Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Bioscience

Specific primer design and optimization of annealing temperature for amplification gene peroxidase (POD) in Oryza sativa L. Nella Fauziah; Afifatul Achyar; Zulyusri Zulyusri; Yusni Atifah; Linda Advinda; Violita Violita
Bioscience Vol 7, No 2 (2023): Biology
Publisher : UNIVERSITAS NEGERI PADANG

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24036/bsc.v7i2.122972

Abstract

Peroksidase (POD) merupakan enzim antioksidan yang memiliki beragam fungsi dalam siklus hidup tanaman, salah satunya adalah sebagai pertahanan dalam melawan ROS dengan mengkatalisis konversi H2O2 menjadi udara dan O2 . Kemampuan aktifitas enzim POD dalam mengatur kandungan H2O2 memungkinkan enzim tersebut dapat mempertahankan tanaman dari cekaman. Metode yang dapat digunakan untuk amplifikasi gen POD salah satunya yaitu kuantitatif reverse transcription- PCR (qRT-PCR). Metode ini memerlukan beberapa komponen penting salah satunya yaitu primer ( forward dan reverse ). Primer yang digunakan dalam amplifikasi gen harus spesifik terhadap gen target sehingga dapat mengenali dan menempel pada gen target yang diinginkan. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain primer yang sesuai untuk amplifikasi gen POD menggunakan teknik qRT-PCR. Primer dirancang menggunakan perangkat PrimerQuest. Primer yang telah dirancang kemudian dianalisis untuk spesifikasinya dengan geneious prime . Kemudian spesifikasi primer di cek menggugakan primer BLAST. Hasil desain primer dengan kriteria terbaik untuk amplifikasi gen POD yaitu Forward POD 5'-AAATGCGTCGATCTACTGTACCT-3' dan Reverse POD 5'-GTGTTGAAAATGGCAATAAACCGG-3'
Co-Authors Abdul Rahman Abdul Razak Abi Suwars Afifatul Achyar Ahmad Subari Ahmad Syukri Al Fahrurz Ardi Ardi Asra Indah Asra Indah Atifah, Yusni Azwir Anhar Azwir Azwir Cindy Oktafina Nengsih Cindy Oktafina Nengsih Desi Wahyuni Elismawati Elismawati Elmayana Fradila Elsa Yuniarti Fadika Hayyuni Festiyed Fitri Arsih Fitri Arsih Hadeli Hadeli Heffi Alberida Helendra Helendra Helka Yuliati Helsa Rahmatika Hidayat Al Azmi Ida Elfira Ilwandri Ilwandri Indra Hartanto Irdawati Irdawati Isnaini Nur Habibah Jumatul Hafsah Khairatunnisa Khairatunnisa Khodzijah Nur Amalia Kurnia Wulansari Laila Kurnia Sari Lenti Supriwardi Linda Advinda Lucy Petra Kamelsa Lufri Lufri Melandi Wimudi Melitha Aurora Hasanti Mico Arisanto Muhamad Sholichin Nafisha Vebiola Irani Nanta Mulia Nella Fauziah Nindya Ananda Latifa Nining Efriani Nisa Al Mukarromah Nisa Firdha Nisrina Zakia Khalel Noni Fatillah Noveridha Utama Novi Indah Lestari Novia Afriliska Novica Ashari Pingki Lestari Putri Sarinami Rahma Lestari Rahmadhani Fitri Rahmawati Darussyamsu Rahmawati Rahmawati Rahmi Aulya Rahmi Suci Nadira Rahmita Mawadah Ramadhan Sumarmin Relsas Yogica Restu Fitriani Retti Yuselmi Retti Yuselmi Revi Gina Gunawan Revi Gina Gunwan Rhavy Ferdyan Ristiono Ristiono Sa'diatul Fuadiyah Sa’diatul Fuadiyah Selaras, Ganda Hijrah Selvi Seftiani Septu Yoelianty Sukma Sintia Putri Suhaimi Suhaimi Tiffany Mantoviana Tomi Apra Santosa Tomi Apra Santosa Tomi Apra Santosa Santosa Upris Yastati Violita Violita Violita Weni Febrianti Wirda Taufik Wuri Julita Yayat Suharyat Yosi Laila Rahmi Yulia Adytia Putri