Claim Missing Document
Check
Articles

IDENTIFIKASI DAN FILOGENETIKA BAKTERI Aeromonas spp. ISOLAT AIR KOLAM BEBERAPA KOTA BERDASARKAN PADA SIKUEN GEN 16S rRNA Manik, Visi Tinta; Hidayat, Topik; Kusumawaty, Diah
Formica Online Vol 1, No 1 (2014): Formica Online
Publisher : Jurusan Pendidikan Biologi FPMIPA UPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Air dapat menjadi perantara bagi bakteri patogen untuk menginfeksi penyakit, salah satunya adalah bakteri Aeromonas. Bakteri ini merupakan patogen baik pada manusia atau hewan khususnya ikan. Hubungan kekerabatan antara bakteri Aeromonas perlu diketahui untuk mengetahui keanekaragaman dan penyebaran strain di perairan, sehingga dapat digunakan untuk uji kualitas air secara tepat dan cepat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik, dan hubungan filogenetika dari bakteri Aeromonas spp. Dari 44 isolat yang diperoleh dilakukan uji morfologi (pewarnaan Gram), uji biokimia yang meliputi uji RS+Novobiocin, motilitas, oksidasi, OF, indol, VP, sitrat, fermentasi laktosa, deteksi hemolisis, dan deteksi gen lipase. Kemudian 8 isolat terpilih dan dua isolat kontrol disikuensing berdasarkan pada gen 16S rRNA. Pohon filogenetika didapatkan dengan menggunakan Clustal X dan MEGA 5. Hasil yang diperoleh dari pohon filogenetika, bakteri Aeromonas spp. dapat digolongkan menjadi 3 grup yaitu grup pertama terdiri dari lima isolat yang berkelompok sendiri, grup kedua terdiri dari dua isolat yang berdekatan dengan Aeromonas veronii dan kelompok terakhir terdiri dari satu isolat serta dua isolat kontrol berdekatan dengan grup Aeromonas hydrophila. Dari delapan isolat yang ditemukan, Aeromonas spp. merupakan bakteri Gram negative berbentuk basil pendek, bersifat motil, positif uji oksidase, dan OF. Kata kunci : Aeromonas spp., filogenetika, gen 16S rRNA
KERAGAMAN BAKTERI ENDOFIT PADA KULTIVAR NANAS (Ananas comosus (L.) Merr) SIMADU DAN BIASA DI KABUPATEN SUBANG Rachmitasuci, Indri; Hidayat, Topik; Purwianingsih, Widi
Formica Online Vol 1, No 1 (2014): Formica Online
Publisher : Jurusan Pendidikan Biologi FPMIPA UPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Proses pematangan pada buah ditandai dengan adanya perubahan karakteristik buah meliputi warna, aroma, tekstur dan rasa. Perubahan karakteristik buah tersebut salah satunya dipengaruhi oleh bakteri endofit yang dapat hidup berasosiasi dalam jaringan tanaman yang mampu menghasilkan enzim dan hormon tertentu sehingga dapat mengubah sifat kimia yang akan mempengaruhi sifat fisik suatu  buah. Penelitian mengenai bakteri endofit pada buah telah banyak dilakukan, namun bakteri endofit pada buah nanas belum diidentifikasi. Buah nanas kultivar Simadu dan Biasa merupakan buah nanas yang banyak dikonsumsi masyarakat dan diolah sebagai bahan baku industri makanan yang berasal dari Kabupaten Subang. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman jenis bakteri endofit pada kultivar nanas Simadu dan Biasa. Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu metode deskriptif dan Identifikasi bakteri dengan menggunakan karakterisasi morfologi, pewarnaan Gram dan uji biokimiawi. Isolasi bakteri dari kedua kultivar dilakukan dengan teknik pengenceran, yaitu pada seri pengenceran ke- 10-2, 10-3, dan 10-4. Bakteri-bakteri yang ditemukan pada kultivar Simadu diduga mempunyai kemiripan dengan jenis Bacillus sp, Pseudomonas sp, Enterobacter sp, Pediococcus sp, Acinetobacter sp, Lactobacillus sp, Gluconobacter sp dan Acetobacter sp. Sedangkan pada kultivar Biasa ditemukan bakteri yang diduga mempunyai kemiripan dengan jenis Bacillus sp, Pseudomonas sp, Enterobacter sp, Pediococcus sp, Acetobacter sp dan Micrococcus sp. Perbedaan keragaman bakteri pada kedua kultivar tersebut diikuti dengan perbedaan hasil uji organoleptik bahwa warna, rasa, aroma dan tekstur pada nanas Simadu lebih baik dibandingkan dengan nanas Biasa. Hal tersebut menunjukkan bahwa perbedaan bakteri endofit yang terdapat pada setiap kultivar diduga mempengaruhi karakteristik buah nanas (warna, rasa, aroma dan tekstur). Kata kunci : Nanas, Bakteri Endofit, Karakteristik buah
EKSTRAKSI DNA BAKTERI ENDOFIT SECARA LANGSUNG DARI AKAR Vetiveria zizanioides L. Anugrah, Fauzi Akbar; Fitriani, Any; Hidayat, Topik
Formica Online Vol 1, No 1 (2014): Formica Online
Publisher : Jurusan Pendidikan Biologi FPMIPA UPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Identifikasi potensi dari mikroorganisme endofit dapat dilakukan dengan analisa genetik dan analisis keragaman gen. Tingkat kemurnian yang baik dari isolasi DNA secara langsung diperlukan untuk mempelajari mikroorganisme dari sampel alam. Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan isolasi DNA bakteri endofit pada akar tanaman Vetiveria zizanioides, L. tanpa tahap pengkulturan. Dalam isolasi DNA secara langsung dilakukan beberapa tahapan diantaranya sterilisasi permukaan, ekstraksi dan pengukuran kualitas dan kuantitas hasil isolasi DNA. Ekstraksi DNA secara langsung pada bakteri endofit dari akar Vetiveria zizaniodes, L.telah berhasil dilakukan dengan tingkat kemurnian mencapai 1,798 dengan konsentrasi hingga 780 µg / ml. Kata Kunci :Ekstraksi DNA, Endofit, Vetiveria zizanioides
Analisis Filogenetik Molekuler pada Phyllanthus niruri L. (Euphorbiaceae) Menggunakan Urutan Basa DNA Daerah Internal Transcribed Spacer (ITS) Topik Hidayat; Diah Kusumawaty; Kusdianti Kusdianti; Dian Din Yati; Astry Agusthina Muchtar; Dina Mariana
Jurnal Matematika & Sains Vol 13, No 1 (2008)
Publisher : Institut Teknologi Bandung

