cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
Djoni Hatidja
Contact Email
dhatidja@unsrat.ac.id
Phone
+628124442829
Journal Mail Official
dhatidja@unsrat.ac.id
Editorial Address
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Sam Ratulangi Jl. Kampus Kleak Manado 95115
Location
Kota manado,
Sulawesi utara
INDONESIA
Jurnal Ilmiah Sains
Published by Universitas Sam Ratulangi
ISSN : 14123770     EISSN : 25409840     DOI : https://doi.org/10.35799/jis.v22i2.40961
Core Subject : Science, Education, Agriculture,
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemistry Computer Science & IT Mathematics Physics
Jurnal Ilmiah Sains (Journal of Scientific Sciences) is the Journals Published by Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Sam Ratulangi University. Jurnal Ilmiah Sains Published Twice a Year, i.e April and October. Jurnal Ilmiah Sains  welcomes full research articles in the area of Mathematics and Natural Sciences from the following subject areas: Mathematics Statistics Computer Science Physics Chemistry Biology
Arjuna Subject : Umum - Umum
Articles 12 Documents
 1   2 
Search results for , issue "Volume 17 Nomor 1, April 2017" : 12 Documents clear
EVALUASI TAHAN BANJIR PADI LOKAL SULAWESI UTARA PADA FASE VEGETATIF DENGAN VARIASI WAKTU PERENDAMAN Risky Hiskia Poluan; Ai S. Nio; Feky Recky Mantiri
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (443.921 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.14894

Abstract

ABSTRAK Banjir merupakan salah satu kendala yang menghambat produktivitas padi. Masalah ini dapat diselesaikan dengan beberapa cara, salah satunya dengan strategi adaptasi. Oleh karena itu perlu dilakukan kajian tentang adaptasi banjir khusunya pada padi lokal Sulawesi Utara (Superwin, Burungan, Temo dan Ombong). Penelitian telah dilaksanakan untuk mengakaji pengaruh cekaman banjir terhadap padi lokal Sulawesi Utara pada fase vegetatif. Penelitian ini dilakukan dengan 4 varietas padi lokal Sulawesi Utara (Superwin,  Ombong, Temo dan Burungan) dengan 12 kali ulangan dan perlakuan dilakukan pada saat padi berusia 2 minggu. Perlakuannya yaitu dengan membanjiri tanaman padi yang berusia 2 minggu hingga hari ke-20. Dari hasil penenlitian ini tinggi tanaman dari keempat varietas padi lokal Sulawesi Utara sama-sama menunjukkan pertumbuhan yang baik sehingga bisa dijadikan indikator padi yang tahan banjir. Berdasarkan jumlah daun dari keempat varietas varietas Superwin yang memiliki daun terbanyak dibanding dengan ketiga varietas lainnya, namun secara keseluruhan dari jumlah daun setiap varietas bisa bertahan dalam banjir sehingga bisa dipakai sebagai indikator padi yang tahan banjir. Kata kunci: tinggi tanaman, jumlah daun, padi lokal Sulawesi Utara, fase vegetatif, banjir   EVALUATION OF THE LOCAL FLOOD-RESISTENT RICE NORTH SULAWESI THE VEGETATIVE PHASE WITH THE VARIATION OF IMMERSION TIME ABSTRACT Flood is one of the problems that hinder rice production. This problem can be solved in several way, such as adaptation strategies. It is therefore necessary to study about the adaptation of flooding especially to the local rice of North Sulawesi (Superwin, Burungan, Temo and Ombong). This research has been conducted to assess the effect of flooding stress to the local rice of North Sulawesi on the vegetative phase. This research was conducted by four local rice varieties (i.e., Superwin, Ombong, Temo and Burungan) with 12 repetitions and treatments carried out during 2 weeks old rice. The treatment is to flood the rice plants 2 weeks old up to the 20th day. From this research, plant height for each of four local rice varieties show good growth so it can be used as indicator of flood-resistant rice. Based on the number of leaves of four varieties, Superwin has most leaves compared with the three other varieties, but overall on the number of leaves each variety can survive in flood that could be used as an indicator of flood-resistant rice. Keywords: plant height, leaf numbers, local rice of North Sulawesi, vegetative phase, flood
KOMPOSISI PAKAN TIKUS EKOR PUTIH (Maxomys hellwandii) DI KANDANG Fernandez T. Upa; Saroyo Saroyo; Deidy Y. Katili
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (430.504 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.14900

