Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada
Vol 23, No 2 (2021)

Keragaman Genetik Ikan Uceng (Nemacheilus) di Sungai Wilayah Banyumas Berdasar Sekuen Gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI)

Rima Oktavia Kusuma (Program Studi Akualkultur, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Jendral Soedirman, Purwokerto, Jawa Tengah, Indonesia)
Muhammad Sulaiman Dadiono (Program Studi Akualkultur, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Jendral Soedirman, Purwokerto, Jawa Tengah, Indonesia)
Baruna Kusuma (Program Studi Akualkultur, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Jendral Soedirman, Purwokerto, Jawa Tengah, Indonesia)
Hamdan Syakuri (Program Studi Akualkultur, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Jendral Soedirman, Purwokerto, Jawa Tengah, Indonesia)

Article Info

Publish Date
31 Dec 2021

Abstract

Ikan uceng (Nemacheilus) merupakan ikan endemik yang hidup di perairan sungai wilayah Banyumas. Penangkapan berlebih serta perubahan kualitas lingkungan menyebabkan penurunan populasinya di alam. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies Nemacheilus yang hidup di perairan sungai Banyumas serta melihat keragaman genetiknya. Cytochrome oxidase subunit I (COI) digunakan sebagai marka molekuler, dimana telah terbukti sebagai penanda (barcode) yang universal dan stabil. Ada bagian dari COI yang bersifat variabel sehingga bagus apabila digunakan melihat keragaman genetik. Hasil BLAST menyatakan bahwa sampel keempat stasiun memiliki nilai per indent 99,54-100% dengan spesies Neimacheilus chrysolaimos. Nilai keragaman haplotype (Hd) 0,679, dan nilai keragaman nukleotida 0,00117. Berdasarkan hal tersebut, keragaman haplotype ikan uceng dikategorikan pada tingkat sedang, sedangkan keragaman nukleotida pada tingkat rendah.

Copyrights © 2021




Citation Download
RIS
EndNote, Reference Manager, ProCite
BibTex
Latex, Jabref
Original Source
Download Original
Google Scholar
Check in Google Scholar
Journal Info
Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada
Website

Abbrev

jfs

Publisher

Universitas Gadjah Mada

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Immunology & microbiology

Description

Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada are published to promote a critical review of the various investigative issues of interest in the field of fisheries between the researchers, academics, students and the general public, as a medium for communication, dissemination, and utilization of wider ...