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Variation of DNA sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region has been used as a molecular character tounderstand the phylogenetic relationships within different strains of Phyllanthus niruri and with other species belonging tofamily Euphorbiaceae. Phylogenetic analysis of 19 plant samples using parsimony method revealed several findings: as awhole family, Euphorbiaceae is a monophyletic group and the family is divided into two major clades based upon its singleleaf arrangement; genus Phyllanthus is a non-monophyletic group, though species Phyllanthus niruri is a monophyleticgroup; major classification system of Phyllanthus niruri at the molecular level does not support previous majorclassification; Saoropus androgynus is closely related with Phyllanthus niruri.
PENGARUH PENUGASAN FENETIK TERHADAP PENGUASAAN KONSEP KEANEKARAGAMAN TUMBUHAN BIJI Hidayat, Topik; Sutarno, Nono; Awaliyah, Rini Nuroni
Jurnal Pengajaran Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Vol 17, No 2 (2012): Jurnal Pengajaran MIPA
Publisher : Faculty of Mathematics and Science Education, Universitas Pendidikan Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.18269/jpmipa.v17i2.247

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peningkatan penguasaan konsep siswa MA kelas X setelah digunakannya penugasan fenetik melalui lembar kerja siswa. Metode penelitian yang digunakan adalah weak experiment dengan desain penelitian One-Group Pretest-Posttest Design. Data peningkatan penguasaan konsep siswa diperoleh melalui selisih atau gain skor posstest dan pretest, yang kemudian dihitung gain ternormalisasinya. Respon siswa dan guru tentang penggunaan penugasan fenetik melalui LKS dijaring melalui angket siswa dan wawancara guru. Sampel penelitian adalah kelas X-A di Madrasah Aliyah Darul Arqam Garut tahun pelajaran 2009/2010. Hasil penelitian menunjukan bahwa terdapat pengaruh penugasan fenetik melalui LKS terhadap penguasaan konsep pada keanekaragaman hayati yang diketahui dengan adanya peningkatan penguasaan konsep dengan nilai gain ternormalisasi 0,306 yang berkategori sedang.Kata kunci: metode penugasan, fenetik, lembar kerja siswa, penguasaan konsep, tumbuhan biji
PROFIL KETERAMPILAN BERKOMUNIKASI SISWA SMA MENGGUNAKAN METODE FENETIK DALAM PEMBELAJARAN KLASIFIKASI ARTHROPODA Oktaviani, Feni; Hidayat, Topik
Jurnal Pengajaran Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Vol 15, No 1 (2010): Jurnal Pengajaran MIPA
Publisher : Faculty of Mathematics and Science Education, Universitas Pendidikan Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.18269/jpmipa.v15i1.288

Abstract

We conducted a research about communication skill of secondary biology student in Arthropode classification using phenetic method. Data were obtained from written report and oral presentation. There were five indicators used to analyze communication skill in oral presentation, which included their ability to express opinion themselves and hearing the opinion from other, their ability to master the concept to be presented, their ability to communicate of results systematically and clearly, their ability to question, and their ability to answer. Five indicators used in written report were their ability to choose informative character to build fenogram, their ability to undergo step by step, resulted phenogram, their ability to interpret the results, and their ability to make a report. Results showed that communication skill in oral were good enough (63.75%), but low (56.25%) in written. Based on interview, however, students felt comfortable when teacher used the phenetic method to understand classification of Arthropode. This method has markedly stimulated the students to study actively in the classroom.Keywords: arthropode, communication skill, classification, phenetic method,
STUDI KASUS KEWIRAUSAHAAN DISTRO DENGAN PENDEKATAN EKONOMI TEKNIK Suganda, Aditya; Hidayat, Topik; Raharjo, Eko Budi
ENGINEERING Vol 10, No 1 (2015)
Publisher : ENGINEERING

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (370.002 KB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelayakan sebuah usaha distro yang dijalankan oleh penulis, Metode yang digunakan dalam penelitian ini menggunakan metode ekonomi teknik yaitu  menganalisa semua biaya dari modal awal hingga pendapatan dengan menggunakan NPV, AE, PBP, BCR, dan IRR. Hasil penelitian dengan menggunakan metode ekonomi teknik menghasilkan nilai NPV sebesar sebesar Rp. 439.955.627 dan AE sebesar Rp.12.924.107 nilai ini jauh lebih besar dari nol, dengan demikian rencana inevstasi membuka toko / distro pakaian & sepatu ini direkomendasikan layak (feasible) secara ekonomis. Hal ini didukung pula hasil perhitungan dengan metode payback period (PBP) dengan nilai k= 3,565 nilai k ini lebih kecil dari periode investasi yang direncanakan 12 bulan dan diperkuat juga dengan nilai IRR lebih besar dari MARR yaitu 23,37% dengan IRR 18%, hal ini semakin memperkuat bahwa rencana investasi membuka toko / distro pakaian & sepatu inidirekomendasikan untuk diterapkan. Tapi pada metodeBenefit Cost Ratio (BCR) nilai BCR= 3,41 lebih besar dari 1 dan ini menunjukan investasi layak untuk di terapkan.kunci :Kelayakan Usaha Distro, NPV, AE, IRR
THE PHYLOGENETIC POSITION OF THE PAPUASIAN GENUS SARCOCHILUS R.BR. (ORCHIDACEAE: AERIDINAE): EVIDENCE FROM MOLECULAR DATA Hidayat, Topik -; Ito, Motomi -; Yukawa, Tomohisa -
REINWARDTIA Vol 12, No 4 (2008): Vol. 12, No. 4
Publisher : Research Center for Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (330.798 KB) | DOI: 10.14203/reinwardtia.v12i4.55

