Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2019 - 2024
2.223
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Microbiology Indonesia Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Jurnal Penelitian Pertanian Terapan Jurnal Aplikasi Teknologi Pangan MITRA: Jurnal Pemberdayaan Masyarakat TEKNOLOGI PANGAN : Media Informasi dan Komunikasi Ilmiah Teknologi Pertanian Jurnal Bakti Masyarakat Indonesia
Tati Barus
Atma Jaya Catholic University Of Indonesia, Jakarta 12930
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Humanities Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Earth & Planetary Sciences Economics, Econometrics & Finance Education Electrical & Electronics Engineering Engineering Immunology & microbiology Medicine & Pharmacology Public Health Social Sciences Other

Published : 30 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 30 Documents
Search

 1   2   3 
Optimasi Isolasi Genom untuk Analisis Keragaman Mikrob pada Fermentasi Singkong "Peyem" dengan Teknik Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) Barus, Tati
Biota Biota Volume 18 Nomor 1 Tahun 2013
Publisher : PBI Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (294.622 KB)

Abstract

"Peyem" merupakan salah satu pangan fermentasi Indonesia. Kualitas pangan fermentasi bergantung pada aktivitas mikrob yang terdapat selama proses fermentasi berlangsung. Salah satu teknik molekuler yang telah banyak digunakan untuk menganalisis komunitas mikrob pada suatu habitat adalah teknik Terminal–Restriction Fragment Lenght Polymorphism (T-RFLP). Metode isolasi genom dan jenis primer yang digunakan pada saat PCR penting pada teknik T- RFLP dalam mengkaji komunitas mikrob. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan empat metode isolasi genom dan membandingkan penggunaan dua set primer dalam mengkaji komunitas bakteri dari "Peyem" dengan teknik T-RFLP. Genom komunitas bakteri diisolasi dengan menggunakan empat metode, yaitu: 1) QIAamp DNA Stool Mini Kit (G1), 2) QIAamp DNA Stool Mini Kit + lisozim (G2), 3) Genomic DNA Purification Kit (G3), dan 4) Genomic DNA Purification Kit + lisozim (G4). Untuk mengamplifikasi 16S rDNA digunakan dua set primer, yaitu: 1) primer 27F-FAM dan 1492R, 2) primer 63F-FAM dan 1387R. Hasil penelitian menunjukkan isolasi genom dengan metode G4 menghasilkan konsentrasi genom tertinggi (330,20 ng/µl) dibandingkan metode G1, G2, dan G3 (163,50 ng/µl; 183,25 ng/µl, dan 260,80 ng/µl). Primer 27F-FAM menghasilkan jumlah peak yang lebih tertinggi (264) dibandingkan dengan primer 63F-FAM (177). Jumlah peak TRF pada teknik TRFLP menggambarkan keragaman komunitas mikrob. Dengan demikian isolasi genom dengan Genomic DNA Purification Kit + lysozyme dan penggunaan pasangan primer 27F-FAM-1492R adalah yang terbaik untuk menganalisis komunitas bakteri dari "Peyem" dengan teknik T-RFLP.Kata kunci: Genom, Primer, T-RFLP, Mikrob, "Peyem"
Identifikasi dan Keragaman Genetik Bakteri Asam Laktat dari Tapai Singkong berdasarkan Sekuen Gen 16S rRNA Bibiana Wid, Tati Barus* Saint Chalista
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 2, No 2 (2017): June 2017
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (253.576 KB) | DOI: 10.24002/biota.v2i2.1656

