Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2019 - 2024
0.23
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan UNTAN
., Arista Pratiwi
Unknown Affiliation
Health Professions Medicine & Pharmacology

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
OPTIMASI SUHU DESAIN PRIMER GEN BLAZ RESISTENSI PADA BAKTERI Staphylococcus aureus SECARA IN SILICO ., Arista Pratiwi
Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran UNTAN Vol 4, No 1 (2019): Jurnal Farmasi Kalbar
Publisher : Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran UNTAN

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (409.951 KB)

Abstract

Penisilin merupakan antibiotik yang mengalami resistensi terhadap bakteri Staphylococcusaureus. Resistensi ini diperantarai oleh gen yang mengkode beta laktamase yaitu gen blaZ.Pendeteksian resistensi dapat dilakukan dengan metode PCR yang membutuhkan primerberupa sederet sekuens DNA pendek sebagai pengenal DNA target. Tujuan dari penelitianini adalah mendesain primer sebagai bahan utama dalam pendeteksian gen taret, yaitu genblaZ untuk mengurangi angka resistensi. Pengujian secara in silico merupakan salah satumetode yang paling efektif dan efisien dalam merancang suatu primer. Metode yangdigunakan dalam desain primer secara in silico berbasis bioinformatika adalah denganmenggunakan situs NCBI, Primer3Plus, dan OligoAnalyzer. Hasil perancangan primer genblaZ S.aureus diperoleh 10 kandidat primer dari suhu leleh (Tm) optimum 55°C dan 60°C.Primer yang memiliki kriteria primer terbaik untuk deteksi gen blaZ S.aureus adalahprimer 1 yang memiliki urutan basa primer forward ATTTGCCTATGCTTCGACTT danurutan basa primer reverse GCTTGACCACTTTTATCAGC. Kriteria rancangan primeryang dihasilkan yaitu memiliki panjang basa 20 bp, Tm 55,4°C dan 55°C, %GC sebesar40% dan 45%, hairpin dengan nilai ΔG -0,75 dan 1,23 kcal/mol, self dimer dengan nilaiΔG -3,14 kcal/mol, serta hetero dimer dengan nilai ΔG -4,74 kcal/mol.Kata kunci : Desain primer, gen blaZ, resistensi, Penisilin, S.aureus, in silico
Co-Authors