Garuda - Garba Rujukan Digital

Solubilization of silicate from quartz mineral by potential silicate solubilizing bacteria (Pelarutan silika asal mineral kuarsa oleh bakteri pelarut silika potensial ) Laksmita Prima SANTI; Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 85, No 2 (2017): Oktober 2017
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Silicon (Si) is the second most abundant materials, existing as a compound of several minerals in the soil varies from 50 to 400 g Si per kg of soil. Silicon has positive influence on the plant resistance to various abiotic and biotic stressors such as salinity, drought, heavy metal toxicities and diseases. Although Si is abundant in soil, most of its sources are not available for plant uptake due to low solubility of Si compounds in soil. To improve plant-available Si in the soil, silicate solubilizing bacteria (SSB) are potentially important in solubilizing insoluble forms of silicate. The objectives of this study were to determine: (i) biochemical characteristics of SSB, and (ii) silicate solubilizing activity of Burkholderia cenocepacia KTG, Aeromonas punctata RJM3020, and B. vietnamiensis ZEO3 in magnesium trisilicate (2MgO·3SiO2) and quartz mineral. A laboratory study was conducted at Microbiology and Environment Laboratory, the Indonesian Research Institute for Biotechnology and Bioindustry, Bogor, in 2016. All SSB were grown on Bunt and Rovira media containing 0.25% magnesium trisilicate or quartz mineral as substrate, respectively. Silica solubilizing activities by SSB were determined by using inductively coupled plasma-atomic emission spectrometry while organic acid concentration in the culture were measured by using high-performance liquid chromatography (HPLC). The results indicate that no correlation between solubilizing silicate activity and clear zone on solid Bunt and Rovira media. B.cenocepacia KTG, A.punctata RJM 3020, and B. vietnamiensis ZEO3 isolates were capable of producing citric, acetic, and oxalic acid in various optimum incubation time and accelerating the solubilization of SiO2 originated from quartz with Si solubility at 96-hour incubation time are 0.76; 0.86; and 0.70 ppm respectively. [Key words: Silicate solubilizing bacteria (SSB); Burkholderia cenocepacia KTG, A. punctata RJM 3020, B. vietnamiensis ZEO3, and silisic acid]. Abstrak Silika (Si) merupakan unsur kedua paling banyak dijumpai di dalam tanah dengan konsentrasi yang sangat beragam antara 50-400 g Si per kg tanah. Silika memberikan pengaruh positif pada ketahanan tanaman terhadap berbagai cekaman abiotik dan biotik seperti salinitas, kekeringan, toksisitas logam berat, dan penyakit. Meskipun berlimpah, sebagian besar sumber Si tidak tersedia bagi tanaman, karena kelarutan senyawa Si di dalam tanah cukup rendah. Untuk meningkatkan kelarutan Si di dalam tanah, bakteri pelarut silika berperan penting melarutkan silika dalam bentuk tidak larut. Penelitian ini bertujuan untuk menetapkan: (i)karakterisasi secara biokimia bakteri pelarut silika, dan (ii) kemampuan melarutkan silika dari sumber magnesium trisilika dan mineral kuarsa oleh Burkholderia cenocepacia KTG, Aeromonas punctata RJM3020, dan B. vietnamiensis ZEO3. Kegiatan penelitian dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi dan Lingkungan, Pusat Penelitian Bioteknologi dan Bioindustri Indonesia, Bogor, tahun 2016. Bakteri pelarut silika potensial ditumbuhkan di dalam medium Bunt dan Rovira yang mengandung masing-masing 0, 25% magnesium trisilikat atau kuarsa sebagai substrat. Aktivitas pelarutan silika oleh bakteri pelarut silika ditetapkan dengan spektrofotometer emisi atom dan produksi asam organik diukur dengan kromatografi cair kinerja tinggi (HPLC). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa tidak ada korelasi antara aktivitas pelarutan silika dengan zona jernih yang terbentuk dalam medium padat Bunt dan Rovira. Isolat B. cenocepacia KTG, A. punctata RJM3020, dan B. vietnamiensis ZEO3 dapat menghasilkan asam sitrat, oksalat, dan asetat dengan waktu inkubasi optimum yang bervariasi. Ketiga isolat tersebut juga dapat melarutkan SiO2 yang berasal dari mineral kuarsa dengan nilai kelarutan Si pada inkubasi 96 jam masing-masing sebesar 0,76;0,86; dan 0,70 ppm. [Kata kunci: bakteri pelarut silika, Burkholderia cenocepacia KTG, A. punctata RJM 3020, B. vietnamiensis ZEO3, asam silikat.]