Abstract

ABSTRAK Tikus ekor putih (Maxomys hellwandii) adalah hewan endemik Sulawesi dengan status konsevasinya yaitu least concern yang keberadaannya masih kurang diperhatikan. Ancaman utama tikus ekor putih adalah perburuan untuk dijual penelitian ini bertujuan untuk menginventarisasi jenis-jenis pakan tikus ekor putih dan porsinya. Penelitian ini dilakukan untuk memberikan informasi tentang komposisi pakan tikus ekor putih sehingga dapat dimanfaatkan dalam upaya konservasi terutama dalam kegiatan penangkaran dengan upaya domestikasi. Metode yang digunakan dalam penelitian ini ialah ad libitum sampling dengan menghitung berat pakan yang dikonsumsi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa komposisi jenis pakan tikus ekor putih terdiri dari: pepaya (51,3%), umbi singkong (15,7%), buah kelapa (15,6%), serangga (belalang) (13,9%),  daun sirih (2,9%),  kulit buah ketapang (0,4%), buah sirih (0,2%), buah beringin (0,1%). Dari hasil penelitian tersebut dapat disimpulkan bahwa tikus ekor putih mengonsumsi buah pepaya lebih dari 50% dari total pakan dan tikus ekor putih bukan spesies herbivora sejati, tetapi cenderung omnivora. Kata kunci: tikus ekor putih (Maxomys hellwandii), endemik, Sulawesi, komposisi pakan COMPOSITION OF FEED WHITE-TAIL RAT (Maxomys hellwandii) IN THE CAGE ABSTRACT White-tailed Rat (Maxomys hellwandii) is an endemic species from Sulawesi with least concern (LC) conservation status. The existence of this species is still less attention. The main threat is hunting White-tailed rats for sale, this research aims to inventory the types of feed and the white rat tail portion. This study was conducted to provide information on the composition of the feed white-tailed rats that can be utilized in conservation efforts, especially in the activities of breeding with domesticated effort. The method used in this study was ad libitum sampling to calculate the weight of feed consumed.From the results obtained that the composition of White-tailed Rat feed types such as: papaya (51.3%), cassava tubers (15.7%), coconuts (15.6%), insects (grasshoppers) (13.9% ), leaf Piper beetle (2.9%), fruit peel Terminalia catappa (0.4%), vine Pieper beetle (0.2%), fruit Ficus sp. (0.1%). From these results it can be concluded that the white-tailed rat eating papaya fruit of more than 50% of the total feed and white-tailed rat is not true herbivorous species, but tend to be omnivorous. Keywords: white-tailed rat (Maxomys hellwandii), endemic to Sulawesi, feed composition
IDENTIFIKASI BAKTERI PADA PEGANGAN ESKALATOR DI SALAH SATU PUSAT PERBELANJAAN DI KOTA MANADO Michelle V. Holderman; Edwin de Queljoe; Sendy B. Rondonuwu
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (268.07 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.14901

Abstract

ABSTRAK Pusat perbelanjaan banyak diminati masyarakat karena mempunyai daya tarik internal dan eksternal. Eskalator pada pusat perbelanjaan dilengkapi dengan pegangan tangan, dengan demikian eskalator dapat menjadi media untuk penjangkitan penyakit yang dapat dengan cepat menyebar karena bakteri pada tangan dapat berpindah ke tangan orang lain apabila memegang pegangan dari eskalator tersebut. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengidentifikasi jenis-jenis bakteri yang terdapat pada pegangan escalator. Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu identifikasi bakteri meliputi pengamatan morfologi dan pewarnaan gram. Berdasarkan hasil penelitian jenis bakteri yang ditemukan yaitu Staphylococcus epidermidis, Stomatococcus sp, Bacillus subtilis. Kata-kata kunci: Pusat perbelanjaan, eskalator, bakteri IDENTIFICATION OF BACTERIA IN HANDRAIL ESCALATOR ON SHOPPING CENTER IN MANADO ABSTRACT Shopping center attracted many people because they have internal and external appeal. Escalators in shopping center equipped with handrails, thus escalator can be a medium for the outbreak of disease can quickly spread because bacteria on the hands can be transferred into other hands when holding the handle of the escalator that. The purpose of this study is to identify the types of bacteria present on escalator handrail. The method used in this research is the identification of bacteria includes observation of morphology and gram stain. Based on the results of the study found that the type of bacteria Staphylococcus epidermidis, Stomatococcus sp, Bacillus subtilis. Kata-kata kunci: Shopping center, escalator, bacteria
PROFIL PENCEMARAN LOGAM BERAT PADA PERAIRAN DAERAH ALIRAN SUNGAI (DAS) GRINDULU PACITAN Titik Wijayanti
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (605.396 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15057

