Jurnal Cendekia diterbitkan dua kali setahun (edisi Juni dan Desember), oleh Tim Jurnal STAI Hasan Jufri Bawean dengan open journal system (OJS). Jurnal Cendekia merupakan jurnal ilmiyah yang mempublikasikan hasil-hasil penelitian dalam bidang studi keislaman meliputi pendidikan, hukum, ekonomi, dan pemikiran islam, serta kajian islam lainnya.