Garuda - Garba Rujukan Digital

p-Index From 2019 - 2024

7.935

P-Index

This Author published in this journals

All Journal Jurnal Ilmiah Farmasi JURNAL KIMIA SAINS DAN APLIKASI Pharmaciana: Jurnal Kefarmasian Media Farmasi : Jurnal Ilmu Farmasi (Journal Of Pharmaceutical Science) Biogenesis: Jurnal Ilmiah Biologi al-Kimiya Journal of Biomedicine and Translational Research The Journal of Pure and Applied Chemistry Research Jurnal Riset Kimia Pharmacon JURNAL FARMASI DAN ILMU KEFARMASIAN INDONESIA Jurnal Farmasi Galenika (Galenika Journal of Pharmacy) Jurnal Biodjati ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia BIOEDUSCIENCE Majalah Farmasi dan Farmakologi (Trends in Pharmacy and Pharmaceutical Sciences) JSFK (Jurnal Sains Farmasi & Klinis) Jurnal Inovasi Hasil Pengabdian Masyarakat (JIPEMAS) Journal of Tropical Pharmacy and Chemistry Molekul: Jurnal Ilmiah Kimia Jurnal Ilmiah Farmasi Farmasyifa Poltekita: Jurnal Pengabdian Masyarakat Pharmaceutical Sciences and Research (PSR) Makara Journal of Science Bandung Conference Series: Pharmacy Borneo Journal of Pharmacy

Taufik Muhammad Fakih

Department Of Pharmacy, Faculty Of Mathematics And Natural Sciences, Universitas Islam Bandung, Bandung, 40116|Universitas Islam Bandung|Indonesia

Author-ID : 1562230

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Earth & Planetary Sciences Education Energy Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Materials Science & Nanotechnology Medicine & Pharmacology Nursing Public Health Other

Published : 61 Documents Claim Missing Document

Claim Missing Document

Articles

Title

1 2

Identifikasi Epitop Sel-T COVID-19 terhadap Reseptor Imun TLR-2 (Toll-like Receptor-2) untuk Pengembangan Vaksin Berbasis Peptida Ridwan Wijaya; Aulia Fikri Hidayat; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. The coronavirus outbreak that is sweeping the world is a serious challenge for the international health system. Overcoming the lack of information regarding experimental data, tools and even understanding of the body's immune response to SARS-CoV2, it is necessary to take effective steps to anticipate the spread and control the COVID-19 pandemic. Therefore, a COVID-19 epitope T-cell protein-peptida docking simulation against the TLR-2 (Toll-like Receptor-2) immune receptor target with the PDB code 2Z80 computationally was carried out in order to add dry laboratory data information, anticipate contact and crowds so as to minimize the spread of the SARS-CoV2 outbreak. There are several bioactive peptidas that are potential candidates for SARS-CoV2 vaccines such as bioactive peptidas FLAFVVFLL, FVLAAVYRI, FVVFLLVTL, VLLFLAFVV and YVYSRVKNL. This study aims to identify and evaluate the molecular interactions that occur between bioactive peptida molecules and TLR-2 enzyme macromolecules with PDB code 2Z80 using in-silico protein-peptida-based molecular docking method. Bioactive peptida sequence modeling using PEP-FOLD software. Furthermore, the best conformation was selected to be used in the study of interactions with TLR-2 macromolecules using the HPEPDock software. Further exploration was carried out on the results of molecular interactions formed using the BIOVIA Discovery Studio 2019 software. Based on the results from molecular anchoring, the bioactive peptida FLAFVVFLL had the best affinity for TLR-2 macromolecules (PDB code 2Z80) with a bond free energy value of -155,194 kJ/mol. So it can be concluded that the bioactive peptida is predicted to be used as a candidate for TLR-2 enzyme inhibitor. Abstrak. Wabah virus corona yang sedang melanda dunia ini merupakan suatu tantangan yang serius bagi sistem kesehatan internasional. Mengatasi kurangnya informasi mengenai data eksperimental, alat bahkan pemahaman mengenai respons imun tubuh terhadap SARS-CoV2 diperlukan langkah yang efektif agar mengantisipasi penyebaran sekaligus mengendalikan pandemic COVID-19. Maka dari itu dilakukan simulasi docking protein-peptida sel-T epitope COVID-19 terhadap target reseptor imun TLR-2 (Toll-like Receptor-2) dengan kode PDB 2Z80 secara komputasi agar menambahkan informasi data laboratorium kering, mengantisipasi kontak dan kerumunan sehingga meminimalisir penyebaran wabah SARS-CoV2. Terdapat beberapa peptida bioaktif yang berpotensi sebagai kandidat vaksin SARS-CoV2 seperti peptida bioaktif FLAFVVFLL, FVLAAVYRI, FVVFLLVTL, VLLFLAFVV dan YVYSRVKNL. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan mengevaluasi interaksi molekuler yang terjadi antara molekul peptida bioaktif dengan makromolekul enzim TLR-2 dengan kode PDB 2Z80 menggunakan metode penambatan molekuler berbasis protein-peptida secara in-silico. Pemodelan sekuensi peptida bioaktif dengan menggunakan perangkat lunak PEP-FOLD. Selanjutnya dipilih konformasi terbaik untuk digunakan pada studi interaksi terhadap makromolekul TLR-2 dengan menggunakan perangkat lunak HPEPDock. Dilakukan eksplorasi lebih lanjut terhadap hasil interaksi molekuler yang terbentuk dengan menggunakan perangkat lunak BIOVIA Discovery Studio 2019. Berdasarkan hadil dari penambatan molekuler, ppeptida bioaktif FLAFVVFLL memiliki afinitas yang paling baik terhadap makromolekul TLR-2 (kode PDB 2Z80) dengan nilai energi bebas ikatan -155,194 kJ/mol. Sehingga dapat disimpulkan, peptida bioaktif tersebut diprediksi dapat digunakan sebagai kandidat inhibitor enzim TLR-2.