Abstract

HIDAYAT,T.; ITO, M.; YUKAWA, T. 2008. The phylogenetic position of thePapuasian genus Sarcochilus R.Br.(Orchidaceae: Aeridinae): evidence from molecular data. Reinwardtia 12(4).281 – 284. –– The taxonomic status of the Papuasian orchid genus Sarcochilus R.Br. remains unresolved. Represented by Sarcochilus chrysanthus Schltr.,a phylogenetic analysis to evaluate relationships between the Papuasian species and those from Australia was conducted using molecular characters.Parsimony analysis using DNA sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region showed that this Papuasian species, is in a distant position from the so-called the true Sarcochilus sensu stricto.These results provide additional evidence for the establishment of a new genus Monantochilus.
EVOLUTIONARY ANALYSIS OF POLLINARIA MORPHOLOGY OF SUBTRIBE AERIDINAE (ORCHIDACEAE) Hidayat, Topik
REINWARDTIA Vol 12, No 3 (2006): Vol. 12, No. 3
Publisher : Research Center for Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.14203/reinwardtia.v12i3.65

Abstract

HIDAYAT, TOPIK; YUKAWA, TOMOHISA; ITO, MOTOMI. 2006. Evolutionary analysis of pollinaria morphology of subtribe Aeridinae (Orchidaceae). Reinwardtia 12(3): 223–235.–– Pollinarium is one of the distinct synapomorphies of Orchidaceae. With using characters derived from the pollinarium, phylogenetic relationships among genera of subtribe Aeridinae was examined. Cladistic analysis showed that (1) Subtribe Aeridinae is monophyletic group. (2) Five of six groups constructed in the analysis are consistent with the groups recognized in previous molecular phylogenetic analyses.(3)The genera Cleisostoma and Phalaenopsis are non-monophyletic group.(4) Pollinarium morphology endorses monophyly Trichoglottis and Phalaenopsis alliances. (5) Although transformation of the stipe and viscidium shapes in the subtribe is subjected to parallelism, the results showed that these characters are much useful in determining relationships in the subtribe than those of pollinium.
STUDI KASUS KEWIRAUSAHAAN DISTRO DENGAN PENDEKATAN EKONOMI TEKNIK Suganda, Aditya; Hidayat, Topik; Raharjo, Eko Budi
ENGINEERING Vol 10, No 1 (2015)
Publisher : Universitas Pancasakti Tegal

