ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia
Vol 19, No 1 (2023): March

Studi In Silico Aktivitas Senyawa Steroid Terhadap Antikanker Payudara Menggunakan Estrogen Alfa (ER-α)

Nurlelasari Nurlelasari (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Almas Widyana (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Euis Julaeha (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Ari Hardianto (Laboratorium Kimia Analitik dan Pemisahan, FMIPA Universitas Padjadjaran Jalan Raya Jatinangor, Sumedang, Jawa Barat 45363 Indonesia)
Desi Harneti Putri Huspa (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Rani Maharani (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran Laboratorium Sentral, Universitas Padjadjaran)
Tri Mayanti (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Darwati Darwati (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran)
Muhammad Hanafi (Pusat Riset Kimia BRIN Gd. 452 Bldg, Jalan Puspitek Serpong Gate, Muncul, Serpong, Tangerang Selatan, Banten 15314 Indonesia)
Unang Supratman (Laboratorium Kimia Organik Bahan Alam dan Sintesis, Departemen Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Padjadjaran Laboratorium Sentral, Universitas Padjadjaran)



Article Info

Publish Date
23 Mar 2023

Abstract

Kanker payudara merupakan penyebab kedua terbanyak kematian pada wanita akibat kanker setelah kanker paru-paru di seluruh dunia. Steroid merupakan kelompok senyawa aktif yang diantaranya berhasil diisolasi dari genus Chisocheton yang dilaporkan memiliki aktivitas melawan sel kanker payudara MCF-7. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui interaksi senyawa steroid terhadap estrogen alfa (ER-α) melalui metode in silico, yaitu penambatan molekul. Pemodelan struktur tiga dimensi (3D) senyawa steroid dilakukan dengan memperhatikan keadaan terprotonasinya pada pH 7,4. Metode in silico divalidasi melalui penambatan ulang struktur kristal ER-α, hingga diperoleh nilai RMSD < 2 Å, dengan program AutoDock 4.2.6. Dengan program yang sama, senyawa-senyawa steroid ditapis dengan metode penambatan molekul. Hasil penapisan menghasilkan nilai energi bebas dari kedua senyawa steroid yaitu -10,08 kkal/mol (7α-hidroksi-β-sitosterol) dan -10,75 kkal/mol (stigmast-5-en-3β-ol), yang nilainya lebih baik dari estradiol (-9,62 kkal/mol), sebagai ligan alami ER-α. Kedua senyawa ini berpotensi untuk menginhibisi estrogen alfa, dimana senyawa stigmast-5-en-3β-ol memiliki potensi yang lebih besar karena nilai energi bebasnya lebih rendah. Hal ini menandakan bahwa modifikasi struktur senyawa mampu mengubah nilai energi ikatan dan interaksi antara ligan dan reseptor.In Silico Study of Steroid Compound Activity Against Breast Cancer Using Estrogen Alpha (ER-α). Breast cancer is the second worldwide leading cause of cancer death in women after lung cancer. Steroids are a group of active compounds isolated from the Chisocheton genus that has activity against MCF-7 breast cancer cells. This study aimed to determine the interaction activity of steroid compounds against alpha estrogen receptor (ER-α) through in silico method specifically mlecular docking. The modeling of the three-dimensional structure (3D) of steroid compounds was performed by considering their protonation states at pH 7.4. The in silico method was validated by redocking the crystal structure of ER-α until obtaining an RMSD value < 2 Å, using the AutoDock 4.2.6 program. Steroids compounds were screened with the same program namely the molecular docking method. Screening results show that the free energy values of the steroid compounds were -10.08 kcal/mol (7α-hydroxy-β-sitosterol) and -10.75 kcal/mol (stigmast-5-en-3β-ol), which are stronger than estradiol (-9.62 kcal/mol) as native ligand of ER-α. Both of these compounds can inhibit the alpha estrogen receptor, in which the stigmast-5-en-3β-ol compound has a greater potential because of its lower free energy value. This finding indicates that modification of the compound's structure could change the binding energy value and interaction between ligands and receptors.

Copyrights © 2023






Journal Info

Abbrev

alchemy

Publisher

Subject

Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Energy Environmental Science Materials Science & Nanotechnology

Description

ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia is a chemistry journal published by Sebelas Maret University, Surakarta. ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia publishes original research articles or review articles in organic chemistry, inorganic chemistry, analytical chemistry, physical chemistry, biochemistry, and ...