Uji In-Silico Aktivitas Antikanker Paru Senyawa Vanilloid pada Jahe Merah (Zingiber officinale Roscoe.) terhadap Epidermal Growth Factor Receptor (Egfr) Exon 20 Syahrizal Nazala; Diar Herawati; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. The anticancer activity of vanilloid compounds in red ginger is thought to have an interaction with the Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) Exon 20 which affects the growth of lung cancer cells. The purpose of this study was to observe the interaction of vanilloid compounds with EGFR Exon 20 and to predict the activity, absorption, distribution and toxicity of vanilloid compounds. All test compounds were optimized by Gauss View software version 5.0.8 and Gaussian version 09, then molecular docking simulations were carried out as well as absorption, distribution and toxicity predictions. Of the 7 vanilloid compounds that were docked, hexahydrocurcumin showed potential as an anticancer compound. Hexahydrocurcumin is declared to meet the requirements of the Lipinski Rule of Five, which means it has good bioavailability. Prediction of absorption and distribution includes the percentage values of Human Intestinal Absorption (HIA), human colon adenocarcinoma (Caco-2), and Plasma Binding Protein (PPB). Toxicity test showed that hexahydrocurcumin compound was mutagenic but not carcinogenic. The molecular docking simulation results showed that the hexahydrocurcumin compound had a better affinity for EGFR Exon 20 compared to other vanilloid compounds. Visualization results showed that hexahydrocurcumin compounds had interactions with amino acid residues Lys129, Leu83, Thr165, Ile10, Asp145, Asp86, Gln31, Phe80, Gln85 and Ala144. The results showed that the hexahydrocurcumin compound had anti-lung cancer candidate activity to EGFR Exon 20 receptor. Abstrak. Aktivitas antikanker senyawa vanilloid pada jahe merah diduga memiliki interaksi dengan Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) Exon 20 yang berperaruh terhadap pertumbuhan sel kanker paru. Tujuan penelitian ini adalah untuk melihat interaksi senyawa vanilloid terhadap EGFR Exon 20 dan mendapatkan prediksi aktivitas, absorpsi, distribusi serta toksisitas senyawa vanilloid. Semua senyawa uji dioptimasi dengan software Gauss View versi 5.0.8 dan Gaussian versi 09 kemudian dilakukan simulasi molecular docking serta prediksi absorpsi, distribusi dan toksisitasnya. Dari 7 senyawa vanilloid yang di dockingkan, hexahydrocurcumin menunjukan potensi sebagai senyawa untuk antikanker. Hexahydrocurcumin dinyatakan memenuhi aturan Lipinski’s Rule of Five yang berarti memiliki bioavailabilitas yang baik. Prediksi absorpsi dan distribusi meliputi nilai persentase Human Intestinal Absorption (HIA), human colon adenocarcinoma (Caco-2), dan Protein Plasma Binding. Pengujian toksisitas menunjukkan bahwa senyawa hexahydrocurcumin bersifat mutagenik namun tidak karsinogenik. Hasil simulasi molecular docking menunjukkan bahwa senyawa hexahydrocurcumin memiliki afinitas yang lebih baik terhadap EGFR Exon 20 dibandingkan dengan senyawa vanilloid lainnya. Hasil visualisasi menunjukkan bahwa senyawa hexahydrocurcumin memiliki interaksi dengan residu asam amino Lys129, Leu83, Thr165, Ile10, Asp145, Asp86, Gln31, Phe80, Gln85 dan Ala144. Hasil yang didapat menunjukkan bahwa senyawa hexahydrocurcumin memiliki potensi untuk dijadikan kandidat anti kanker paru terhadap reseptor EGFR Exon 20.