Abstract

PROFIL PENCEMARAN LOGAM BERAT PADA PERAIRAN DAERAH ALIRAN SUNGAI (DAS) GRINDULU PACITAN ABSTRAK Telah dilakukan penelitian untuk mengetahui tingkat pencemaran logam berat pada perairan Daerah Aliran Sungai (DAS) Grindulu, Pacitan. Penelitian dilaksanakan pada bulan September-Oktober 2016. Pengukuran kadar logam berat Merkuri (Hg), Timbal (Pb), Kadmium (Cd), dan Kromium (Cr) sampel air yang diambil daerah hulu, terdiri dari 2 (dua) stasiun, yaitu desa Tumpuk kecamatan Bandar dan desa Tegalombo kecamatan Tegalombo. Pada daerah tengah, terdiri dari 2 stasiun, yaitu di desa Pagutan kecamatan Arjosari dan desa Semanten kecamatan Arjosari. Pada daerah hilir diamati satu stasiun di desa Ploso kecamatan Pacitan. Data yang diperoleh dianalisis anova dan uji lanjut Duncan 5%. Hasil penelitian menunjukkan adanya perbedaan signifikan pada semua stasiun pengambilan sampel terhadap semua logam berat dan terjadi kenaikan kadar mulai dari daerah tengah sampai hilir. Kadar logam berat merkuri (Hg), timbal (Pb) dan kadmium (Cd) di daerah hulu masih di bawah ambang batas, sedangkan pada daerah tengah dan hilir sudah melebihi ambang batas yang ditentukan. Sedangkan pada logam berat kromium valensi 6 (Cr6+), kadar di daerah hulu sampai tengah masih di bawah ambang batas, sedangkan daerah hilir sudah melebihi ambang batas yang ditentukan. Kata kunci: Pencemaran, logam berat, air, Grindulu, Pacitan   HEAVY METALS POLLUTANT PROFILE ON GRINDULU WATERSHED, PACITAN ABSTRACT Research was conducted to
PENGARUH PELARUT TERHADAP KARAKTERISTIK NANOPARTIKEL TITANIUM DIOKSIDA (TiO2) Atik Setyani; Emas Agus Prastyo Wibowo
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (734.107 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15103

Abstract

PENGARUH PELARUT TERHADAP KARAKTERISTIK NANOPARTIKEL TITANIUM DIOKSIDA (TiO2) ABSTRAK Tujuan penelitian ini adalah untuk membandingkan jenis pelarut dalam proses pembentukan nanopartikel titanium dioksida dengan metode sol gel. Hasil karakterisasi dengan X-Ray Diffraction (XRD) menunjukkan bahwa penggunaan pelarut berpengaruh terhadap kristalinitas dan fasa material yang terbentuk. Berdasarkan Joint Committee on Powder Diffraction Standards (JCPDS) card nomor 84-1286 menunjukkan difraktogram nano TiO2 hasil sintesis sebagian besar merupakan fasa anatas. Hal ini terlihat dari nilai 2 teta yang diperoleh yaitu 24,45˚; 47,29˚; 53,18˚; 61,64˚ untuk fasa anatas dan 54,65˚; 74,16˚ untuk fasa rutil. Hanya saja persentase fasa anatas pada nano TiO2 menggunakan pelarut metanol lebih besar jika dibandingkan dengan hasil nano TiO2 dengan pelarut etanol. Berdasarkan perhitungan ukuran partikel nano TiO2 menggunakan persamaan Debye- Scherer didapatkan ukuran nano TiO2 menggunakan metanol sebesar 13.78 nm sedangkan  nano TiO2 menggunakan etanol sebesar 34.26 nm. Kata Kunci: Pelarut, sol-gel, titanium dioksida   EFFECT OF SOLVENTS ON THE CHARACTERITICS OF NANOPARTICLES TITANIUM DIOXIDE (TiO2) ABSTRACTThe purpose of this study was to compare the type of solvent in the process of formation of titanium dioxide nanoparticles with sol gel method. X-Ray Diffraction (XRD) characterization results indicate that the use of solvent effect on crystallinity and phase material formed. Based Joint Committee on Powder Diffraction Standards (JCPDS) 84-1286 card numbers show diffractogram nano TiO2 synthesized largely a anatas phase. This can be seen from a value of 2 theta obtained by the 24,45˚; 47,29˚; 53,18˚; 61,64˚ to phase anatas and 54,65˚; 74,16˚ for rutile phase. Only a small percentage of the nano TiO2 anatase phase using methanol solvent is greater when compared with the results of nano TiO2 with ethanol. Based on the calculation of nano TiO2 particle size using equation Debye- Scherer obtained nanosized TiO2 using methanol amounted to 13.78 nm while the nano TiO2 using ethanol amounted to 34.26 nm. Keywords: Solvent, sol-gel, titanium dioxide
SINTESIS DAN KARAKTERISTIK TiO2 DAN SiO2 SERTA APLIKASINYA TERHADAP KADAR Fe DALAM AIR SUMUR Wening Dwi Prastiwi; Khoironni Devi Maulana; Emas Agus Prastyo Wibowo; Navela Rahma Aji; Atik Setyani
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (503.612 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15220

