densitometric. Meniran Dechlorophyllated (Phyllanthus niruri) provides the strongest antioxidant activity and the weakest de-chlorophylated parsley (Petroselinum crispum). The paired sample t-test points from a non-dechlorophylation extract using the TLC densitometry test significantly gives a lower IC50 value than the UV spectrophotometry method-has. The maximum increase of peak area under the UV light 365 nm up to 56.08 %. This evidence supports the presumption that the scavenging radical DPPH caused not only decreasing the maximum absorbance under UV light 516 nm but also increasing the absorbance under UV light ± 365 nm.
Aktivitas Inhibisi α-Glukosidase dan Identifikasi Senyawa dalam Fraksi Aktif Bunga Rosella (Hibiscus Sabdariffa L.) Irma Yunitasari; Agustina L. N. Aminin; Khairul Anam
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 18, No 3 (2015): Volume 18 Issue 3 Year 2015
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (847.977 KB) | DOI: 10.14710/jksa.18.3.110-115

Abstract

Rosela merupakan tanaman yang dapat digunakan untuk mengatasi penyakit diabetes melitus (DM), dalam terapi DM dapat dilakukan dengan menghambat kerja enzim α-glukosidase. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan fraksi aktif dari ekstrak bunga rosella yang berpotensi sebagai inhibitor α-glukosidase dan mengidentifikasi jenis senyawa dalam fraksi aktif tersebut. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah ekstraksi menggunakan pelarut metanol-HCl 0,1%, dilanjutkan fraksinasi secara kromatografi kolom dengan fasa diam sephadex LH-20 dan fasa gerak air-metanol fraksi A (100:0), fraksi B (75:25), fraksi C (50:50), fraksi D (25:75), fraksi E (0:100), dan uji aktivitas inhibisi α-glukosidase fraksi bunga rosella. Identifikasi senyawa aktif yang memberikan nilai aktivitas penghambatan α-glukosidase paling tinggi dengan KLT dan penampak bercak (AlCl3, uap amoniak dan FeCl3), penentuan kadar relatif (%) komponen dari fraksi aktif dengan TLC scanner, dan karakterisasi senyawa utama dalam fraksi aktif menggunakan spektrofotometer UV-Vis dan FTIR. Hasil penelitian menunjukan bahwa fraksi C (50:50) merupakan fraksi aktif yang memberikan nilai aktivitas inhibisi α-glukosidase paling tinggi (31,163 %) pada konsentrasi 1000 ppm, dan senyawa utama dalam fraksi C adalah 3,3’,4’-trihidroksiflavon dan 5,7,3’,4’-tetrahidroksiflavon dengan masing-masing kadar relatif 23,33% dan 24,52 %.
DNA Polimerase sebagai Model Kajian Biomolekul Enzim Termostabil Isolat Lokal Agustina L. N. Aminin; Akhmaloka Akhmaloka; Hendro Pramono
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 3, No 2 (2000): Volume 3 Issue 2 Year 2000
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (4090.218 KB) | DOI: 10.14710/jksa.3.2.79-84

Abstract

Ekstremozim merupakan bahan kajian penelitian yang banyak dilakukan dalam dekade terakhir. Enzim ini merupakan biokatalis yang sangat efektif digunakan dalam proses industri. Salah satu sumber ekstremozim yang cukup potensial adalah bakteri termofilik, tumbuh pada sumber air panas. Indonesia merupakan negara yang kaya akan sumber air panas, tetapi sampai saat ini belum banyak peneliti yang mengeksplorasi bakteri termofilik. Salah satu bakteri termofilik dari Cimanggu, suatu sumber air panas di sekitar Bandung yang memiliki suhu sekitar 80°C telah berhasil diisolasi. DNA polimerase dipilih sebagai enzim model untuk mempelajari struktur fungsi dari enzim termostabil. Kloning terhadap gen pengkode DNA polimerase dilakukan dengan pendekatan pustaka genom dan amplifikasi genom menggunakan teknik PCR. Primer dirancang berdasarkan homologi urutan nukleotida gen pengkode DNA polimerase dari Thermus aquaticus dan Thermus thermophilus. Primer P1-P3 mengamplifikasi empat fragmen berukuran 1 kb, 1,4 kb, 1,6 kb dan 1,8 kb yang tidak saling overlap. Dalam hal ini fragmen DNA 1 kb telah ditentukan urutan nukleotidanya.
Freeze-thaw system for thermostable β-Galactosidase isolation from Gedong Songo Geobacillus sp. isolate Ken Ima Damayanti; Nies Suci Mulyani; Agustina L. N. Aminin
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 23, No 11 (2020): Volume 23 Issue 11 Year 2020
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (2994.949 KB) | DOI: 10.14710/jksa.23.11.383-389

Abstract

The effective isolation of intracellular enzymes from thermophilic bacteria is challenging because of their sturdy membrane. On the other hand, the low-cost and nontoxic method is essential for industrial food enzymes. The freeze-thaw cycles using acetone-dry ice as a frozen system was studied for efficient isolation of thermostable b-galactosidase from Geobacillus sp. dYTae-14. This enzyme has been known for application in the dairy industry to reduce the lactose content. In this study, the freeze-thaw method was performed with cycle variations 3, 5, and 7 cycles. Acetone-dry ice (-78°C) is used as a frozen system and boiling water for thawing. The b-galactosidase activity was assayed using ortho-Nitrophenyl-β-galactoside (ONPG) as substrate and protein content determined with the Lowry method. The results show that the most effective freeze-thaw is five cycles. The enzyme’s highest specific activity is 3610.13 units/mg proteins at 40-60 % ammonium sulfate saturation, with a purity value of 2.52.