Uji Aktivitas In Silico Senyawa Amritoside, Tinosporaside dan Turunannya sebagai Kanditat Senyawa Annisa Fitriyani Suryana; Hilda Aprilia; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Diabetes Mellitus (DM) is a group of metabolic diseases characterized by a disturbance in insulin function that causes an increase in blood glucose levels (hyperglycemia). The -glucosidase receptor is a receptor that plays a role in the treatment of diabetes mellitus. This study aims to test the activity of compounds amritoside C, amritoside D, amritoside D tetraacetate, tinosponone, tinosporaside in brotowali (Tinospora cordifolia) in silico approach and to find out which compounds have the most potential as antidiabetic. The research was conducted by identifying the physicochemical properties of the test compounds using the swissADME server. After that, geometry optimization was carried out using Gaussian 09. Macromolecular preparation was carried out using the BIOVIA Discovery Studio 2021 software. Furthermore, the validation of the docking method and simulation of the molecular docking method used MGLTools 1.5.6 software with AutoDock Tools 4.2. The molecular docking results were then visualized using the BIOVIA Discovery Studio 2021 software. The toxicity test of the test compounds used Toxtree version 3.1.0 and through the PreADMET website. Based on the value of the free bond energy (ΔG) of Amritoside C compound which is -8.78 kcal/mol and the value of inhibition constant is 0.36 micromolar (µM), Amritoside D compound is -8.85 kcal/mol and the value of inhibition constant is 0.32 micromolar. (µM), Amritoside D Tetraacetate compound was -8.07 kcal/mol and the value of inhibition constant was 1.21 micromolar (µM), Tinosponone compound was -6.57 kcal/mol and the inhibition constant was 15.4 micromolar (µM), Tinosporaside compound is -9.04 kcal/mol and the value of inhibition constant (Ki) is 0.23 micromolar (µM), natural ligand is -6.16 kcal/mol and the value of inhibition constant is 30.28 micromolar (µM). The conclusion of this study is that the tinosporaside compound has the best affinity among the four other test compounds and a natural ligand (acarbose) which is -9.04 kcal/mol and the value of the inhibition constant (Ki) is 0.23 micromolar (µM), indicating that Tinosporaside has the potential to be used as as a candidate for type 2 antidiabetic compounds through the mechanism of -glucosidase inhibition. Abstrak. Diabetes Mellitus (DM) adalah suatu kelompok penyakit metabolik yang ditandai dengan adanya gangguan pada fungsi insulin yang menyebabkan meningkatnya kadar glukosa dalam darah (Hiperglikemia). Reseptor α-glucosidase adalah reseptor yang berperan dalam pengobatan diabetes mellitus. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan pengujian aktivitas senyawa amritoside C, amritoside D, amritoside D tetraacetate, tinosponone, tinosporaside pada brotowali (Tinospora Cordifolia) pendekatan secara in silico serta mengetahui senyawa yang paling berpotensi sebagai antidiabetes. Penelitian dilakukan dengan mengidentifikasi sifat fisikokimia senyawa uji menggunakan sever swissADME. Setelah itu dilakukan optimasi geometri menggunakan Gaussian 09. Preparasi makromolekul dilakukan menggunakan software BIOVIA Discovery Studio 2021. Selanjutnya, validasi metode docking dan simulasi metode molecular docking menggunakan software MGLTools 1.5.6 dengan AutoDock Tools 4.2. Hasil molecular docking kemudian divisualisasi dengan menggunakan software BIOVIA Discovery Studio 2021. Uji toksisitas senyawa uji menggunakan Toxtree versi 3.1.0 dan melalui website PreADMET. Berdasarkan nilai energi bebas ikatan (ΔG) senyawa Amritoside C sebesar -8,78 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 0,36 mikromolar (µM), senyawa Amritoside D sebesar -8,85 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 0,32 mikromolar (µM), senyawa Amritoside D Tetraacetate sebesar -8,07 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 1,21 mikromolar (µM), senyawa Tinosponone sebesar -6,57 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 15,4 mikromolar (µM), senyawa Tinosporaside sebesar -9,04 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 0,23 mikromolar (µM), ligan alami sebesar -6,16 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 30,28 mikromolar (µM). Kesimpulan penelitian ini senyawa tinosporaside memiliki afinitas paling baik diantara keempat senyawa uji lainnya dan ligan alami (acarbose) yaitu sebesar -9,04 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 0,23 mikromolar (µM), menunjukan senyawa Tinosporaside berpotensi untuk dijadikan sebagai kandidat senyawa antidiabetes tipe 2 melalui mekanisme penghambatan α-glucosidase.