Abstract

SINTESIS DAN KARAKTERISTIK TiO2 DAN SiO2 SERTA APLIKASINYA TERHADAP KADAR Fe DALAM AIR SUMURABSTRAK Air merupakan kebutuhan yang terpenting dalam kehidupan manusia. Air berperan banyak dalam berbagai kegiatan manusia oleh karena itu kandungan yang ada di air harus bermanfaat bagi manusia. Banyak kandungan yang terdapat di air yang sangat bermanfaat, tetapi bayak juga kandungan air yang mungkin tidak bermanfaat bahkan bahaya jika digunakan oleh manusia, salah satunya yaitu kandungan logam berat terutama Fe (besi).  Sehingga tujuan pada penelitian ini untuk mengetahui penurunan kadar Fe (besi) dalam air sumur yang di lakukan dengan fotokimia dengan TiO2 dan SiO2 serta dapat mengidentifikasi karakteristik dari TiO2 dan SiO2. Sampel yang digunakan yaitu air sumur 300 m dibagi menjadi tiga masing-masing 100 ml dengan perlakuan yang berbeda. Pada sampel 100 ml pertama tidak diberikan perlakuan dan juga penambahan. Sampel 100 ml kedua diperlakukan dengan penambahan SiO2 dan pengadukan selama 1 jam, dan untuk sampel 100 ml ketiga diperlakukan dengan penambahan TiO2 dan pengadukan selama 1 jam. Ketiga sampel dengan perlakuan yang berbeda tersebut di analisis dengan menggunakan AAS (Atomic Absorption Spectroscopy) di Laboratorium Kimia Universitas Negeri Semarang. Hasil penelitian Analisis menggunakan AAS (Atomic Absorption Spectroscopy) menunjukkan hasil kadar Fe meningkat pada saat penambahan SiO2 dan TiO2 terhadap sampel yang tidak mendapatkan perlakuan tambahan. kadar Fe pada sampel yang tanpa penambahan sebanyak 0,206 mg/L, kemudian kadar Fe pada sampel yang ditambahkan SiO2 sebenyak 0,225 mg/L, dan kadar Fe pada sampel dengan penambahan TiO2 sebanyak 0,214 mg/L. Hal ini dikarenakan bentuk TiO2 dan SiO2 berupa suspensi. Kelemahan sistem suspensi ini adalah pemisahan partikel TiO2 memerlukan waktu yang lama dan biaya yang sangat mahal,serta daya tembus sinar sinar UV yang terbatas karena absorbsi yang kuat oleh TiO2 (efek bayangan) dan spesies organik terlarut. Kata Kunci: air sumur, TiO2, SiO2, Logam besi (Fe).  SYNTHESIS AND CHARACTERISTICS OF TiO2 AND SiO2 APPLICATION TOWARD LEVELS OF Fe IN THE WELL WATERABSTRACTWater is the most important need in human life. Also, water has many contributions in many human activities. Therefore, the existing content in the water must be beneficial for human. However, material contained in water may be beneficial yet dangerous for human as well, for instance heavy metals content, especially Fe (iron). The main objective of this study is to determine decreasing levels of Fe (iron) in the well water that is done by photochemical reaction using TiO2 and SiO2, and identify the characteristics of TiO2 and SiO2. Samples of well water used is 300 ml divided into three part, and every part of 100 ml water will be given different treatment. First 100 mL sample is not given any treatment and addition. Second 100 mL samples treated with the addition of SiO2 and stirring for an hour, and the third sample of 100 mL is treated with the addition of TiO2 and stirring for an hour. All of three samples with different treatments are analyzed using AAS (Atomic Absorption Spectroscopy) in the Chemistry Laboratory Semarang State University. The research result of analysis using AAS (Atomic Absorption Spectroscopy) shows Fe content increased as the addition of SiO2 and TiO2 in the samples than the sample without any additional treatment. Fe content in the sample without addition is 0.206 mg/L, while Fe content in the sample with addition of SiO2 is 0.225 mg/L, and Fe content in the sample with the addition of TiO2 is 0.214 mg/L. This caused by the form of TiO2 and SiO2 is a suspension. The weakness of this suspension system is the TiO2 particle separation takes a long time, very expensive, and also limited UV rays penetrating power because of the strong absorption by TiO2 (shadow effect) and may dissolved organic species. Keywords: well water, TiO2, SiO2, metals iron (Fe).
INTERAKSI ANTARA MIKROBIOTA USUS DAN SISTEM KEKEBALAN TUBUH MANUSIA Fitri Elizabrth Br Hasibuan; Beivy Jonathan Kolondam
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (586.343 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15221

