Claim Missing Document
Check
Articles

Found 7 Documents
Search

In silico Docking Reveals Interaction Pattern between Topoisomerase I and Camptothecin Analogs: Implication for Ovarian Cancer Treatment Nuha, Ulin; Mustofa, Zainul
Proceeding International Conference on Global Resource Conservation Vol 6, No 1: Proceeding of 6th ICGRC 2015
Publisher : Proceeding International Conference on Global Resource Conservation

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (0.209 KB)

Abstract

Ovarian cancer is one of cancer types that begins in the ovaries. Many kind of anticancer agents are developed for the treatment now. Camptothecin analogs are agent that inhibit the action of DNA topoisomerase I, a nuclear enzyme that relaxes the supercoiled DNA during the replication, recombination, transcription, and repair of DNA. FDA have been approved two camptothecin analogs for the treatment of ovarian and colorectal cancer, those are topotecan and irinotecan. Another analogs are in various stages of clinical development, including 9-aminocamptothecin, rubitecan, lurtotecan, and exatecan mesylate. The purpose of this study is to discover interaction pattern between topoisomerase I and camptothecin analogs through in silico docking. PyRx is used for DNA topoisomerase I and camptothecin analogs docking. The interactions between topoisomerase I and camptothecin analogs were visualized and analyzed using PyMol and LigPlus. Our results show that the binding pattern between another camptothecin analogs, including rubitecan, lurtotecan, and 9-aminocamptothecin, with DNA topoisomerase I is relative similar with irinotecan-DNA topoisomerase I complex, specifically in the binding of Arg364, Asn491, Lys493 and Lys532.6 Keywords: camptothecin analogs; in silico docking; interaction pattern; ovarian cancer; topoisomerase I
6-Gingerol from Zingiberaceae as a Result of Reverse Docking for Prostate’s Cancer Potential Drug Candidate Setyanto, Haqqi Anajili; Widiansyah, Arindra Trisna; Mustofa, Zainul
Proceeding International Conference on Global Resource Conservation Vol 6, No 1: Proceeding of 6th ICGRC 2015
Publisher : Proceeding International Conference on Global Resource Conservation

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (0.209 KB)

Abstract

Prostate cancer is a cancer that attacks the prostate gland causing the death rate which is high enough. One of the causes of prostate cancer is the androgen receptor (AR) in the gland cells that initiates the formation of excess cell proliferation, thus causing prostate cancer. AR inhibitor that is known is antiandrogen (biculatamide and enzalutamide). This study aimed to test the 6-gingerol compound of ginger as an AR inhibitor drug candidate for prostate cancer using silico methode. The 3D structure of the 6-gingerol compound was taken from PubChem, the prediction of targeted protein used SwissTargetPrediction and Pharmapper, analysis and docking 6-gingerol and antiandrogens with AR using Pyrx software, visualization compounds and protein interactions using PyMOLsoftware. Visualization results shows that the interaction of 6-gingerol, biculatamide, and enzalutamide with AR have the same site. This proves that the 6-gingerol is potential as anAR inhibitor candidate.Keywords: 6-gingerol; prostate’s cancer; reverse docking
The Inventory of Aquatic Macroinvertebrates in Various Waterfall in East Region of Malang, East Java Wijayanti, Erna; Fauzi, Ahmad; Widiansyah, Arindra Trisna; Mustofa, Zainul; Setyanto, Haqqi Anajili; Sukoco, Restu Megadiana; Nuha, Ulin; Fadilah, Rizka Elan
Proceeding International Conference on Global Resource Conservation Vol 6, No 1: Proceeding of 6th ICGRC 2015
Publisher : Proceeding International Conference on Global Resource Conservation

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (0.209 KB)

Abstract

Indonesia as Maritime Island has many water regions. Waterfall is one of the water region that has a large number of aquatic macroinvertebrates. The aim of this research is to collect and identify the various aquatic macroinvertebrates that can be found in several waterfalls in east Region of Malang, East Java. The research was carried out on September until November 2015 in six waterfalls: Coban Jahe, Coban Pelangi, Coban Trisula, Coban Kembar, Coban Ringin Gantung and Coban Pitu. Dragnet was used to collect the samplesof aquatic macroinvertebrates in some sampling point. The result of this research was found 38 families that belonged to 18 ordo in 6 different classes: Insecta, Oligochaeta, Gastropoda, Hirudinae, Turbellaria, and Crustacea. The information about the inventory of aquatic macroinvertebrates will give another suggestion for the local government to conserve this animals especially waterfall environment, not only as tourist area but also as a source of knowledge to do another research. Keywords: Aquatic macroinvertebrates; inventory; Malang; waterfalls
Variasi Genetik Jagung (Zea mays L.) Berdasarkan Karakter Fenotipik Tongkol Jagung yang Dibudidaya di Desa Jono Oge Genetic Variation of Maize (Zea mays L.) Cultivated in Village of Jono Oge Based on the Cob Phenotypic Characters Mustofa, Zainul; Budiarsa2, I Made; Samdas, Gamar Binti Non
e-JIP BIOL Vol 2, No 3 (2014): e-Jipbiol Jurnal elektronik Prodi Biologi
Publisher : Universitas Tadulako

