Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : Prosiding University Research Colloquium

Hasil Komputasi Vina untuk Kandungan Bawang Putih dan Adas Bintang Terhadap Protein Dehidrogenase Piruvat Mycobacterium tuberculosis Nur Cholis Endriyatno; Broto Santoso
Prosiding University Research Colloquium Proceeding of The 7th University Research Colloquium 2018: Mahasiswa (student paper presentation)
Publisher : Konsorsium Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat Perguruan Tinggi Muhammadiyah 'Aisyiyah (PTMA) Koordinator Wilayah Jawa Tengah - DIY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (178.431 KB)

Abstract

Tuberculosis merupakan salah satu penyebab kematian terbanyak didunia. Penyakit ini disebabkan oleh Mycobacerium tuberculosis.Inovasi perlu dilakukan melihat potensi tuberculosis multi-drugresistant (TB MDR) yang meningkat. Molecular docking dilakukanterhadap target jalur Pyruvate dehydrogenase (PDH) dengan varianprotein 4MP2 dan 4MP7, senyawa aktif yang digunakan adalahturunan bawang putih (Allium sativum). . Penelitian ini bertujuanuntuk mencari senyawa alam yang dapat menghambat pertumbuhanMycobacterium tuberculosis. Protein dipisahkan dari residu dandiambil unique-ligand (PV1 dan TLA) dari protein tersebutmenggunakan Chimera. Perolehan binding affinity sebagaikuantifikasi interaksi antara protein-ligan dilakukan dengan PyRxmetode Vina Autodock. Visualisasi interaksi ligan-protein dihasilkandengan Protein-ligand Interaction Profiler (PLIP) danPyMol.Senyawa aktif dan ikatan ligan dengan protein adas bintangdengan 4MP2 (kaempferol), bawang putih dengan 4MP2 (quercetin),adas bintang dengan 4MP7(Benzaldoxime), dan bawang putih dengan4MP7 (Benzaldoxime) berturut-turut memiliki binding affinity sebesar-7,4; -5,9; -7,3; dan -5,8 sedangkan ligan native pada 4MP2 dan 4MP7 memiliki binding affinity -4,2 sampai -4,5. Nilai binding affinityyang paling kecil menunjukkan efektifitas sebagai anti tuberkulosis,disimpulkan bahwa dengan adanya kesamaan residu dan nilai bindingaffinity yang kecil senyawa alam dalam adas bintang lebih berpotensidibanding bawang putih, adas bintang dapat dikembangkan menjadisalah satu obat tuberculosis
Hasil Komputasi Vina untuk Kandungan Bawang Putih dan Adas Bintang Terhadap Protein Dehidrogenase Piruvat Mycobacterium tuberculosis Nur Cholis Endriyatno; Broto Santoso
Prosiding University Research Colloquium Proceeding of The 7th University Research Colloquium 2018: Mahasiswa (student paper presentation)
Publisher : Konsorsium Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat Perguruan Tinggi Muhammadiyah 'Aisyiyah (PTMA) Koordinator Wilayah Jawa Tengah - DIY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Tuberculosis merupakan salah satu penyebab kematian terbanyak didunia. Penyakit ini disebabkan oleh Mycobacerium tuberculosis.Inovasi perlu dilakukan melihat potensi tuberculosis multi-drugresistant (TB MDR) yang meningkat. Molecular docking dilakukanterhadap target jalur Pyruvate dehydrogenase (PDH) dengan varianprotein 4MP2 dan 4MP7, senyawa aktif yang digunakan adalahturunan bawang putih (Allium sativum). . Penelitian ini bertujuanuntuk mencari senyawa alam yang dapat menghambat pertumbuhanMycobacterium tuberculosis. Protein dipisahkan dari residu dandiambil unique-ligand (PV1 dan TLA) dari protein tersebutmenggunakan Chimera. Perolehan binding affinity sebagaikuantifikasi interaksi antara protein-ligan dilakukan dengan PyRxmetode Vina Autodock. Visualisasi interaksi ligan-protein dihasilkandengan Protein-ligand Interaction Profiler (PLIP) danPyMol.Senyawa aktif dan ikatan ligan dengan protein adas bintangdengan 4MP2 (kaempferol), bawang putih dengan 4MP2 (quercetin),adas bintang dengan 4MP7(Benzaldoxime), dan bawang putih dengan4MP7 (Benzaldoxime) berturut-turut memiliki binding affinity sebesar-7,4; -5,9; -7,3; dan -5,8 sedangkan ligan native pada 4MP2 dan 4MP7 memiliki binding affinity -4,2 sampai -4,5. Nilai binding affinityyang paling kecil menunjukkan efektifitas sebagai anti tuberkulosis,disimpulkan bahwa dengan adanya kesamaan residu dan nilai bindingaffinity yang kecil senyawa alam dalam adas bintang lebih berpotensidibanding bawang putih, adas bintang dapat dikembangkan menjadisalah satu obat tuberculosis