Studi In Silico Senyawa Asiatikosida H dan I pada Centella asiatica sebagai Senyawa Neuroprotektor Trully Nouval Larasati; Hilda Aprilia Wisnuwardhani; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Alzheimer’s is a neurodegenerative disease characterized by a gradual decline in cognitive function and it leads cause of dementia in the world. To prevent cognitive function decline in patients with Alzheimer’s disease, Asiaticoside compounds in Centella asiatica can be used as an alternative to provide neuroprotective effects. Acetylcholinesterase (AChE) is an important target in pathogenesis of Alzheimer’s disease. This enzyme plays a role in break down acetylcholine as a neurotransmitter. The purpose of this study was to determine the activity of Asiaticoside H and I in inhibiting acetylcholinesterase (AChE) through an in silico approach. In this study, identification of the physicochemical properties of Asiaticoside compounds was carried out using the SwissADME website. Furthermore, Asiaticoside compounds was optimized using Gaussian version 09®. Then a molecular docking simulation of Asiaticoside compounds towards the acetylcholinesterase (AChE) was carried out using MGL Tools version 1.5.6 which has been equipped with Autodock Tools version 4.2. The toxicity prediction of Asiaticoside compounds was carried out using Toxtree version 3.1.0 and Pre-ADMET. Docking simulation results showed that the compound with the lowest binding energy is Asiaticoside E and the best inhibitory activity towards acetylcholinesterase receptor is Asiaticoside D. It can be concluded that the new compounds of Asiaticoside namely Asiaticoside H and I had potential as acetylcholinesterase inhibitors. However, the two new compounds has lower activity and interactions compared to other Asiaticoside derivates. Abstrak. Alzheimer merupakan salah satu penyakit neurodegeneratif yang ditandai dengan penurunan fungsi kognitif secara bertahap dan menjadi penyebab utama demensia di dunia. Untuk mencegah penurunan fungsi kognitif pada penderita penyakit Alzheimer, senyawa Asiatikosida pada tanaman pegagan (Centella asiatica) dapat dijadikan alternatif untuk memberikan efek neuroprotektif. Asetilkolinesterase (AChE) merupakan target penting dalam patogenesis penyakit Alzheimer. Enzim ini berperan memecah asetilkolin sebagai neurotransmitter. Tujuan dilakukannya penelitian ini yaitu untuk mengetahui aktivitas dari senyawa Asiatikosida H dan I dalam menghambat asetilkolinesterase (AChE) melalui pendekatan in silico. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi sifat fisikokimia pada senyawa Asiatikosida menggunakan website SwissADME. Selanjutnya senyawa Asiatikosida dilakukan optimasi menggunakan Gaussian 09®. Simulasi molecular docking senyawa uji Asiatikosida terhadap reseptor asetilkolinesterase (AChE) dilakukan dengan menggunakan software MGL Tools 1.5.6 yang telah dilengkapi dengan Autodock Tools versi 4.2. Uji toksisitas dilakukan menggunakan software Toxtree versi 3.1.0 dan website Pre-ADMET. Hasil simulasi docking menunjukkan bahwa senyawa dengan nilai energi bebas ikatan terendah adalah Asiatikosida E dan aktivitas penghambatan pada reseptor asetilkolinesterase (AChE) yang paling baik adalah Asiatikosida D. Hasil penelitian menunjukkan bahwa senyawa Asiatikosida H dan I berpotensi untuk dijadikan sebagai inhibitor asetilkolinesterase, namun aktivitas dan interaksi yang dihasilkan lebih rendah dibandingkan dengan turunan senyawa Asiatikosida yang lainnya.

Simulasi Pengembangan Obat Baru pada Senyawa Apigenin, Curcumin, Fisetin, Naringenin dan Silibinin terhadap Protein Target Phosphoinositide 3-Kinases (PI3-Ks) secara In Silico Sylvie Kurniasih; Ridwan Wijaya; Dina Mulyanti; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. The discovery and development of new drugs starts from the selection of drug work targets, then continues with the determination of compounds and performance predictions based on their chemical structure using in silico, followed by pre-clinical testing in vitro and in vivo, as well as clinical trials in humans to see the drug's response to the body. This study aims to determine whether the compounds apigenin, curcumin, fisetin, naringenin and silibinin can be developed into new drugs using in silico tests. The method used in this study was an in silico test using docking. Testing begins with the determination of the physicochemical properties of the test compound, it is known that 4 compounds other than silibinin meet the requirements of the Lipinski Rule of Five. Then the preparation process of the molecular structure on the website rscb.org obtained results in accordance with the RMSD value of the PI3-Ks receptor of 0.67A, where the smaller the RMSD value, the closer the position is to the natural ligand. Then continued with the docking simulation between the PI3-Ks receptor and the test compound, the docking results are that in apigenin compounds there are 11 non-bond interactions, in curcumin compounds there are 8 non-bond interactions, in fisetin compounds there are 15 non-bond interactions, in naringenin compounds there are 7 non-bond interactions and in silibinin compounds there are 9 on-bond interactions. Then tested for toxicity, which has a moderate / medium risk, so it needs to be considered if it is going to be used as a new drug. Abstrak. Penemuan dan pengembangan obat baru dimulai dari seleksi target kerja obat, kemudian dilanjutkan dengan penentuan senyawa dan prediksi kinerja berdasarkan stuktur kimianya menggunakan in silico, dilanjutkan dengan pengujian pra klinis secara in vitro dan in vivo, serta uji klinis pada manusia untuk melihat respon obat terhadap tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui apakah senyawa apigenin, curcumin, fisetin, naringenin dan silibinin dapat dikembangkan menjadi obat baru menggunakan uji in silico. Metode yang digunakan pada penelitian ini yaitu uji in silico menggunakan docking. Pengujian diawali dengan penentuan sifat fisikokimia senyawa uji diketahui bahwa 4 senyawa selain silibinin memenuhi syarat Lipinski Rule of Five. Kemudian dilakukan proses preparasi struktur molekul pada website rscb.org didapatkan hasil yang sesuai dengan nilai RMSD reseptor PI3-Ks sebesar 0.67A, dimana semakin kecil nilai RMSD maka semakin dekat posisinya dengan ligan alaminya. Lalu dilanjutkan dengan simulasi docking antara reseptor PI3-Ks dengan senyawa uji, hasil docking yaitu pada senyawa apigenin terdapat 11 interaksi non-bond, pada senyawa curcumin terdapat 8 interaksi non-bond, pada senyawa fisetin terdapat 15 interaksi non-bond, pada senyawa naringenin terdapat 7 interaksi non-bond dan pada senyawa silibinin terdapat 9 interaksi on-bond. Kemudian diuji toksisitasnya yakni memiliki resiko sedang/menengah, sehingga perlu dipertimbangkan jika akan dijadikan obat baru.