Abstract

Bakteri asam laktat (BAL) adalah kelompok bakteri gram-positif yang tidak membentuk spora dan dapat memfermentasikan karbohidrat untuk menghasilkan asam laktat. BAL berperan penting pada fermentasi bahan pangan dan penting bagi kesehatan. Tapai merupakan salah satu jenis pangan fermentasi tradisional Indonesia yang mengandung BAL. Namun, informasi tentang BAL dari Tapai masih terbatas. Oleh karena itu, tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi dan mengkaji keragaman genetik BAL pada Tapai berdasarkan sekuen gen 16S ribosomal ribonucleic acid (rRNA). Media DeMan Rogosa and Sharp Agar (MRSA) digunakan untuk menumbuhkan BAL. Pasangan primer 63f dan 1387r digunakan untuk mengamplifikasi sekuen gen 16S rRNA. Sebayak 31 isolat BAL telah berhasil diisolasi. Berdasarkan sekuen gen 16S rRNA, 31 isolat BAL tersebut terdiri atas Lactobacillus fermentum (21 isolat), Weissella cibaria (3 isolat), W. confusa (6 isolat), dan W. paramesenteroides (1 isolat) dengan similaritas 95%-100%. Pohon filogenetik yang dikonstruksi berdasarkan sekuen gen 16S rRNA dapat menunjukkan hubungan keragaman BAL hingga tingkat spesies, namun tidak dapat membedakan hingga tingkat strain.
Optimasi Isolasi Genom untuk Analisis Keragaman Mikrob pada Fermentasi Singkong "Peyem" dengan Teknik Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) Barus, Tati
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 18, No 1 (2013): February 2013
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (294.622 KB) | DOI: 10.24002/biota.v18i1.262

Abstract

"Peyem" merupakan salah satu pangan fermentasi Indonesia. Kualitas pangan fermentasi bergantung pada aktivitas mikrob yang terdapat selama proses fermentasi berlangsung. Salah satu teknik molekuler yang telah banyak digunakan untuk menganalisis komunitas mikrob pada suatu habitat adalah teknik Terminal–Restriction Fragment Lenght Polymorphism (T-RFLP). Metode isolasi genom dan jenis primer yang digunakan pada saat PCR penting pada teknik T- RFLP dalam mengkaji komunitas mikrob. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan empat metode isolasi genom dan membandingkan penggunaan dua set primer dalam mengkaji komunitas bakteri dari "Peyem" dengan teknik T-RFLP. Genom komunitas bakteri diisolasi dengan menggunakan empat metode, yaitu: 1) QIAamp DNA Stool Mini Kit (G1), 2) QIAamp DNA Stool Mini Kit + lisozim (G2), 3) Genomic DNA Purification Kit (G3), dan 4) Genomic DNA Purification Kit + lisozim (G4). Untuk mengamplifikasi 16S rDNA digunakan dua set primer, yaitu: 1) primer 27F-FAM dan 1492R, 2) primer 63F-FAM dan 1387R. Hasil penelitian menunjukkan isolasi genom dengan metode G4 menghasilkan konsentrasi genom tertinggi (330,20 ng/µl) dibandingkan metode G1, G2, dan G3 (163,50 ng/µl; 183,25 ng/µl, dan 260,80 ng/µl). Primer 27F-FAM menghasilkan jumlah peak yang lebih tertinggi (264) dibandingkan dengan primer 63F-FAM (177). Jumlah peak TRF pada teknik TRFLP menggambarkan keragaman komunitas mikrob. Dengan demikian isolasi genom dengan Genomic DNA Purification Kit + lysozyme dan penggunaan pasangan primer 27F-FAM-1492R adalah yang terbaik untuk menganalisis komunitas bakteri dari "Peyem" dengan teknik T-RFLP.Kata kunci: Genom, Primer, T-RFLP, Mikrob, "Peyem"
Mikrobiota Dominan dan Perannya dalam Cita Rasa Tape Singkong Barus, Tati; Natalia Wijaya, Lydia
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 16, No 2 (2011): June 2011
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (200.982 KB) | DOI: 10.24002/biota.v16i2.119