Optimasi simbiosis cendawan mikoriza arbuskula Acaulospora tuberculata dan Gigaspora margarita pada bibit kelapa sawit di tanah masam Optimizing arbuscular mycorrhizal fungi symbiosis Acaulospora tuberculata and Gigaspora margarita with oil palm seedling in acid soil) Happy WIDIASTUTI; Edi GUHARDJA; Nampiah SOEKARNO; L K DARUSMAN; Didiek Hadjar GOENADI; Sally SMITH
E-Journal Menara Perkebunan Vol 70, No 2: Desember 2002
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

SummaryAM fungal symbiosis increase the uptake of P in oil palm seedlings. However the optimum condition of symbiosis has to be determined to get higher benefit of AM fungal symbiosis. Optimization of the symbiosis Acaulospora tuberculata and Gigaspora margarita with oil palm seedling in acid soil was determined. An experiment was conducted in polybag sized 40 x 60 cm contained sterilized Cikopomayak soil. Three factors studied were AM fungal species (A. tuberculata, G. margarita), inoculant dose (0.0; 12.5; 25.0; and 37.5% w/w), and fertilizer rate (0; 25; 50; and 100% recommended dose) and each treatment replicated three times. The result showed that optimum growth reached on the inoculant addition of 36% (w/w) in the form of infected roots, hypha, and spores and fertilizer dose of 25% for A. tuberculata, while for G. margarita was 40% (w/w) inoculant and 26% fertilizer. Efectivity of fertilizer and P uptake of oil palm seedling were significantly increased with AM fungi inoculation. P uptake of oil palm seedling inoculated with A. tuberculata increase. RingkasanSimbiosis cendawan mikoriza arbuskula (CMA) dapat meningkatkan serapan P pada pembibitan kelapa sawit. Namun, untuk mendapatkan keuntungan simbiosis yang tinggi perlu diketahui kondisi optimum simbiosis. Simbiosis CMA dengan tanaman sangat dipengaruhi tingkat hara dan dosis inokulum. Percobaan dilakukan dalam polibag berukuran 40 x 60 cm berisi tanah Cikopomayak steril. Tiga faktor yang diuji ialah spesies CMA (A. tuberculata, G. margarita), dosis inokulum campuran (0,0; 12,5; 25,0; dan 37,5% b/b), dosis pupuk (0; 25; 50; dan 100% dosis rekomendasi) dan masing masing perlakuan diulang tiga kali. Hasil percobaan menunjukkan bahwa pertumbuhan optimum dicapai pada pemberian inokulum berupa akar terinfeksi, hifa, dan spora 36% (b/b) dan pupuk 25% untuk A. tuberculata, sedangkan untuk G. margarita ialah 40% (b/b) inokulum dan pupuk 26%. Keefektifan pupuk dan serapan P meningkat secara nyata dengan inokulasi CMA

Aktivitas fosfatase dan produksi asam organik di rhizosfer dan hifosfer bibit kelapa sawit bermikoriza *) Phosphatase activity and organic acid production in rhizosphere and hyphosphere of mycorrhizal oil palm seedling Happy WIDIASTUTI; Nampiah SUKARNO; Latifah Kosim DARUSMAN; Didiek Hadjar GOENADI; Sally SMITH; Edi GUHARDJA
E-Journal Menara Perkebunan Vol 71, No 2: Desember 2003
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