Abstract

INTERAKSI ANTARA MIKROBIOTA USUS DAN SISTEM KEKEBALAN TUBUH MANUSIA Fitri Elizabrth Br Hasibuan dan Beivy Jonathan Kolondam ABSTRAK Sejumlah besar mikrobiota yang menghuni sistem pencernaan manusia memiliki peran penting dengan sistem kekebalan tubuh. Mikrobiota ini melaksanakan fungsi penting untuk fisiologi inang. Dalam tubuh manusia terdapat sekitar 10-100 triliun mikrobiota. Jumlah mikrobioma pada manusia paling banyak terdapat di usus, yaitu sekitar 100 triliun sel-sel mikrobiota yang terdiri dari 1.000 spesies berbeda. Mikrobiota adalah seluruh mikroba yang hidup di tubuh manusia yang terdiri dari bakteri, archae, virus, dan jamur yang pada umumnya hidup di setiap bagian tubuh manusia seperi kulit, vagina, hidung dan mulut. Bakteri pada mikrobioma manusia memiliki peran pada imunitas, nutrisi, dan perkembangan manusia. Di sini ditinjau tentang interaksi antara koloni mikroba dan sistem kekebalan tubuh dan implikasi dari temuan ini bagi kesehatan manusia. Kata-kata kunci: mikrobiota usus, sistem kekebalan tubuh, interaksi, bakteria.   INTERACTION BETWEEN GUT MICROBIOTA AND THE HUMAN IMMUNE SYSTEM ABSTRACT Most of the gut microbiota has important role in human immune system. These microbiota conducts important function for host physiology. The microbiota in the human body can range around 10 to 100 billion in number which contained 1,000 different species. Microbiota are the whole microbes living in human body such as bacteria, archaea, virus, and fungi, located on the skin or inside the vagina, nose and mouth. Bacteria in human microbiome has important roles in nutrition, immunity, and human development. This article discussed about interaction of microbes and immune system along with the implication of the interaction for human health. Keywords: Gut microbiota, immune system, interaction, bacteria
FREKUENSI ALEL, HETEROZIGOSITAS DAN MIGRASI ALEL PADA POPULASI ETNIS JAWA DAN MADURA DI MALANG DAN MADURA, JAWA TIMUR, INDONESA Nikmatul Iza
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (615.968 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15289

