Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2019 - 2024
0
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Rekursif: Jurnal Informatika
Bella Befica Putri
Unknown Affiliation
Computer Science & IT Control & Systems Engineering Electrical & Electronics Engineering

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
Implementasi Metode Wu-Manber Berdasarkan Multi-Pattern Matching dalam Pencarian Kesamaan DNA (Studi kasus : DNA Kanker Hati) Bella Befica Putri; Ernawati Ernawati; Diyah Puspitaningrum
Rekursif: Jurnal Informatika Vol 3, No 2 (2015): Volume 3 Nomor 2 November 2015
Publisher : Universitas Bengkulu

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (505.371 KB) | DOI: 10.33369/rekursif.v3i2.750

Abstract

Pencarian kesamaan DNA berdasarkan single pattern matching dinilai kurang efektif apabila diterapkan untuk mencari banyak pola. Dengan demikian diperlukan aplikasi pencarian kesamaan DNA yang dapat memecahkan pencarian banyak pola dengan algoritma multi pattern matching sehingga dapat menghasilkan kecocokan DNA dengan waktu yang lebih efisien dan efektif. Pada riset ini akan dibangun aplikasi pencarian kesamaan DNA kanker hati menggunakan metode Wu-Manber. Aplikasi pencarian kesamaan DNA kanker hati ini diharapkan dapat memberikan kemudahan dalam menampilkan tingkat kesamaan dari dua buah sekuen DNA kanker hati. Masukan yang digunakan pada penelitian ini adalah barisan DNA yang di peroleh dari National Center for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov)dan memiliki keluaran berupa persentase kesamaan serta eksekusi proses. Dari pengujian yang telah dilakukan, persentase kesamaan yang diperoleh dapat mencapai 85% pada pencarian kesamaan sequence AB073612 dengan sequence AY080393. Semakin besar jumlah pola yang ditemukan dan semakin besar minimum length serta semakin pendek karakter sekuen pola, maka persentase kesamaan akan semakin besar. Kata Kunci: DNA kanker hati, Java, multi pattern matching, sequence alignment, Wu-Manber.
Co-Authors Diyah Puspitaningrum Ernawati Ernawati