SummaryStudies on the mechanism of the higher Puptake of oil palm seedling colonized witharbuscular mycorrhizal fungi throughsolubilizing of fixed P by organic acid orhydrolysis of organic P by phosphatase activityhave not been reported yet. This experiment wasaimed to examine the phosphatase activity andproduction of organic acids in rhizosphere andhyphosphere, mycorrhizal and non-mycorrhizaloil palm seedling. Oil palm seedling were grownfor 26 weeks in sterilized Cikopomayak acid soilin 20.5 cm diameter pots with three compart-ments, a central one for root growth(rhizosphere) and two adjacent on both side nextto the root compartment for hyphal growth(hyphosphere). Compartmentation was accom-plished by a 0.25 mm stainless steel filter. Allcompartment received a uniform concentration ofphosphorus (300 P mg kg -1 soil) either in organic(Na-phytate) or inorganic NH 4 HPO 4 form.Acaulospora tuberculata inoculum was establish-ed in pot culture using Pueraria phaseoloides as ahost, while Gigaspora margarita was propagatedusing maize as a host. AM fungal inoculumapplied as mixed propagules in optimum dosage.The experiment was conducted to asses ninetreatments combination between AM inoculation(without, A. tuberculata, and G. margarita) andsources of P (without P, inorganic P NH 4 HPO 4 ,and organic P Na phytate). Factorial in completerandomized design with two factors and threereplications was used in this research. In thehyphal compartment acid phosphatase activitywas much higher than alkaline phosphataseactivity, while in the rhizosphere alkalinephosphatase activity was higher compared toacid phosphatase activity. Acid phosphataseactivity in rhizosphere of oil palm seedlingsinoculated with A. tuberculata was significantlyhigher compared to uninoculated seedlings.However, both acid phosphatase activity andalkaline phosphatase activity were slightlyenhanced by mycorrhizal inoculation. In contrast,organic acid production between inoculatedseedling and uninoculated seedling was notsignificantly different. It seems that AM fungalsymbiosis with oil palm enhance mineralizationof organic P in spite of solubilization ofinorganic P.RingkasanMekanisme peningkatan pertumbuhankelapa sawit bermikoriza khususnya yangdisebabkan aktivitas pelarutan P anorganik yangterfiksasi melalui pelarutan oleh asam organikatau hidrolisis P organik oleh aktivitas fosfataseelum dilaporkan. Percobaan ini bertujuanmenetapkan aktivitas fosfatase dan produksi asamorganik di rhizosfer dan hifosfer, bibit kelapasawit bermikoriza dan tidak bermikoriza. Kelapasawit ditumbuhkan selama 26 minggu pada tanahmasam Cikopomnayak steril pada pot ber-diameter 20,5 cm yang terbagi atas tiga daerah,ruang tengah untuk pertumbuhan akar (rhizosfer)dan dua daerah di sebelahnya untuk pertumbuhanhifa (hifosfer). Penyekatan pot menggunakanfilter stainless steel berukuran lubang 0,25 mm.Semua daerah dipupuk P pada konsentrasi300 P mg kg -1 tanah baik dalam bentuk organik(Na-phytate) maupun anorganik (NH 4 HPO 4 )Inokulum CMA merupakan hasil perbanyakandengan sistem kultur pot menggunakan inangPueraria phaseoloides untuk Acaulosporatuberculata sedangkan untuk Gigasporamargarita menggunakan inang jagung. InokulumCMA berupa propagul campuran pada dosisoptimum. Percobaan dilakukan untuk mengujisembilan perlakuan yang merupakan kombinasiantara inokulasi CMA (tanpa, A. tuberculata,dan G. margarita) dan sumber P (tanpa P,anorganik P NH 4 HPO 4 , dan organik P Naphytate). Rancangan percobaan ialah rancanganacak lengkap faktorial dengan tiga ulangan untukmasing-masing perlakuan. Di hifosfer aktivitasfosfatase asam lebih tinggi daripada fosfatasealkalin, sedangkan di rhizosfer aktivitas fosfatasealkalin lebih tinggi dibandingkan dengan aktivitasfosfatase asam. Aktivitas fosfatase asam dirhizosfer bibit kelapa sawit yang diinokulasi A.tuberculata nyata lebih tinggi dibandingkandengan bibit yang tidak diinokulasi. Aktivitasfosfatase asam dan fosfatase alkalin sedikit lebihtinggi dengan inokulasi CMA. Sebaliknya,produksi asam organik antara bibit yangdiinokulasi dan bibit yang tidak diinokulasi tidakberbeda nyata. Tampak bahwa simbiosis CMAdengan kelapa sawit lebih meningkatkanmineralisasi P organik dan kurang meningkatkanpelarutan P anorganik.

Potensi fungi pelapuk putih asal lingkungan tropik untuk bioremediasi herbisida The potential white-rot fungi native of tropical environment for herbicides bioremediation Laksmita Prima SANTI; Lisdar Idwan SUDIRMAN; Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 75, No 1: Juni 2007
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