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (255.846 KB)

Abstract

Abstract This study aims to determine the genetic variation in maize varieties cultivated in the village of Jono Oge. The method used is descriptive method of cob phenotypic characters included 24 quantitative and qualitative characters. The samples used were 6 varieties of Octora, Lamuru, Jaya 2, Kumala, Bonanza and local Pulut. The data were analyzed using the formula of average (mean) and standard deviation, and then were further tested using MVSP program (Multivariate Statistical Package). Data were edited by using PFE program (Program File Editor) and the Clustering based dendogram was constructed to show the genetic relationship among varieties or individual relationships between varieties by UPGMA algorithm. Similarity index was calculated by using Simple Matching existing coëficient on MVSP. The results showed that there were variation on the quantitative and qualitative characters of maize cultivated in Jono Oge. This data was reinforced by the support of similarity index varied between varieties and between individuals that occur in Lamuru and local Pulut varieties with the support of similarity index between 0.65% - 1%. Keywords: Genetic variation, corn, phenotypic character Abstrak Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui variasi genetik varietas jagung yang dibudidayakan di Desa Jono Oge. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif dengan menggunakan 24 karakter fenotipik tongkol jagung yaitu meliputi karakter kuantitatif dan kualitatif. Sampel yang digunakan adalah 6 varietas jagung yaitu varietas jagung Octora, Lamuru, Jaya 2, Kumala, Bonanza dan Pulutlokal. Data dianalisis menggunakan rumus rata-rata (mean) dan standar deviasi serta diuji lanjut menggunakan program MVSP (Multivarian Statistical Package). Data diedit dengan program PFE (Program File Editor) dan dendogram dikonstruksi berdasarkan Clustering yang menunjukkan hubungan kekerabatan antar varietas atau hubungan individu antar varietas menggunakan algorithm UPGMA. Indeks similaritas dihitung menggunakan metode Simple Matching Coefficient yang ada pada MVSP. Hasil penelitian menunjukkan bahwa secara kuantitatif dan kualitatif jagung yang dibudidayakan di Jono Oge menunjukkan adanya variasi. Data yang bervariasi antar varietas dan antar individu yang terjadi pada varietas Lamuru dan Pulut lokal diperkuat oleh dukungan indeks similaritas antara 0,65 % - 1%. Kata Kunci: Variasi genetik, jagung, karakter fenotipik
PEMETAAN LEVEL MOTIVASI SISWA TERHADAP PEMBELAJARAN FISIKA BERPENDEKATAN SAINTIFIK Mustofa, Zainul
Jurnal Penelitian Kebijakan Pendidikan Vol 12, No 2 (2019)
Publisher : Balitbang Kemendikbud

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24832/jpkp.v12i2.262

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk memetakan level motivasi siswa terhadap pembelajaran fisika berpendekatan saintifik. Hal ini penting karena motivasi berkorelasi positif dengan pencapaian tujuan pembelajaran. Penelitian ini adalah penelitian survei dengan jumlah responden 24 siswa kelas X di SMK Al Munawwariyyah, Malang pada semester genap tahun pelajaran 2017-2018. Kuisioner terdiri atas 6 domain yaitu physics learning value, active learning strategies, self-efficacy, performance goal, Achievement goal, dan Learning Environment Stimulation. Domain physics learning value menunjukkan bahwa sekitar 75% menyatakan bahwa fisika adalah penting dan bermanfaat bagi kehidupan sehari-hari. Domain active learning strategies menunjukkan bahwa sekitar 50% siswa aktif dalam menghubungkan konsep dengan pengalaman sebelumnya. Domain self-efficacy menunjukkan sekitar 50% berkeyakinan dapat memahami fisika dengan baik, tetapi hanya sekitar 30% yang berkeyakinan mampu menyelesaikan soal fisika dan cenderung menyerah saat bertemu dengan soal yang sulit. Domain performance goal menunjukkan bahwa 50% siswa berusaha aktif agar mendapatkan nilai yang baik, tetapi tidak bertujuan untuk kelihatan lebih baik dari yang lain maupun mendapatkan perhatian dari guru. Domain Achievement goal menunjukkan bahwa sekitar 60% saja yang merasa puas dengan nilai baik, tetapi 96% siswa lebih puas ketika mampu memahami dan memecahkan masalah fisika. Domain Learning Environment Stimulation menunjukkan bahwa lebih dari 60% siswa berpartisipasi aktif di kelas karena guru menggunakan berbagai macam metode, tidak menekan siswa, memfasilitasi siswa untuk aktif dalam setiap kegiatan baik teori maupun praktek. Temuan ini bermanfaat dalam penyusunan pembelajaran fisika lebih lanjut yang mempertimbangankan faktor motivasi agar dapat meningkatkan kualitas pembelajaran di kelas fisika.
PEMETAAN LEVEL MOTIVASI SISWA TERHADAP PEMBELAJARAN FISIKA BERPENDEKATAN SAINTIFIK Mustofa, Zainul
Jurnal Penelitian Kebijakan Pendidikan Vol 12 No 2 (2019)
Publisher : Balitbang Kemendikbud

