JBIO: jurnal biosains (the journal of biosciences)
Vol 6, No 3 (2020): Jurnal Biosains

DNA BARCODING EDELWEISS (Anaphalis longifolia) ASAL SUMATERA UTARA MENGGUNAKAN SEKUEN GEN maturase K

Eko Prasetya (Department of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas Negeri Medan, Jl. Willem Iskandar, Pasar V, Medan Estate, Medan, 20221, North Sumatera, Indonesia)
Hary Prakasa (Department of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas Negeri Medan, Jl. Willem Iskandar, Pasar V, Medan Estate, Medan, 20221, North Sumatera, Indonesia)
Miftahul Jannah (Department of Biology, Faculty of Sciences and Technology, Islamic University of As-syafiiyah, Jl. Jatiwaringin Raya, No 12, East Jakarta, Indonesia)
Yuanita Rachmawati (Department of Biology, Faculty of Sciences and Technology, Islamic State University Sunan Ampel Surabaya, Jl. Ahmad Yani 117 Surabaya, East Java, Indonesia)



Article Info

Publish Date
28 Jan 2021

Abstract

Anaphalis longifolia merupakan anggota dari family Asteraceae yang tersebar di dataran tinggi Eropa, Amerika, hingga Asia. Penelitian tentang tanaman ini masih terbatas pada studi habitat, sedangkan penelitian terkait identifikasi molekuler masih belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis DNA barcode dari A. longifolia menggunakan sekuen matK gene. Sampel yang diperoleh dari Sumatera Utara kemudian di Isolasi DNA, di amplifikasi menggunakan primer spesifik, lalu disequencing. Hasil sequencing dianalisis menggunakan program Molecular Evolution Genetics Analysis (MEGA) Version X. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sekuen matK gen berhasil diamplifikasi pada panjang 800-850 kb. Hasil analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa sekuen matK gene dapat mengelompokkan A. longifolia. Pada sekuen matK gene A. longifolia, AT content lebih tinggi dibandingkan dengan GC conten. Jarak genetik yang diperoleh berkisar 0-0.0014. Hasil analisis alignment sekuen matK gene menunjukkan terdapat 1521 karakter yang dapat diamati, 1403 karakter conserved site, 118 karakter variable site, 9 karakter parsimony informative site, dan 7 karakter single nucleotide polymorphism (SNP) site. Sekuen matK gene dapat digunakan sebagai DNA barcoding untuk mengidentifikasi A. longifolia. Hasil penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi penting dalam konservasi A. longifolia.

Copyrights © 2020






Journal Info

Abbrev

biosains

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Immunology & microbiology Medicine & Pharmacology

Description

Jurnal Biosains (JBIO) features works of exceptional significance, originality, and relevance in all areas of biological science, from molecules to ecosystems, (ie genetic, microbiology, ecology, biosystematic, biostatistic) including works at the interface of other disciplines, such as chemistry, ...