SummaryFungal treatment by using white-rot fungito reduce a wide variety of herbicide com-pounds is a specialized bioremediation pro-cess. A laboratory experiment was conductedto determine the ability of Phanerochaetechrysosporium, Ceriporiopsis subvermispora,and Pleurocybella porrigens and seven white-rot fungi isolated from a native of tropicalenvironment to grow on yeast malt extractglucose (YMG) agar containing highconcentration of (I) 2,4-dichlorophenoxy aceticacid, (R) glyphosate, and (G) paraquat. Thedata indicated that P. chrysosporium couldgrow on YMG media containing 5000 ppm of(I) 2,4-D, whereas BPBPI 02/04 isolate onYMG 250 ppm of (R) glyphosate or (G)paraquat. Relative values of growth inhibitionof these fungi are 81.1; 27.8; and 50.0%respectively. Biodegradation capability ofherbicides by candidate inoculants in soil-sandmedia was also determined in greenhouseexperiment by using peanut, sorghum, corn,and Borreria alata as bio-indicators. Peanutand B. alata were found to be the bestresponsive seedlings as bio-indicator on thepresence of (I) 2,4-D herbicide in soil-sandmedia.RingkasanTeknologi bioremediasi dengan fungipelapuk putih (FPP) digunakan untuk me-reduksi sejumlah senyawa herbisida. Kegiatanpenelitian yang dilakukan di laboratoriumbertujuan untuk mengetahui kemampuan tum-buh Phanerochaete chrysosporium, Ceripo-riopsis subvermispora, dan Pleurocybellaporrigens serta tujuh isolat FPP yang diperolehdari lingkungan tropik secara in vitro padamedium agar yeast malt extract glucose(YMG) yang mengandung (I) 2,4-dikloro-fenoksi asam asetat, (R) glifosat, dan (G)parakuat konsentrasi tinggi. Dari data yangdiperoleh, diketahui bahwa Ph. chrysosporiummemiliki kemampuan tumbuh dalam mediumpadat YMG yang mengandung 5000 ppm (I)2,4-D dan isolat BPBPI 02/04 pada 250 ppm(R) glifosat dan (G) parakuat dengan nilaihambatan pertumbuhan relatif terhadap kontrol(HPR) masing-masing 81,1; 27,8; dan 50,0%.Pengujian isolat terpilih terhadap kemampuanmendegradasi herbisida di dalam mediumtanah dan pasir juga dilakukan di rumah kacadengan menggunakan kacang tanah, sorgum,jagung, dan Boreria alata sebagai bioindikator.Kacang tanah dan B. alata memberikan responterbaik terhadap keberadaan herbisida (I) 2,4-Ddi dalam medium tanah dan pasir .

Penggunaan spora cendawan mikoriza arbuskula sebagai inokulum untuk meningkatkan pertumbuhan dan serapan hara bibit kelapa sawit Application of arbuscular mycorrhizal fungi spore as inoculant to increase growth and nutrient uptake of oil palm seedling Happy WIDIASTUTI; Nampiah SUKARNO; Latifah Kosim DARUSMAN; Didiek Hadjar GOENADI; Sally SMITH; Edi GUHARDJA
E-Journal Menara Perkebunan Vol 73, No 1: Juni 2005
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

SummaryA green house experiment was conducted tostudy the effect of spore number and species ofAM fungi as inoculant of oil palm. Two species ofAM fungi was evaluated in this study namelyAcaulospora tuberculata and Gigaspora margaritaand three spore number were tested i. e 200, 350,and 500 spores. There two fungi have thepotential as AM fungi inoculant for oil palm. Thesoil used was acid soil from Cikopomayak, WestJava while the oil palm seedling was from OilPalm Research Institute, Medan. A polybag sized20 x 40 cm was used. Spores as type of inoculantaffect the oil palm growth in longer time. Thebest growth of the seedling in term of height,fresh, and dry weight was obtained byinoculation at 500 spores of A. tuberculata andG. margarita. However, at 500 spores perpolybag, growth and N, P, and K uptake ofseedlings inoculated with A. tuberculata andG. margarita were not significantly differentexcept for seedling and root fresh weight. Oilpalm seedling inoculated with A. tuberculata at500 spores per seedling resulted higher root andseedling fresh weight compared with thoseinoculated with G. margarita. The different effectof seedling on A. tuberculata and G. margaritainoculation at 200 and 350 spores per seedlingwere only observed in plant height, fresh and dryweight of seedlings. The plant height, fresh, anddry weight of seedlings inoculated withA. tuberculata at 200 and 350 spores per seedlingwere higher compared with those inoculatedwith G. margarita. In addition inoculation withA. tuberculata at 200 spores per seedling resultedhigher N and K uptake of seedling compared withthose inoculated with G. margarita.RingkasanSuatu penelitian rumah kaca telah dilakukanuntuk mempelajari pengaruh jumlah spora danspesies cendawan mikoriza arbuskula (CMA)sebagai inokulum pada bibit kelapa sawit. Duaspesies CMA yang diuji ialah Acaulosporatuberculata dan Gigaspora margarita sedangkanjumlah spora yang diuji ada tiga tingkat yaitu200, 350, dan 500 spora. Bibit kelapa sawitberumur dua bulan ditanam di polibag berukuran20 x 40 cm yang berisi tanah yang bereaksimasam berasal dari Cikopomayak. Hasil yangdiperoleh menunjukkan bahwa spora sebaganokulum bibit kelapa sawit dapat mempengaruhipertumbuhan kelapa sawit namun diperlukanwaktu yang lebih lama untuk mendapatkanrespons inokulasi. Pertumbuhan tertinggi padapeubah tinggi bibit, bobot basah, dan bobotkering diperoleh pada inokulasi sebanyak 500spora per polibag baik untuk A. tuberculatamaupun G. margarita. Namun, pada inokulasisebanyak 500 spora per polibag, pertumbuhandan serapan N, P, dan K bibit yang diinokulasiA. tuberculata dan G. margarita tidak berbedanyata kecuali pada peubah bobot basah akar danbobot basah bibit. Bobot basah akar dan bobotbasah bibit kelapa sawit yang diinokulasiA. tuberculata sebanyak 500 spora, lebih tinggidibandingkan dengan bibit yang diinokulasidengan G. margarita pada jumlah spora yangsama. Pengaruh spesies hanya dapat ditunjukkanpada inokulasi 200 dan 350 spora khususnya padapeubah tinggi bibit, bobot basah, dan bobotkering bibit. Tinggi bibit, bobot basah dan bobotkering bibit yang diinokulasi A. tuberculata padajumlah spora 200 dan 350 per polibag lebih tinggidibandingkan dengan yang diinokulasiG. margarita. Tampak bahwa inokulasiA. tuberculata dengan 200 spora per polibagmenghasilkan serapan N dan K lebih tinggidibandingkan dengan yang diinokulasiG. margarita pada jumlah spora yang sama.