Abstract

Tape singkong adalah jenis pangan fermentasi traditional Indonesia. Kualitasnya ditentukan oleh mikrob. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menginvestigasi mikrob dominan dan mengkaji peranan mikrob tersebut terhadap cita rasa tape singkong. Analisis mikrob dilakukan terhadap tape singkong yang diperoleh dari Jakarta. Identifikasi khamir dilakukan berdasarkan sekuen daerah ITS rDNA, dan identifikasi bakteri berdasarkan sekuen gen 16S rRNA. Kelimpahan khamir ditemukan sekitar 10 7 CFU/g yang terdiri atas Saccharomyces cereviceae dan Pichia jadini. Bakteri yang dominan ditemukan Bacillus subtilis, Lactobacillus plantarum, dan Pseudomonas fragi. Masing-masing dengan kelimpahan 10 8 CFU/g. Tape singkong telah diproduksi menggunakan S. cereviceae (KO), S. cereviceae + B. subtilis (K1), S. cereviceae + L. plantarum (K2), dan S. cereviceae + P. fragi (K3). Produksi tape singkong menggunakan S. cereviceae (KO) memiliki kualitas paling rendah karena teksturnya keras, tidak beraroma, tidak manis, sehingga tidak memiliki karakteristik tape singkong secara umum. Tape singkong yang diproduksi menggunakan S. cereviceae + B. subtilis (K1) paling menguntungkan karena rasanya manis, aroma alkoholnya tidak terlalu tajam, dan tekstur lembut sehingga merupakan jenis tape singkong yang paling disenangi oleh panelis.
Analisis Matagenom Komunitas Bakteri Tempe dengan Teknik Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) Barus, Tati; Griselda, Griselda; Suwanto, Antonius; Agustina, Tan Watumesa
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 15, No 2 (2010): June 2010
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (342.198 KB) | DOI: 10.24002/biota.v15i2.2726

Abstract

Bacteria have an important role in tempe fermentation in Indonesia, aside of Rhizopus oligosporus as the dominant microbe. In this study the molecular aspect of bacterial diversity in tempe were analyzed using a fingerprinting technique, Terminal-Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP). This study was aimed to examine the diversity of bacterial community during tempe making. Bacterial diversity analysis was conducted in the first hour and the thirteenth hour after the soybean soaked while the fresh tempe was analysed at one to two hours after the fermentation ended. T-RFLP can be used to describe the diversity of bacterial community during the fermentation of tempe. T-RFLP profiles revealed the presence of 24, 30 and 33 bacterial phylotypes in the first hour and the thirteenth hour after the soybean soaked as well as in fresh tempe samples. The phylotypes were dominated by unculturable bacteria group. Only several bacterial phylotypes were consistenly identified since the beginning to the end of fermentation, while most of them were only identified at certain phases along with the environmental changes (i.e: pH) that occured during the fermentation process. One of the consistently identified groups belongs to Bacillus genera.
PELATIHAN MEMBUAT TAHU YANG SEHAT PADA WKRI PAROKI ST. MARIA FATIMA, SENTUL CITY, BOGOR Barus, Tati; Wulandari, Yasinta Ratna Esti; Hutagalung, Rory Anthony; Gunawan, Agustin Wydia
Jurnal Bakti Masyarakat Indonesia Vol 2, No 1 (2019): Jurnal Bakti Masyarakat Indonesia
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat, Universitas Tarumanagara

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (911.607 KB) | DOI: 10.24912/jbmi.v2i1.4339

Abstract

Tahu merupakan makanan tradisional Indonesia yang memiliki banyak keunggulan sebagai bahan pangan dan prosespembuatannya sangat sederhana. Namun demikian, pengetahuan masyarakat tentang tahu dan cara membuat tahu yangsehat masih rendah. Oleh sebab itu, pengabdian pada masyarakat ini bertujuan untuk meningkatkan pengetahuanmasyarakat tentang tahu sebagai makanan yang sehat dan cara pembuatan nya. Kegiatan pengabdian dilakukan padawarga WKRI Paroki St. Maria Fatima, Sentul City, Bogor 16810 dengan menggunakan metode penyuluhan,demonstrasi, dan pendampingan. Monitoring dilakukan untuk mengukur tingkat keberhasilan peserta dalammemproduksi tahu sehat. Persepsi peserta tentang tahu dievaluasi melalui metode survei dan peningkatan pengetahuandiukur melalui test (pretest dan post test). Hasil penyuluhan, demonstrasi, dan pendampingan berhasil meningkatkanketerampilan peserta yang terlihat dari keberhasilan peserta dalam mengikuti prosedur pembuatan tahu. Hasil tersebutjuga diperkuat oleh hasil monitoring dimana seluruh peserta berhasil membuat tahu yang sehat. Hasil surveimenunjukkan peningkatan pengetahuan peserta tentang tahu sehat dan peningkatan motivasi peserta dalammemproduksi tahu sehat secara mandiri. Penilaian peserta tentang jalannya kegiatan pengabdian sangat baik terutamadalam meningkatkan pengetahuan (89% menyatakan sangat setuju dan sisanya setuju). Kemampuan fasilitator dalammenyampaikan materi juga dinilai baik oleh peserta (53% menyatakan sangat setuju dan sisanya setuju). Sebagaitindak lanjut peserta menyatakan bahwa mereka akan membagikan pengetahuan kepada teman dan keluarga. Salahsatu bukti nyata dari keberhasilan pelatihan ini ialah salah satu peserta yang menjadi pengusaha tahu.
Identifikasi Bakteri yang Berperan dalam Pengasaman Kedelai dalam Fermentasi Tempe Berdasarkan Sekuen 16S rDNA Barus, Tati; Widyah, Widyah; Wicaksono, Wisnu Adi; Prasasty, Vivitri Dewi
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 6, No 2 (2021): June 2021
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24002/biota.v6i2.4029