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24832/jpkp.v12i2.262

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk memetakan level motivasi siswa terhadap pembelajaran fisika berpendekatan saintifik. Hal ini penting karena motivasi berkorelasi positif dengan pencapaian tujuan pembelajaran. Penelitian ini adalah penelitian survei dengan jumlah responden 24 siswa kelas X di SMK Al Munawwariyyah, Malang pada semester genap tahun pelajaran 2017-2018. Kuisioner terdiri atas 6 domain yaitu physics learning value, active learning strategies, self-efficacy, performance goal, Achievement goal, dan Learning Environment Stimulation. Domain physics learning value menunjukkan bahwa sekitar 75% menyatakan bahwa fisika adalah penting dan bermanfaat bagi kehidupan sehari-hari. Domain active learning strategies menunjukkan bahwa sekitar 50% siswa aktif dalam menghubungkan konsep dengan pengalaman sebelumnya. Domain self-efficacy menunjukkan sekitar 50% berkeyakinan dapat memahami fisika dengan baik, tetapi hanya sekitar 30% yang berkeyakinan mampu menyelesaikan soal fisika dan cenderung menyerah saat bertemu dengan soal yang sulit. Domain performance goal menunjukkan bahwa 50% siswa berusaha aktif agar mendapatkan nilai yang baik, tetapi tidak bertujuan untuk kelihatan lebih baik dari yang lain maupun mendapatkan perhatian dari guru. Domain Achievement goal menunjukkan bahwa sekitar 60% saja yang merasa puas dengan nilai baik, tetapi 96% siswa lebih puas ketika mampu memahami dan memecahkan masalah fisika. Domain Learning Environment Stimulation menunjukkan bahwa lebih dari 60% siswa berpartisipasi aktif di kelas karena guru menggunakan berbagai macam metode, tidak menekan siswa, memfasilitasi siswa untuk aktif dalam setiap kegiatan baik teori maupun praktek. Temuan ini bermanfaat dalam penyusunan pembelajaran fisika lebih lanjut yang mempertimbangankan faktor motivasi agar dapat meningkatkan kualitas pembelajaran di kelas fisika.
PEMAHAMAN SISWA TENTANG APLIKASI KONSEP SUHU DAN KALOR YANG BERKAITAN DENGAN KOMPUTER Mustofa, Zainul
Jurnal Pendidikan Fisika Undiksha Vol 11, No 1 (2021)
Publisher : Universitas Pendidikan Ganesha

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.23887/jjpf.v11i1.24501

Abstract

Berbeda dengan level pendidikan menengah lainnya, pembelajaran fisika di SMK Teknik memiliki kewajiban lebih yaitu untuk mengintegrasikan konsep-konsep fisika dalam bidang keahliannya. Tujuan utama penelitian ini adalah untuk mengetahui bagaimana pemahaman siswa terkait aplikasi konsep suhu dan kalor yang berkaitan dengan komputer. Jenis penelitian ini adalah penelitian deskriptif kuantitatif dengan metode studi kasus. Subjek penelitian terdiri atas 36 siswa teknik komputer dan jaringan (TKJ), SMK Al Munawwariyyah Tahun Pelajaran 2018/2019. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebagian besar siswa telah memahami aplikasi konsep suhu dan kalor yang berkaitan dengan komputer lebih dari 80%. Aplikasi konsep yang telah mereka pahami antara lain persamaan kalor dan maknanya, jenis perpindahan kalor dan dampaknya, dan identifikasi permasalahan komputer yang berkaitan dengan kalor (troubleshooting).