Uji In Silico Aktivitas Senyawa Betanin dan Turunannya terhadap Aldose Reduktase dalam Pencegahan Komplikasi Diabetes Firliani Dwiputri; Diar Herawati; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Diabetes mellitus is a metabolic disorder disease characterized by hyperglycemia. Diabetes mellitus can cause complications that can lead to death. Aldose reductace is an enzyme involved in the pathogenesis of diabetes complications. Betanin compounds and their derivatives contained in red beet plants can be an alternative in preventing diabetes complications. The purpose of this study was to examine the activity of betanin and its derivatives against aldose reductase in the prevention of diabetes complications using In Silico method. In this study, identification of the physicochemical properties structure of betanin and its derivatives using the Swiss ADME website. After that, optimization was carried out using the Gauss View software version 5.0.8 and Gaussian version 09. Next, a docking simulation of the test compound was carried out on the aldose reductase receptor which had previously been separated with a comparison ligand and validated using the MGL Tools 1.5.6 software which was equipped with the Autodock Tools version. 4.2. The results showed that the compound 15-decarboxy-betanin was the test compound that had the most potential in preventing diabetes complications. However, when viewed from the interaction results, 17-decarboxy-betanin and 2,17-bidecarboxy-betanin compounds can also have the potential to prevent diabetes complications. So it is recommended to conduct research with the structure of the test compound engineered with the QSAR approach to increase its interaction and further research with molecular dynamics to add a function of time to the interaction. Abstrak. Diabetes melitus merupakan suatu penyakit gangguan metabolisme yang ditandai dengan hiperglikemia. Diabetes melitus dapat menimbulkan komplikasi yang dapat menyebabkan kematian. Aldose reduktase merupakan enzim yang terlibat dalam patogenesis komplikasi diabetes. Senyawa betanin dan turunannya yang terdapat pada tanaman bit merah dapat menjadi alternatif dalam mencegah komplikasi diabetes. Tujuan penelitian ini yaitu untuk melihat aktivitas senyawa betanin dan turunannya terhadap aldose reduktase dalam pencegahan komplikasi diabetes secara In Silico. Penelitian ini dilakukan dengan identifikasi sifat fisikokimia struktur senyawa betanin dan turunannya menggunakan website SwissADME. Setelah itu dilakukan optimasi dengan menggunakan software Gauss View versi 5.0.8 dan Gaussian versi 09. Selanjutnya dilakukan simulasi docking senyawa uji terhadap reseptor aldose reduktase yang sebelumnya sudah dipisahkan dengan ligan pembanding dan divalidasi menggunakan software MGL Tools 1.5.6 yang dilengkapi dengan Autodock Tools versi 4.2. Hasil penelitian menunjukan bahwa senyawa 15-decarboxy-betanin merupakan senyawa uji yang paling berpotensi dalam mencegah komplikasi diabetes. Tetapi jika dilihat dari hasil interaksi yang terjadi senyawa 17-decarboxy-betanin, dan 2,17-bidecarboxy-betanin juga dapat berpotensi dalam pencegahan komplikasi diabetes. Sehingga disarankan untuk melakukan penelitian dengan struktur senyawa uji yang direkayasa dengan pendekatan QSAR untuk meningkatkan interaksinya dan dilakukan penelitian lebih lanjut dengan dinamika molekular untuk menambah fungsi waktu pada interaksinya.