Abstract

Proses fermentasi dalam pembuatan tempe di Indonesia terdiri atas dua tahap. Tahap pertama berupa perendaman kedelai untuk pengasaman kedelai yang penting bagi pertumbuhan kapang. Dalam tahapan ini jenis mikroba yang berperan adalah kelompok bakteri. Namun informasi tentang jenis bakteri tersebut masih terbatas. Oleh sebab itu penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis jenis bakteri yang berperan dalam proses pengasaman kedelai saat fermentasi tempe. Isolasi bakteri dilakukan dari tempe yang diambil langsung dari pengrajin tempe di Jakarta. Bakteri ditumbuhkan pada media Plate Count Agar, de Man Rogosa and Sharpe Agar, MacConkey Agar dan Eosin Methylene Blue Agar. Selanjutnya diuji perannya dalam pengasaman kedelai dengan pengukuran pH air rendaman kedelai dan selanjutnya bakteri tersebut diidentifikasi. Ditemukan isolat P211, P3a, Mc4b, B1p, dan Man2b berperan dalam pengasaman dengan menurunkan pH air rendaman kedelai dari 7 menjadi sekitar 4,7 hingga 5,8. Identifikasi berdasarkan sekuen 16S rDNA lima bakteri tersebut masing masing adalah Klebsiella pneumoniae, Enterobacter ludwigii, Enterobacter sp., Lactobacillus agilis, dan Pantoea sp.  dengan kemiripan 98-100%. Selanjutnya, perlu diteliti tentang perannya dalam menentukan kualitas tempe.
Diversity of Amylase-Producing Bacillus spp. from “Tape” (Fermented Cassava) TATI BARUS; AMANDA KRISTANI; ADI YULANDI
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 20 No. 2 (2013): June 2013
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (58.662 KB) | DOI: 10.4308/hjb.20.2.94

Abstract

Fermented cassava or “Tape” is one of traditional Indonesian fermented food. The quality of “Tape” is determined by microorganisms involved during fermentation process. It was reported that Bacillus subtilis determined the quality of cassava “Tape”. The most common way to identify species is by using 16S rRNA gene.  This gene contains conserved regions as unique sequence which is relative among species. It has been widely used as a reliable molecular marker for phylogeny identification. Therefore, the aim of this research was to study diversity of amylase-producing Bacillus spp. from “Tape” based on 16S rRNA gene sequences. Bacillus spp. were isolated from “Tape” from several area in Indonesia i.e. Jakarta, Bandung, Cianjur, Subang, Rangkas Bitung, and Kediri. Amplification of 16S rRNA gene used 63f and 1387r primers. This research showed that based on 16S rRNA gene sequences, twenty-six of amylase-producing Bacillus spp. isolates were divided into four groups. All isolates were identified as species either B. megaterium, B. subtilis, B. amyloliquefaciens, or B. thuringiensis.
Genetic Diversity of Klebsiella spp. Isolated from Tempe based on Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) TATI BARUS; IVAN HANJAYA; JOANITA SADELI; BIBIANA W LAY; ANTONIUS SUWANTO; ADI YULANDI
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 20 No. 4 (2013): December 2013
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (625.021 KB) | DOI: 10.4308/hjb.20.4.171-176