Penilaian mutu tanah secara cepat berdasarkan faktor penentu aktivitas biologinya Rapid assessment of soil quality as based on its biology activity determining factors Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 82, No 2: Desember 2014
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Abstract Agricultural practices are still heavily dependent on the use those socalled marginally-suitable soils with low soil fertility level. On the other hand, fertilization has been long known offering fertility solution, but it is indicative that its efficiency is low without soil amelioration. The conditions have been intensified by climatic change phenomena particularly increased atmospheric CO2 concentration which widely affects the soilbiological activity and crop performance as well. This review tries to discuss a thought to find the right method to assist management in determining the right solution for the problems encountered in the field based on soil and plant indicators. The method should be simple, fast, and reliable to express close relationship between soil characteristics and plant performance. The indicators should be those of very important soil characteristics determining soil biological activities as a measure for its fertility. Moreover, the indicators used must have highly sensitive to climatic change, anthropogenic activities, and their impacts on soil biological activity are significant. Soil organic matter (chemistry), bulk density, soil texture, and infiltration rate(physics), and worm population and soil respiration (biology) are main characters related to whole soil pro-ductivity. In addition, chlorophyll content and root density are the most potentiallyrelated indicators to crop performanceAbstrakKegiatan pertanian masih banyak tergantung pada pe-manfaatan tanah-tanah sub-optimal yang memiliki hambatan berupa rendahnya kesuburan tanah. Di sisi lain, pemupukan telah menawarkan solusi untuk mengatasinya, tetapi pada tanah-tanah seperti itu tidak akan banyak manfaatnya jika kemampuan tanah tidak diperbaiki. Kondisi ini diperparah dengan fenomena perubahan iklim, khususnya peningkatan kadar CO2 atmosfir yang berpengaruh luas terhadap aktivitas biologi tanah dan kinerja tanaman. Tulisan ini mengulas tentang perlunya perangkat pengambilan keputusan di lapangan untuk memilih solusi praktis yang tepat untuk me-nyelesaikan hambatan pertumbuhan dan/atau produksi tanaman dengan memanfaatkan indikator tanah dan/atau tanaman secara tepat. Metode yang dikembangkan adalah berdasarkan teknik penetapan yang mudah, cepat, dan cukup akurat dalam menggambarkan hubungan antara indikator terpilih dan kinerja tanaman. Indikator yang dimaksud adalah sifat tanah yang paling penting dalam menentukan aktivitas biologi di dalam tanah sebagai penanda dari kesuburan-nya.Selain itu, indikator yang digunakan harus cukup peka dalam menanggapi perubahan iklim dan perlakuan budidaya dan pengaruhnya nyata terhadap aktivitas biologi di dalam tanah. Kadar bahan organik tanah (kimia), bobot isi, tekstur tanah, dan laju infiltrasi (fisik), dan populasi cacing dan respirasi tanah (biologi) merupakan faktor tanah yang secara praktis mewakili daya dukung tanah secara keseluruhan. Di sisi lain, indikator tanaman yang diperkirakan memiliki hubungan erat dengan pertumbuhan dan produktivitas adalah kadar khlorofil daun dan kerapatan akar.