Desain Biosensor Berbasis Nanopartikel Perak untuk Deteksi Protein Hemoglobin pada Babi secara In Silico Latifa Hana Silfadani; Taufik Muhammad Fakih; Hilda Aprilia Wisnuwardhani
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. A product containing pork cannot be consumed by Muslims. A surface plasmon resonance (SPR) biosensor using a silver nanoparticle base was developed to analyze the hemoglobin content of porcine in silico using the molecular docking method. The variation of the thin layer system on the SPR by adding a layer of silver nanoparticles can increase the selectivity and sensitivity of the SPR biosensor. The surface of silver nanoparticles has a high sensitivity plasmon resonance spectra, so it can be used as a detector. The smaller the gibbs free bond energy (∆G), the stronger the bond stability between silver nanoparticles (AgNPs) with porcine and bovine hemoglobin protein receptors. Silver nanoparticles with an amount of 10 Ag had the lowest Gibbs free binding energy values for the two receptor proteins, -2.04 kcal/mol in porcine hemoglobin protein and -2.18 Kcal/mol in bovine. In order to function as sensors in SPR biosensors, silver nanoparticles must be more sensitive to porcine hemoglobin protein than bovine hemoglobin (∆G porcine<∆G bovine). The results of silver nanoparticles (AgNPs) which have the largest difference in Gibbs free bond energy (∆G) with porcine ∆G<∆G bovine are 3 silver nanoparticles with a difference of 0.07 So 3 Ag silver is more sensitive to pig hemoglobin receptors which can later be detected. applied as a sensor in biosensor applications. Abstrak. Suatu produk yang mengandung babi tidak dapat dikonsumsi umat muslim. Biosensor surface plasmon resonance (SPR) dengan menggunakan basis nanopartikel perak dikembangkan untuk menganalisis kandungan hemoglobin babi yang dilakukan secara in silico menggunakan metode molecular docking. Variasi sistem lapisan tipis pada SPR dengan menambahkan lapisan nanopartikel perak dapat meningkatkan selektivitas dan sensivitas biosensor SPR. Permukaan nanopartikel perak memiliki efek spektra plasmon resonansi dengan sensitivitas tinggi, sehingga bisa digunakan sebagai detektor. Semakin kecil energi ikatan bebas gibbs (∆G) maka stabilitas ikatan antara nanopartikel perak (AgNPs) dengan reseptor protein hemoglobin babi dan sapi akan semakin kuat. Nanopartikel perak dengan jumlah 10 Ag memiliki nilai energi ikatan bebas Gibbs paling rendah pada kedua protein reseptor yaitu sebesar -2,04 kcal/mol pada protein hemoglobin babi dan -2,18 Kcal/mol pada sapi. Agar dapat berfungsi sebagai sensor dalam biosensor SPR, Nanopartikel perak harus lebih sensitif dengan protein hemoglobin babi dibanding dengan hemoglobin sapi (∆G babi<∆G sapi). Hasil nanopartikel perak (AgNPs) yang memiliki selisih energi ikatan bebas Gibbs (∆G) paling besar dengan ∆G babi<∆G sapi yaitu pada 3 nanopartikel perak dengan selisih 0,07 Sehingga perak 3 Ag lebih sensitif terhadap reseptor hemoglobin babi yang nantinya dapat diaplikasikan sebagai sensor dalam aplikasi biosensor.

Uji Aktivitas In Silico Senyawa Turunan Flavonoid sebagai Antiviral (HIV) Arini Nabila Putri; Taufik Muhammad Fakih; Dina Mulyanti
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Human Immunodeficiency Virus (HIV) type 1 is an HIV virus that most often attacks the human body's immunity and is easy to mutate. A total of 37.9 million people according to the World Health Organization (WHO) were infected in 2018 with high levels of mortility and morbidity. Drug search research continues to be carried out, one of which is research on HIV protease which is an enzyme that has a role in the process of cutting polyprotein chains on the gag and gag-pol sides as the formation of new viroin. Myricetin is a flavonoid compound from the chives plant (Allium tuberosum). Compound design research has been carried out, molecular tethering using Autodock software obtained the best bond-free energy value in myricetin compounds of -8.10 kcal / mol compared to curcumin compounds of -9.60 kcal / mol, previously validated to calibrate the docking method, rmsd value obtained was 1.14Å, analysis of docking results using Biovia Discovery Studio Visualizer 2021, toxicity test using the preADME website in silico against Flavonoid derivative compounds, based on toxicity tests obtained the results of myricetin with mutagenicity against ames test, are negative against the carcinogenicity of mice or rats and are toxic to algae plants. Abstrak. Human Immunodefisiensi Virus (HIV) tipe 1 adalah virus HIV yang paling sering menyerang kekebalan tubuh manusia dan mudah untuk bermutasi. Sebanyak 37,9 juta orang menurut World Health Organization (WHO) terinfeksi pada tahun 2018 dengan tingkat mortilitas dan morbiditas yang tinggi. Penelitian pencarian obat terus dilakukan salah satunya penelitian terhadap protease HIV yang merupakan enzim yang memiliki peran pada proses pemotongan rantai poliprotein pada sisi gag dan gag-pol sebagai pembentukan viroin yang baru. Myricetin merupakan senyawa flavonoid dari tumbuhan kucai (Allium tuberosum). Telah dilakukan penelitian desain senyawa, penambatan molekular menggunakan software Autodock diperoleh nilai energi bebas ikatan terbaik pada senyawa myricetin sebesar -8,10 kcal/mol dibandingkan dengan senyawa kurkumin sebesar -9,60 kcal/mol, sebelumnya dilakukan validasi untuk mengkalibrasi metode docking, nilai RMSD yang diperoleh sebesar 1,14Å, analisis hasil docking menggunakan Biovia Discovery Studio Visualizer 2021, uji toksisitas menggunakan website preADME secara in silico terhadap senyawa turunan flavonoid, berdasarkan uji toksisitas diperoleh hasil myricetin bersitas mutagen terhadap ames test, bersifat negatif terhadap karsinogenitas mencit atau tikus dan bersifat toksik terhadap tumbuhan algae.