Abstract

FREKUENSI ALEL, HETEROZIGOSITAS DAN MIGRASI ALEL PADA POPULASI ETNIS JAWA DAN MADURA DI MALANG DAN MADURA,  JAWA TIMUR, INDONESA ABSTRAKPenelitian ini bertujuan untuk menentukan frekuensi alel, heterozigositas, dan migrasi alel pada populasi etnis Jawa dan Madura berdasarkan penanda 13 CODIS. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah (1) Pengambilan sampel darah dari 5 populasi yang terdiri dari 3 populasi etnis jawa dan 2 populasi etnis Madura; (2) Isolasi DNA dari sampel darah dilakukan dengan menggunakan metode salting out; (3) Amplifikasi PCR dengan menggunakan 13 CODIS  yang terdiri dari TPOX, D3S1358, FGA, D5S818, CSF1PO, D7S820, D8S1179, TH01, VWA, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11 dan divisualisasi dengan elektroforesis gel polyacrylamid 8%; serta (4) Profil pita dianalisis dengan program QuantityOne dan variasi pola pita DNA dianalisis dengan menggunakan program software GENEPOP package versi 4.2 yang akan digunakan untuk menentukan frekuensi alel, heterozigositas, dan migrasi alel. Hasil penelitian menunjukkan bahwa (1) Pada populasi etnis Jawa frekuensi alel yang memiliki keragaman tertinggi terdapat pada lokus D21S11 dengan jumlah alel sebanyak enam, lokus VWA dengan jumlah alel sebanyak lima, dan lokus FGA, TH01, D13S317, D16S539 dengan jumlah alel sebanyak empat yang digunakan sebagai penanda. Populasi etnis Madura memiliki frekuensi alel dengan keragaman tertinggi terdapat pada lokus TH01, D13S317, dan D21S11 dengan jumlah alel sebanyak lima dan lokus FGA dengan jumlah alel sebanyak empat. (2) Nilai heterozigositas populasi etnis Madura I (90.38%) dan populasi etnis Madura II (86.54%) lebih tinggi dibandingkan dengan populasi etnis Jawa I (67.69%), populasi etnis Jawa II (83.03%), maupun populasi etnis Jawa III (70.77%) dan (3) Migrasi alel pada populasi etnis Jawa sebesar 0.085% dan pada populasi etnis Madura sebesar 0.081%.Kata kunci: Frekuensi Alel, Heterozigositas, Migrasi Alel, 13 CODIS, Etnis Jawa dan Madura ALLELE FREQUENCY, HETEROZIGOSITY, AND ALLELE MIGRATION IN JAVANESE AND MADURESE POPULATION IN MALANG AND MADURA, EAST JAVA INDONESIA ABSTRACTThe aim of this study is to determine the frequency of alleles, heterozygosity, and allele migration in Javanese and Madurese population use 13 CODIS. The methods used in this study were (1) blood samples from five population consist three population of Javanese ethnic and two population of Madurese ethnic, (2) DNA extraction from blood samples by salting out method, (3) PCR amplification use 13 CODIS were TPOX, D3S1358, FGA, D5S818, CSF1PO, D7S820, D8S1179, TH01, VWA, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11 and visualized by 8% polyacrylamide gel (4) The band profile was analyzed by using QuantityOne software and variations in the pattern of DNA bands were analyzed by using GENEPOP software version 4.2 package to determine the frequency of alleles, heterozygosity, and allele migration. The results showed that (1) The population of Javanese allele frequency that has the highest diversity found in the locus D21S11 with a number of alleles of six, locus VWA by the number of alleles of five, and the locus FGA, TH01, D13S317, and D16S539 with a number of alleles of four  which is used as a marker. The populations of Madurese allele frequency that has the highest diversity found in the locus TH01, D13S317, and D21S11 with a number of alleles of five and locus FGA with a number of alleles of four, (2) Value of heterozygosity populations of Madurese I (90.38 %) and populations of Madurese II (86.54%) was higher than the population of Javanese I (67.69%), the population of Javanese II (83.03%), as well as the population of Javanese III (70.77%) and (3) There has been a migration of alleles in population Javanese of 0.085% and population Madurese of 0.081%.Keywords: Allele Frequency, Heterozigosity, Allele Migration, 13 CODIS,       Javanese and Madurese ethnic.
Determining the Genetic Similarities and Variability of Javanese and Arab Ethnic Families with DNA Fingerprint in Malang East Java Indonesia Nila Kartika Sari
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (527.408 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15292