Abstract

Tempe is an Indonesian fermented food prepared by fermenting dehulled cooked soybeans with Rhizopus oligosporus. Many types of bacteria are also involved during tempe fermentation, and one of these is Klebsiella spp.  Some isolates of K.  pneumoniae produces vitamin B12 in tempe but it has also been classified as an opportunistic pathogen. For this reason Klebsiella spp. in tempe is important to be studied. The aim of this study was to investigate the genetic diversity of Klebsiella spp. from tempe employing ERIC-PCR method. Sixty-one isolates of Klebsiella have been isolated from sixteen tempe producers  in Bogor, Jakarta, Malang, Tengerang, Bandung and Cianjur. 63F and 1387R primers were used to amplify 16S rDNA sequences, and 1R and 1F primers were used for ERIC analysis. The results of this research showed that sixty-one strains of Klebsiella were clustered into 17 groups. Based on ERIC-PCR analysis, isolates of Klebsiella could be grouped into different profiles which some of these groups consisted of isolates with identical ERIC-PCR profiles. Several identical ERIC-PCR profiles were found in tempe from the same producer. There was no correlation observed between genetic similarity  among isolates with the origin of tempe.
Diversity of Protease-Producing Bacillus spp. From Fresh Indonesian Tempeh Based on 16S rRNA Gene Sequence Tati Barus; Linda Wati; . Melani; Antonius Suwanto; . Yogiara
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 24 No. 1 (2017): January 2017
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (841.094 KB) | DOI: 10.4308/hjb.24.1.35

Abstract

Tempeh is a type of traditional fermented food in Indonesia. The fermentation can be performed by Rhizopus microsporus as a main microorganism. However, Bacillus spp. is found in abundance in tempeh production. Nevertheless, information regarding the diversity of Bacillus spp. in tempeh production has not been reported yet. Therefore, the aim of this investigation was to study the genetic diversity of Bacillus spp. in tempeh production based on the 16S ribosomal RNA sequence. In this study, about 22 of 24 fresh tempeh from Jakarta, Bogor, and Tangerang were used. A total of 52 protease-producing Bacillus spp. isolates were obtained. Based on 16S ribosomal RNA results, all 52 isolates were identified to be similar to B. pumilus, B. subtilis, B. megaterium, B. licheniformis, B. cereus, B. thuringiensis, B. amyloliquefaciens, Brevibacillus brevis, and Bacillus sp. All the identified isolates were divided into two large clusters: 1) a cluster of B. cereus, B. thuringiensis, Bacillus sp., and B. brevis and 2) a cluster of B. pumilus, B. subtilis, B. megaterium, B. licheniformis, and B. amyloliquefaciens. Information about the Bacillus spp. role in determining the quality of tempeh has not been reported and this is a preliminary study of Bacillus spp. from tempeh.
Co-Authors . Melani ADI YULANDI Agustin Wydia Gunawan Alfonsus Samuel Satya Pradipta AMANDA KRISTANI Anastasi Tatik Hartanti Anastasia Tatik Hartanti ANTONIUS SUWANTO Antonius Suwanto dan Meity S. Sinaga . Budi Tjahjono Andi Khaeruni R Aris Tri Wahyudi Bibiana W Lay BIBIANA W LAY Bibiana Widiyati Lay C Hanny Wijaya Cynthia Angela David Tandjung Dika Putri Salim Dionysius Subali EVELINE AYU Fransiska Maya GABRIELA GIOVANIA Griselda Griselda Griselda, Griselda IVAN HANJAYA Jason Wiranata Sanjaya Jazzieca Yokota JOANITA SADELI Joshua Mulyawan Linda Wati Lydia Natalia Wijaya Natalia Wijaya, Lydia QURROTA A’YUN Reza Arif Rahman Rianita Pramitasari Rory Anthony Hutagalung Saint Chalista Tan Watumesa Agustina Vivitri Dewi Prasasty Warjoto, Renna Eliana Wicaksono, Wisnu Adi Widyah Widyah Widyah, Widyah Wisnu Adi Wicaksono Yasinta Ratna Esti Wulandari Yogiara Yogiara