Studi Literatur: Aktivitas Antioksidan Senyawa Bioaktif Kopi (Coffea sp.) Sellygani Budi Vaelani; Taufik Muhammad Fakih; Gita Cahya Eka Darma
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Antioxidants is substances can help protect the body from free radical attacks and radical compounds that can inhibit or slow down damage due to the oxidation process. One of the natural ingredients that has a lot of antioxidant content that is quite high is coffee. The antioxidant content has been widely used for cosmetic preparations with the purpose of providing local protection to the skin. This study purpose to determine what antioxidant bioactive compounds are contained in coffee using what antioxidant test method is used and what dosage forms can be made from coffee (Cofea sp.). The Systematic Literature Review (SLR) method is used with data used in the form of national journals obtained from the screening results of 15 journals from the google schoolar portal. From the results of research, antioxidant compounds known in coffee are flavonoids, tannins, saponins, and steroids, alkaloids, triterpenoids, steroids, phenols, polyphenols and phenolic compounds, namely chlorogenic acid with the antioxidant test method used is the DPPH method (2,2-diphenyl-1- picrilhydrazyl). Obtained some dosage forms of this review are gel body scrub, cream, hand soap, foot cleansing spray, air freshener, therapeutic aroma, lipbalm and peel off gel mask. Keywords: Antioxidants, Coffee, Compounds, Dosage Abstrak. Antioksidan merupakan salah satu substansi yang dapat membantu melindungi tubuh dari serangan radikal bebas maupun senyawa radikal yang dapat menghambat atau perlambatan kerusakan akibat proses oksidasi. Salah satu bahan alam yang memiliki banyak kandungan antioksidan yang cukup tinggi yaitu kopi. Kandungan antioksidan telah banyak digunakan untuk sediaan kosmetik dengan tujuan memberikan perlindungan lokal pada kulit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui senyawa bioaktif antioksidan apakah yang terdapat dalam kopi dengan menggunakan metode uji antioksidan apa yang digunakan dan bentuk sediaan apa saja yang dapat dibuat dari kopi (Cofea sp.). Digunakan metode Systematic Literature Review (SLR) dengan data yang digunakan berupa jurnal nasional yang diperoleh dari hasil screening sejumlah 15 jurnal dari portal google schoolar. Dari hasil penelitian senyawa antioksidan yang diketahui pada kopi adalah flavonoid, tannin, saponin, steroida, alkaloid, triterpenoid, fenol, polifenol dan senyawa fenolik yaitu asam klorogenat dengan metode uji antioksidan yang digunakan adalah metode DPPH (2,2-difenil-1- pikrilhidrazil). Diperoleh juga beberapa bentuk sediaan berupa scrub, gel scrub badan, krim, sabun cuci tangan, foot sanitizer spray, pengharum ruangan, aroma terapi, lipbalm dan masker gel peel off.

Uji In-Silico Aktivitas Antikanker Kolorektal Senyawa Organosulfur Bawang Putih (Allium sativum L.) terhadap Protein Target COX-2 Muhammad Fillah; Diar Herawati; Taufik Muhammad Fakih
Bandung Conference Series: Pharmacy Vol. 2 No. 2 (2022): Bandung Conference Series: Pharmacy
Publisher : UNISBA Press