Abstract

PENENTUAN SIMILARITAS DAN VARIABILITAS GENETIK PADA KELUARGA ETNIS JAWA DAN ARAB DENGAN DNA FINGERPRINT DI MALANG, JAWA TIMUR, INDONESIA ABSTRAKLebih dari sepertiga genom manusia terdiri dari urutan daerah berulang (Repeat area) yang terdiri dari Minisatellite atau Variant Number Of Tandem Repeats (VNTR) dan Microsatellite atau Short Tandem Repeat (STR). STR sebagai daerah berulang dengan rentang alel yang pendek sering digunakan untuk tes paternitas, penelitian penyakit genetik dalam bidang kesehatan, arkeologi molekular, maupun kasus kriminalitas dalam bidang forensic. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi DNA Fingerprint pada etnis Jawa – Arab dengan menentukan similaritas dan variabilitas genetiknya. Bahan dan metode yang digunakan untuk mengerjakan adalah menggunakan sel darah putih manusia yang berasal dari tiga generasi dalam tiga keluarga yang terdiri dari : (1) Nenek – Ibu, Ayah – anak perempuan, (2) Kakek – Ibu, Ayah – Anak perempuan, (3) Kakek, Nenek – Ibu, Ayah – Anak laki-laki. Isolasi DNA pada tiap sampel diperoleh dengan salting out, selanjutnya Amplifikasi PCR dengan menggunakan 13 CODIS yang meliputi TPOX, D3S1358, FGA, D5S818, CSF1PO, D7S820, D8S1179, TH01, VWA, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11 dan amelogenin yang dapat dilihat melalui hasil elektroforesis gel poliakrilamid 8% dengan Chemidoc Gel Imaging. Analisis profil pita pada tiap individu untuk menentukan similaritas dan variabilitas genetik serta pola alel dengan menggunakan software Quantity One. Variasi pola pita DNA dianalisis dengan menggunakan program software GENEPOP package versi 4.2 yang akan didapat frekuensi alel, heterozigositas, dan migrasi alel. Berdasarkan identifikasi yang dilakukan diperoleh bahwa nilai heterozigositas pada populasi III (93.8461%) memiliki nilai heterozigositas lebih tinggi dibandingkan dengan populasi I (88.4615%) dan II (76.9230%) dan telah terjadi migrasi alel 0.341373%.  Adanya persentase migrasi alel tersebut meskipun kecil menunjukkan telah terjadi Breeding diantara populasi Jawa dengan populasi Arab sehingga meningkatkan rata-rata nilai heterozigositas pada tiap populasi. Pola alel heterozigot dengan berdasarkan nilai heterozigositas, jumlah alel pada D21S11, VWA dan THO1 dapat direkomendasikan sebagai penanda molekular untuk identifikasi variasi genetik.Kata kunci: Etnis Jawa–Arab, DNA Fingerprint, 13 CODIS DETERMINING THE GENETIC SIMILARITIES AND VARIABILITY OF JAVANESE AND ARAB ETHNIC FAMILIES WITH DNA FINGERPRINT IN MALANG EAST JAVA INDONESIAABSTRACTMore than one-third of human genome consists of repetitive sequence region (Repeat Area) which consist of Minisatellite or Variant Number Of Tandem Repeats (VNTR) and Microsatellite or Short Tandem Repeat (STR). Based on its short allele range STR can be used for the paternity testing study of genetics disease, molecular archeology, as well as in forensic crime cases. The aim of this study is to identify Javanese – Arab Ethnic DNA fingerprint in determining the similarities and genetic variability. Materials and methods to accomplish this, we used human white blood cell from three generations of three family consists of: (1) grandmother-mother, father-daughter, (2) grandfather-mother, father-daughter, (3) grandfather, grandmother–mother, father-son. DNA blood samples were Isolated by salting out, furthermore PCR amplification used by applying 13 CODIS which consists of TPOX, D3S1358, FGA, D5S818, CSF1PO, D7S820, D8S1179, TH01, VWA, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11 and amelogenin, and then it was visualized by 8% polyacrylamid gel. The Fingerprint profile was visualized by 8% polyacrylamide gel and took the picture by ChemiDoc gel Imaging and measure the intensity band pattern by Quantity One software. Variations in the pattern of DNA bands were analyzed using the program GENEPOP software package version 4.2 that will be obtained allele frequencies, heterozygosity, and allele migration. Based on identification, this result showed analysis heterozygosity values, population III (93.8461%) have higher heterozygosity values compared with the population I (88.4615%) and II (76.9230%) and migration of alleles 0.341373%. The percentage of the migration though minor allele had occurred Breeding populations between Java to the Patterns of heterozygous alleles with values based on heterozygosity, number of alleles at D21S11,VWA and THO1 can be recommended as a molecular marker for the identification of genetic variation.Keywords: Javanese – Arab Ethnics, DNA fingerprint, 13 CODIS
KAJIAN VARIASI SEKUNES INTRASPESIES DAN FILOGENETIK MONYET HITAM SULAWESI (Macaca nigra) DENGAN MENGGUNAKAN GEN COI Fitri Elisabeth Br. Hasibuan; Feky R Mantiri; Rooije R.H Rumende
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 17 Nomor 1, April 2017
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (707.334 KB) | DOI: 10.35799/jis.17.1.2017.15558