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (370.002 KB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelayakan sebuah usaha distro yang dijalankan oleh penulis, Metode yang digunakan dalam penelitian ini menggunakan metode ekonomi teknik yaitu  menganalisa semua biaya dari modal awal hingga pendapatan dengan menggunakan NPV, AE, PBP, BCR, dan IRR. Hasil penelitian dengan menggunakan metode ekonomi teknik menghasilkan nilai NPV sebesar sebesar Rp. 439.955.627 dan AE sebesar Rp.12.924.107 nilai ini jauh lebih besar dari nol, dengan demikian rencana inevstasi membuka toko / distro pakaian & sepatu ini direkomendasikan layak (feasible) secara ekonomis. Hal ini didukung pula hasil perhitungan dengan metode payback period (PBP) dengan nilai k= 3,565 nilai k ini lebih kecil dari periode investasi yang direncanakan 12 bulan dan diperkuat juga dengan nilai IRR lebih besar dari MARR yaitu 23,37% dengan IRR 18%, hal ini semakin memperkuat bahwa rencana investasi membuka toko / distro pakaian & sepatu inidirekomendasikan untuk diterapkan. Tapi pada metodeBenefit Cost Ratio (BCR) nilai BCR= 3,41 lebih besar dari 1 dan ini menunjukan investasi layak untuk di terapkan.kunci :Kelayakan Usaha Distro, NPV, AE, IRR
Co-Authors ., sarbino A.A. Ketut Agung Cahyawan W Aa Juhanda Abd. Rasyid Syamsuri Abdull Rahim Mohd Yusoff Adelia Aryani Putri Adhi Yuniarto Adi Pancoro Adi Pancoro Adi Rahmat Adi Rahmat, Topik Hidayat, Adi Rahmat, Aditya Suganda Aditya Suganda, Aditya Adriana Hiariej, Adriana Agus Sutanto Amalianneisha Rafadewi Andhanatami Putri Ana Ratna Wulan Ana Ratna Wulan Any Fitriani Astry Agusthina Muchtar Azmi Aris Bambang Supriatno Dadang Sudirno Damayanti, Elok Dede Salim Nahdi Della Frisca Damayanti Denia Dwi Citra Resmi Dhiyassalam Imam Anshori Ismanto Diah - Kusumawaty Dian Din Yati Diardy Shauman Rachmatan Didik Priyandoko Dina Karina Islami Dina Mariana Dindin Nasrudin Dwi Susilaningsih DWI SUSILANINGSIH Eko Budi Raharjo Eko Budi Raharjo, Eko Budi Fauzi Akbar Anugrah Fawzy Muhammad Bayfurqon Feni Oktaviani FENNY MARTHA DWIVANY Fransisca Sudargo Fransisca Sudargo Tapilouw Fransisca Sudargo Tapilouw Fransisca Sudarto Tapilouw Giasintha Stefani Hafsah Hafsah Hani Susanti Hani Susanti, Hani Helmi Homdijah, Oom Siti Husna Nugrahapraja I Gusti Bagus Wiksuana I NYOMAN RAI Indri Rachmitasuci Ipin Aripin Ipin Aripin Ipin Aripin Iqbal Syaichurrozi Karlia Meitha Kelana, Himalaya Wana Ketut Wikantika Kurniawan, Iwan Setia Kusdianti Kusdianti Kusdianti Kusdianti Kusnadi Kusnadi Lala Septem Riza Lia Lutianasari Lia Lutianasari Mahbubah, Hana Gardena Mahmoud Fahsi Miftakhul Bakhrir Rozaq Khamid Motomi - Ito Motomi - Ito, Motomi - Muhammad Fakhri Basyir Nisrina Sukriandi Nissa Rachmawati Nono Sutarno Nono Sutarno Novi Sofia Fitriasari Nurhayati, Ai Siti Nuryani Rustaman Nuryani Rustaman Nuryani Rustaman Nuryani Rustaman Nuryani Y. Rustaman Nuryani Y. Rustaman Nuryani Yogipratama Rustaman Pisca Hana Marsenda Putri Yunitha Wardiny R. Riandi, R. Rafi Muhammad F Riandi Riandi Rifki Risma Munandar Rini Nuroni Awaliyah Rini Nuroni Awaliyah Rini Solihat Risky Ayu Kristanti Risma Munandar, Rifki Rizky Nadhif Nandana Rosinta Septiana, Rosinta Sa'diatul Fuadiyah Santi Sri Rahayu Prajayanti Sari Lestari Siti Sriyati Sofi Rahmania Solihat, Syifa St E Sururiyatul Muaziyah SUHIRMAN SUHIRMAN Sumiyati Sa'adah Taufik Rahman Tomohisa - Yukawa Tomohisa - Yukawa, Tomohisa - Tony Hadibrata Tyas Farrah Dhiba Visi Tinta Manik Vitta Yaumul Hikmawati Wawan Setiawan Wida Herlina Widi Purwianingsih Win Heri Sarfudin YAYAN SANJAYA Yuyun Maryuningsih Yuyun Maryuningsih Yuyun Maryuningsih Yuyun Maryuningsih