Abstract. Colorectal cancer is cancer that grows in the colon (large intestine) or in the lower colon that is connected to the rectum. Colorectal anticancer compounds are found in the garlic plant (Allium sativum L.) which contains organosulfur compounds. The COX-2 receptor is a receptor that plays an important role in anticancer activity. The purposa of this study was to prove based on in-silico study whether the organosulfur compounds cloud be used as a colorectal anticancer candidate. The identification of the physicochemical properties of organosulfur compounds was carried out using ChemBioDraw 2D software. The organosulfur compound was optimized using Gauss View software version 5.0.8 and Gaussian version 09. Then proceed to the docking simulation to COX-2 receptor which has been separated from its natural ligand validation of molecular docking system was carried out using MGL Tools version 1.5.6 software which has been equipped with Autodock Tools version 4.2. The result showed that S-Allylmercaptoglutathione compound had a better affinity than the other six organosulfur compounds to COX-2. The S-Allylmercaptoglutathione compound obtained a bond free energi value of -7,53 kcal/mol and the value of the inhibition constant (Ki) was 3,01 µM. According toxicity test results, S-Allylmercaptoglutathione has a high potential for toxicity, with a low risk of exposure and does not cause carcinogenicity or mutagenicity. The S-Allylmercaptoglutathione compound is not better than its natural ligand S58. Where the natural ligand S58 has a free energy value of -10,73 kcal/mol and an inhibition constant (Ki) of 0,0137 µM. It can be concluded that the S-Allylmercaptoglutathione test compound cannot be used as a colorectal anticancer candidate, because it does not have anticancer activity. Abstrak. Kanker Kolorektal merupakan kanker yang pertumbuhannya terjadi di kolon (usus besar) atau di usus besar bagian bawah yang terhubung ke rektum (anus). Senyawa antikanker kolorektal ditemukan dalam tanaman bawang putih (Allium sativum L.) yang mengandung senyawa organosulfur. Reseptor COX-2 adalah reseptor yang berperan penting dalam antikanker kolorektal. Tujuan dilakukannya penelitian ini untuk membuktikan secara in-silico senyawa organosulfur dapat dijadikan sebagai kandidat antikanker kolorektal. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi sifat fisikokimia pada senyawa organosulfur menggunakan software ChemBioDraw 2D. Senyawa organosulfur dilakukan optimasi menggunakan software Gauss View versi 5.0.8 dan Gaussian versi 09. Kemudian dilanjutkan ke tahap simulasi docking senyawa uji organosulfur terhadap reseptor COX-2 yang telah dipisahkan dengan ligan alaminya dan telah di validasi menggunakan software MGL Tools versi 1.5.6 yang telah dilengkapi dengan Autodock Tools versi 4.2. Berdasarkan hasil penelitian, hasil docking senyawa S-Allylmercaptoglutathione memiliki afinitas lebih baik dibandingkan dengan keenam senyawa organosulfur lainnya. Senyawa S-Allylmercaptoglutathione diperoleh nilai energi bebas ikatan yaitu -7,53 kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 3,01 µM. Hasil prediksi toksisitas S-Allylmercaptoglutathione memiliki potensi toksisitas yang tinggi, dengan risiko paparan yang rendah serta tidak menyebabkan karsinogenik atau mutagenisitas. Senyawa S-Allylmercaptoglutathione tidak lebih baik dibandingkan ligan alaminya. Dimana ligan Alami S58 memiliki nilai energi bebas ikatan yaitu -10,73 kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi (Ki) 0,0137 µM. Maka dapat disimpulkan bahwa senyawa uji S-Allylmercaptoglutathione tidak dapat dijadikan sebagai kandidat antikanker kolorektal, karena tidak memiliki aktivitas antikanker.

Co-Authors Adryan Fristiohady Akmal Syihabuddin Aldhiya Nurshafa Huwaida Alivia Dyanira Anggi Arumsari Annisa Fitriyani Suryana Annisa Meilani Annisa Meilani Arfan Arfan Arini Nabila Putri Aulia Fikri Hidayat Budi Prabowo Soewondo Dewi, Mentari Luthfika Dewi, Mentari Luthfika Diar Herawati Dina Mulyanti Dina Mulyanti Dwi Syah Fitra Ramadhan Eky Syahroni Faqih Radina Faqih Radina Farendina Suarantika Farendina Suarantika Firda Aulia Jannati Firliani Dwiputri Fitrianti Darusman Gina Fuji Nurfarida Gita Cahya Eka Darma Hilda Aprilia, Hilda Latifa Hana Silfadani Lina Jamilah Liza Dzulhijjah Marillia, Viola Mentari Luthfika Dewi Muhammad Fillah Nabila Shofura Mahardhika Nadhifah Mauludia Rinaldie Nandhy Agustian Luca Pratama Nawang Wulan Rachmatillah Prastowo Putri Nurfadillah Hazar Putri, Nawang Wulan Rachmatillah Prastowo Resty Imfyani Sofyan Ridwan Wijaya Rizki Nuzulfikri Rizki Nuzulfikri Robby Prayitno Robby Prayitno Robby Prayitno Rohayah Rohayah Salsabilla Wijaya Sani Ega Priani Sellygani Budi Vaelani Sintya Suherlan Siti Ainun Rohaniah Siti Hardianti Syahrizal Nazala Sylvie Kurniasih Tanisa Maghfira Syarza Teti Sofia Yanti Trully Nouval Larasati Viola Marillia

Title Search

Found 17 Documents Search Journal : Bandung Conference Series: Pharmacy

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Title

Found 17 Documents
Search
Journal : Bandung Conference Series: Pharmacy