Abstract

KAJIAN VARIASI SEKUNES INTRASPESIES DAN FILOGENETIK MONYET HITAM SULAWESI (Macaca nigra) DENGAN MENGGUNAKAN GEN COI ABSTRAKMacaca nigra merupakan salah satu spesies yang endemik dan terancam punah di Sulawesi Utara. Eksploitasi yang berlebihan serta alih fungsi hutan menjadi ancaman bagi spesies ini di alam. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui variasi sekuens intraspesies M. nigra yang berada di Pusat Penyelamatan Satwa Tasikoki Bitung. Analisis sekuens menunjukkan terdapat perbedaan sepuluh pasang basa nukleotida pada urutan sekuens sampel dilokasi yang berbeda. Jarak genetik antara kedua sampel yaitu 0.016. Hasil perhitungan jarak genetik menunjukkan variasi genetik masih berada dalam kisaran variasi intraspesies dengan ambang batas untuk variasi intraspesies yaitu 0.015-0.025. Selain itu, variasi juga ditunjukkan pada sampel dengan kerabat dekatnya yang terdata di GenBank disebabkan karena adanya mutasi sinonim dan mutasi nonsinonim. Analisis filogenetik berdasarkan gen COI (Cytochrome Oxidase-I) menunjukkan bahwa sampel M. nigra yang digunakan dalam penelitian ini berada satu klaster dengan M. nigra yang ada di database dan termasuk ke dalam kelompok Silenus.Kata kunci: Variasi sekuens intraspesies, Gen COI, Macaca nigra, analisis filogenetik. THE STUDY INTRASPECIFIC VARIATION SEQUENCES AND PHYLOGENETIC CELEBES BLACK MACAQUE (Macaca nigra) USING COI GENE ABSTRACTMacaca nigra is listed as one of the endemic species and endangered in North Sulawesi. Exploitation and forest conversion have become threats to this species in the wild. This study was conducted to determine the intraspecific sequence variation of M. nigra located in Tasikoki Wildlife Rescue Center, Bitung. Sequence analysis revealed ten nucleotides differences between these two specimens. Genetic distance for both of specimens is 0.016. The result of genetic distance, the genetic variation between the specimens of M. nigra was still within the range of intraspecific variation. Distance analysis was also conducted by comparing with the close relatives of M. nigra based on BLAST search, which showed range from 0.015-0.025. These differences resulted in both synonymous and nonsynonymous mutation. Phylogenetic analysis using DNA sequences of COI (Cytochrome Oxidase-I) gene revealed that the two specimens of M. nigra claster together with M. nigra sequences that have been deposited in GeneBank. Moreover M. nigra is claster in the silenus group which is in accordance with previous reports.Keywords: Intraspecific Sequence Variation, COI Gene, Macaca nigra, Phylogenetic analysis.

Page 1 of 2 | Total Record : 12

 1   2 

Filter by Year

2017 2017


Reset
Filter By Issues
All Issue Volume 23 Nomor 2, Oktober 2023 Volume 23 Nomor 1, April 2023 Volume 22 Nomor 2, Oktober 2022 Volume 22 Nomor 1, April 2022 Volume 21 Nomor 2, Oktober 2021 Volume 21 Nomor 1, April 2021 Volume 20 Nomor 2, Oktober 2020 Volume 20 Nomor 1, April 2020 Volume 19 Nomor 2, Oktober 2019 Volume 19 Nomor 1, April 2019 Volume 18 Nomor 2, Oktober 2018 Volume 18 Nomor 1, April 2018 Volume 17 Nomor 2, Oktober 2017 Volume 17 Nomor 1, April 2017 Volume 16 Nomor 2, Oktober 2016 Volume 16 Nomor 1, April 2016 Volume 15 Nomor 2, Oktober 2015 Volume 15 Nomor 1, April 2015 Volume 14 Nomor 2, Oktober 2014 Volume 14 Nomor 1, April 2014 Volume 13 Nomor 2, Oktober 2013 Volume 13 Nomor 1, April 2013 Volume 12 Nomor 2, Oktober 2012 Volume 12 Nomor 1, April 2012 Volume 11 Nomor 2, Oktober 2011 Volume 11 Nomor 1, April 2011 Volume 9 Nomor 1, April 2009 Volune 8 Nomor 1, April 2008 Volume 7 Nomor 1, April 2007 More Issue