Arsitektur akar bibit kelapa sawit yang diinokulasi beberapa cendawan mikoriza arbuskula Root architecture of oil palm seedling inoculated with selected arbuscular mycorrhizal fungi Happy WIDIASTUTI; Edi GUHARDJA; Nampiah SUKARNO; Latifah KOSIM DARUSMAN; Didiek Hadjar GOENADI; Sally SMITH
E-Journal Menara Perkebunan Vol 71, No 1: Juni 2003
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Summary Oil palm is mostly cultivated in acid soil. The growth constraint of plant in acid soil is the limited availability of phosphorus (P) nutrient. Improvement of root system morphology and architecture have an important aspect since P is immobilized nutrient. Colonization of oil palm by rrbuscular mycorrhizal fungi increase the P uptake of plant. However, there is no information related to the effect of AM fungal colonization on oil palm root morphology and architecture. A research has been conducted to asses the effect of colonization of two species of AM fungi on root system morphology and architecture of oil palm seedling. The research was conducted using Cikopomayak acid soil as medium in simple glass chamber. The plant material was from Indonesian Oil Palm Research Institute, Medan while AM fungal inoculum was produced using pot culture. Six treatments assesed are combination of three levels of AM fungi inoculation (without inoculation with, Acaulospora tuberculata and Gigaspora margarita) and two levels of fertilization (without, and with fertilizer). The result showed that colonization of AM fungi could change the root system morphology, and root architecture. The root fresh weight, root dry weight, length, and volume were significantly higher with the AM fungi colonization especially A. tuberculata inoculation. However, specific root weight was not significantly different between inoculated and uninoculated. The enhancement was significantly observed 26 weeks after inoculation. Biside that, proportion of secondary root of oil palm inoculated with AM fungi was higher compared to primary root. Fertilization tend to reduced root growth. Fertilization reduced significantly root shoot ratio of inoculated as well as uninoculated seedlings. The rooting volume was higher in inoculated seedling compared to uninoculated. The highest enhancement of N, P, and K uptake was observed 26 weeks after inoculation. The better root morphology and architecture might be one mechanisms of AM fungi colonized oil palm seedlings in increasing P uptake. Ringkasan Umumnya tanaman kelapa sawit ditanam pada tanah masam. Hambatan pertumbuhan tanaman pada tanah masam adalah terbatasnya ketersediaan nutrisi P (fosforus). Oleh sebab itu perbaikan sistem morfologi dan arsitektur akar memiliki aspek yang penting disebabkan P merupakan nutrisi yang tidak mudah bergerak. Kolonisasi tanaman kelapa sawit dengan cendawan mikoriza arbuskula (CMA) akan meningkatkan penyerapan P oleh tanaman. Namun, hubungan antara simbiosis CMA dengan arsitektur perakaran kelapa sawit belum diketahui. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari pengaruh kolonisasi dua spesies CMA pada sistem morfologi dan arsitektur akar bibit tanaman kelapa sawit. Percobaan dilakukan menggunakan tanah masam Cikopomayak yang mengandung Al tinggi sebagai medium dalam kultur pot kaca yang sederhana. Kecambah kelapa sawit berasal dari Pusat Penelitian Kelapa Sawit (PPKS), Medan, sedangkan inokulum CMA diproduksi menggunakan kultur pot. Enam perlakuan yang diuji merupakan kombinasi tiga jenis inokulasi CMA ( tanpa inokulasi, inokulasi dengan Acaulospora tuberculata dan Gigaspora margarita) serta dua tingkat pemupukan (tanpa, dan dengan pemupukan). Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa inokulasi CMA merubah sistem morfologi dan arsitektur perakaran. Bobot basah, bobot kering, panjang dan volume akar nyata lebih tinggi pada tanaman yang dikolonisasi CMA khususnya A. tuberculata. Namun berat akar spesifik tidak beda nyata antara yang diinokulasi dan tanpa inokulasi. Peningkatan berat akar sangat nyata setelah 26 hari diinokulasi. Di samping itu proporsi akar sekunder lebih tinggi dibandingkan dengan akar primer pada tanaman kelapa sawit yang diinokulasi CMA. Pemupukan pada umumnya menurunkan pertumbuhan akar dan secara nyata menurunkan nisbah akar pucuk. Volume perakaran lebih besar pada bibit kelapa sawit yang diinokulasi dibandingkan dengan yang tidak diinokulasi. Peningkatan serapan N, P, dan K tertinggi teramati 26 minggu setelah inokulasi. Morfologi perakaran yang lebih baik demikian pula arsitektur perakaran mungkin merupakan mekanisme bibit kelapa sawit bermikoriza dalam meningkatkan serapan P.

Potensi Pseudomonas fluorescens strain KTSS untuk bioremediasi merkuri di dalam tanah The Potential use of Pseudomonas fluorescens KTSS strain formercury bioremediation in the soil Laksmita Prima SANTI; Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 77, No 2: Desember 2009
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractHeavy metals are widespread pollutants insoil and become environmental concern as theyare non-degradable and highly persistent. Solidand/or liquid wastes containing toxic heavymetals may be generated in various industrial ormining processes. A heavy metal resistantbacterium may be present in the soil and miningsite. As they already preconditioned by abundantheavy metals contaminant, the use of thesebacterium is assumed to be effective in improvingmetals reduction. To obtain bacterial isolateshighly capable of mercury (Hg) reduction,isolation activities have been conducted atselected sites of mining locations in SouthSumatera. The highly potential bacteriapossessing mercury reducing capability has beenisolated from this site i.e. Pseudomonasfluorescens KTSS strain. Inoculating of 25%(v/w) suspension of P. fluorescens KTSS strain insoil material added 5000 ppb of mercury, couldreduced about 53.3% of mercury soil contents.Best vegetative growth performance of cocoaseedlings was shown by the application of 15-15-15 NPK conventional fertilizers in combinationwith the addition of 1.6 – 3.25 g of P. fluorescensKTSS bio-ameliorant/seed. A Greenhouseexperiment results of cocoa seedlings were inconcordance with those obtained from field trialsof paddy.AbstrakLogam berat merupakan jenis polutan yangterdistribusi secara luas di dalam tanah danmendapat perhatian secara khusus karena sifatnyayang tidak dapat terdegradasi serta dapat bertahanlama di dalam lingkungan. Limbah padatdan/atau cair yang dihasilkan dari berbagai prosesindustri dan pertambangan mengandung logamberat toksik. Jenis bakteri yang resisten terhadaplogam berat mungkin berada di dalam tanah dandi lokasi tambang. Apabila bakteri tersebut dapatberadaptasi pada lingkungan dengan tingkatkontaminasi logam berat yang tinggi, makadiasumsikan bahwa penggunaan bakteri tersebutsangat efektif dalam meningkatkan reduksi logamberat. Untuk memperoleh isolat bakteri yangmemiliki kemampuan mereduksi merkuri (Hg),maka satu rangkaian kegiatan isolasi telahdilakukan di lokasi tambang terpilih di SumateraSelatan. Bakteri potensial pereduksi merkuri yangtelah diisolasi dari lokasi ini diidentifikasisebagai Pseudomonas fluorescens strain KTSS.Inokulasi sebanyak 25% (v/b) suspensi P. fluore-scens strain KTSS ke dalam bahan tanah yangtelah ditambah dengan 5000 ppb merkuri, dapatmereduksi sekitar 53,3% kandungan merkuri didalam tanah. Pertumbuhan terbaik dari bibitkakao diperoleh dari perlakuan pupuk NPK 15-15-15 yang dikombinasikan dengan 1,6 – 3,25 gbioamelioran P. Fluorescens strain KTSS/bibit.Pengujian bioamelioran P. fluorescens strainKTSS di lapang pada tanaman padi memberikanpola keefektifan yang sama dengan hasilpengujian terhadap bibit kakao yang dilakukan dirumah kaca.

Peningkatan kemantapan agregat tanah mineral oleh bakteri penghasil eksopolisakarida Aggregate stability improvement of mineral soil by exopolysaccharide-producing bacteria Laksmita Prima SANTI; Ai DARIAH; Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 76, No 2: Desember 2008
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Summary Pseudomonas fluorescens PG7II.1, Flavobacterium sp. PG7II.2, and Pseudomonas diminuta PG7II.9 have a potential to produce exopolysaccharide which help the formation and stabilization of soil aggregate. These bacteria have been isolated from the rhizosphere of Saccharum officinarum. Exopolysaccharide production in ATCC 14 liquid medium with sucrose was higher than that obtained from glucose, lactose, and 4-hydroxyphenil acetic acid (4-HAA) as a carbon sources. Producing of exopolysaccharide from these bacteria were 8.04 (P. fluorescens PG7II.1), 2.0 (Flavo-bacterium sp. PG7II.2) and 1.82 mg/mL (P. diminuta PG7II.9). Aggregate Stability Index (ASI) of mineral soil material was 114 when inoculated by these isolates after 60 days incubation period at ambient temperature. The ASI value of inoculated mineral soil material significantly different with uninoculated. The optimum of bacterial suspension to increase aggregate stability of mineral soil material was 12.5% (v/w) consisted of 109 CFU per mL. Ringkasan Pseudomonas fluorescens PG7II.1, Flavobacterium sp. PG7II.2, dan Pseudomonas diminuta PG7II.9, memiliki potensi dalam menghasilkan eksopolisakarida untuk pem-bentukan dan kemantapan agregat tanah. Ketiga bakteri tersebut diisolasi dari rhizosfer Saccharum officinarum. Sukrosa merupakan sumber karbon terbaik untuk produksi eksopolisakarida di dalam medium cair ATCC 14 apabila dibandingkan dengan glukosa, laktosa, dan 4-hydroxyphenil acetic acid (4-HAA). Eksopolisakarida yang dihasilkan dari ketiga bakteri tersebut masing-masing 8,04 (P. fluorescens PG7II.1); 2,0 (Flavobacterium sp. PG7II.2) dan 1,82 mg/mL (P. diminuta PG7II.9). Inokulasi ketiga isolat tersebut ke dalam bahan tanah mineral memberikan indeks stabilitas agregat (ASI) sebesar 114 setelah 60 hari inkubasi pada suhu ruang. Nilai indeks ini berbeda secara nyata apabila dibandingkan dengan bahan tanah mineral tanpa inokulan. Jumlah suspensi bakteri yang diperlukan untuk meningkatkan nilai indeks stabilitas agregat di dalam bahan tanah mineral secara optimum ialah 12,5% (v/b), dengan jumlah populasi bakteri 109 CFU per mL.

Pengaruh pemberian inokulan Burkholderia cenocepacia dan bahan organik terhadap sifat fisik tanah berpasir Effect of the inoculation of Burkholderia cenocepacia and organic materials on physical properties of a sandy soil Laksmita Prima SANTI; . SUDARSONO; Didiek Hadjar GOENADI; Kukuh MURTILAKSONO; Dwi Andreas SANTOSA
E-Journal Menara Perkebunan Vol 78, No 1: Juni 2010
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractSoil aggregation is a dynamic and very important factor for the development of agricultural soil functions. Unstable soil aggregation in a sandy soil type is a limiting factor for plant growth. The aim of this study was to investigate theinfluence of a exopolysaccharide-producing bacterium and organic material on some physical properties of a sandy soil. A highly potential bacterium for exopolysaccharides production, i.e Burkholderia cenocepacia, was isolated froma sandy soil located at Kotawaringin Barat, Central Kalimantan. The isolated bacterium is capable on improving aggregate’s stability of a soil with about 60% sand fraction [medium sand fraction (MSF)]. Interaction between available water and electric conductivity with aggregate stability index has significant correlation in medium sand fraction inoculated by 109 CFU of B. cenocepacia suspension, i.e. r = 0.806* and r=0.966**, respectively. Organic materials and its combination with the addition of 108 CFU B. cenocepacia suspension treatments could increase the aggregate stability index but have no effects on bulk density and total pore space values in an artificial condition of medium sand fraction. AbstrakAgregasi tanah bersifat dinamis dan merupakan faktor penting untuk pengembangan fungsi tanah pertanian. Ketidakstabilan agregat tanah pada jenis tanah berpasir merupakan faktor pembatas untuk pertumbuhan tanaman.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh eksopolisakarida bakteri dan bahan organik terhadap beberapa sifat fisik bahan tanah berpasir. Satu bakteri potensial penghasil eksopolisakarida yaitu Burkholderia cenocepacia telah berhasil diisolasi dari bahan tanah berpasir asal Kotawaringin Barat, Kalimantan Tengah. Bakteri ini dapat meningkatkan kemantapan agregat bahan tanah dengan kandungan fraksi pasir sekitar 60% [fraksi pasir sedang (FPS)]. Hubungan antara air tersedia dan konduktivitas elektrik terhadap indeks kemantapan agregat sangat nyata pada bahan tanah FPS yang diinokulasi dengan 109 CFU suspensi B. cenocepacia masing-masing r = 0,806* dan = 0,966**. Perlakuan bahan organik dan kombinasinya dengan penambahan 109CFU suspensi B. cenocepacia dapat meningkatkan indeks kemantapan agregat tetapi tidak mempengaruhi nilai kerapatan lindak dan total ruang pori di dalam fraksi pasir sedang.

Title

Found 21 Documents
Search
Journal : Menara Perkebunan

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Title Search

Found 21 Documents Search Journal : Menara Perkebunan

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Title

Found 21 Documents
Search
Journal : Menara Perkebunan