Claim Missing Document
Check
Articles

Functional Classification of Skinning Injury Responsive Genes in Storage Roots of Sweetpotato Jollanda Effendy; Darda Efendi; Nurul Khumaida; and Gustaaf Adolf Wattimena
Indonesian Journal of Agronomy Vol. 45 No. 1 (2017): Jurnal Agronomi Indonesia
Publisher : Indonesia Society of Agronomy (PERAGI) and Department of Agronomy and Horticulture, Faculty of Agriculture, IPB University, Bogor, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (435.549 KB) | DOI: 10.24831/jai.v45i1.11667

Abstract

Skinning injury in sweetpotato due to loss of skin or periderm which occurred during harvest is inevitable and account for financial loss due to dehydration, pests, and pathogens. Hence, studies on gene expression changed due to skinning injury can provide important information about this protective tissue and for improving the life of storage roots. New candidate genes involved in skinning injury were isolated with an Annealing Control Primer (ACP). Using 20 ACP primers, a total of 103 differentially expressed genes (DEGs) were retrieved. In this study, the functional annotation of these selected 15 up-regulated DEGs (10 contigs and 5 singletons) were characterized. The results showed that these 15 “DEG-unigenes” are mainly associated with defense and stress responses, regulation and signaling, protein synthesis and fate, and metabolism may play an important role in the primary responses to skinning injury in storage roots of sweetpotato. This study showed the importance of defense and stress responses genes to the formation of wound periderm. Furthermore, this results can be used for better understanding of the molecular mechanism of skinning/mechanical injury-related genes in the storage roots of sweetpotato as well as to all stems, fruits, and roots of all plants. Keywords: differentially expressed gene, gene function, Ipomoea batatas, wounding
Studi Pemberian Kalsium untuk Mengatasi Getah Kuning pada Buah Manggis (Garcinia mangostana L.) , Dorly; Indah Wulandari; Roedhy Poerwanto; Darda Efendi; Soekisman Tjitrosemito
Indonesian Journal of Agronomy Vol. 39 No. 1 (2011): Jurnal Agronomi Indonesia
Publisher : Indonesia Society of Agronomy (PERAGI) and Department of Agronomy and Horticulture, Faculty of Agriculture, IPB University, Bogor, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (193.751 KB) | DOI: 10.24831/jai.v39i1.13188

Abstract

Gamboge is the main problem in mangosteen agribusiness because it is one of the major factors lowering fruit quality. Calcium is one of the important elements that strengthening cell wall; it is which was binding with the pectin as a middle lamella component. The objectives of the research were to study the effect of calcium application on the presence of gamboge spots, physical, and chemical properties of mangosteen fruit. Trial was conducted in a randomized complete block design with three replications in two consecutive years. The calcium source was dolomite, applied in four different dosages, i.e. 0, 18, 24, and 34 ton ha-1 for the fi rst year and 0, 12.5, 15, and 17.5 ton ha-1 for the second year. The results showed that calcium application raised soil pH and calcium content of the soil, exocarp and mangosteen leaves. Dolomite applications using 18 and 24 ton ha-1 in the fi rst year and 17.5 ton ha-1 in the second year were effective to reduce gamboge spots on the outer part of fruit, however they were not effective to reduce gamboge in aril. Dolomite applications did not increase transversal diameter, fruit weight, total soluble solids, total titratable acids, and ratio of total soluble solids with total titratable acids of the fruits.
Perbanyakan Pepaya (Carica papaya L.) ‘Sukma’ In Vitro dari Eksplan Tunas Pucuk sebagai Respon terhadap BA dan NAA Fitri Fatma Wardani; Darda Efendi; Diny Dinarti; dan Joko Ridho Witono
Indonesian Journal of Agronomy Vol. 47 No. 2 (2019): Jurnal Agronomi Indonesia
Publisher : Indonesia Society of Agronomy (PERAGI) and Department of Agronomy and Horticulture, Faculty of Agriculture, IPB University, Bogor, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (528.306 KB) | DOI: 10.24831/jai.v47i2.25115

Abstract

Papaya is one of tropical fruits native to Southern Mexico and which have been cultivated in Indonesia for a longtime. Papaya is usually propagated by seeds. Therefore, the offsprings are not true-to-type. This study was conducted todevelop a protocol of in vitro propagation of papaya ‘Sukma’ from shoot tips of in vitro germinated seeds as explants. Seedswere extracted from fruit that physiologically ripe and it germinated on MS basal medium. The experiment was set up in arandomized block design with culturing day as blocks (four blocks) and various concentrations of BA (0.0, 0.5, 1.0, 1.5, and2.0 mg L-1) in MS medium enriched with NAA 0.5 mg L-1 as treatment. Shoot tips in the MS medium without plant growthregulator as control so there was six treatments and 24 observation units. Each observation units contained five culturevessels and each culture vessels contained four explants. The results showed that the highest number of shoots, number ofleaves, number of nodes, and percentage of explant forming callus were obtained by BA 1.0-1.5, 1.0-2.0, 0.5-2.0, and 1.0-1.5 mg L-1, respectively. The highest percentage of explant forming roots were obtained in medium without BA. Analysis ofregression showed that the optimum concentration to get the highest number of shoots and leaves were BA 1.31 and 1.35 mgL-1, while explants will be rooted in medium without BA. Thus, in vitro propagation for papaya ‘Sukma’ should be conductedin two steps, i.e. for shooting and rooting growth.
Keragaman Morfologi dan Komponen Hasil Kubis Bunga (Brassica oleracea var. botrytis L.) di Dataran Tinggi dan Dataran Rendah Dyra Haryanti; Darda Efendi; Sobir
Indonesian Journal of Agronomy Vol. 47 No. 3 (2019): Jurnal Agronomi Indonesia
Publisher : Indonesia Society of Agronomy (PERAGI) and Department of Agronomy and Horticulture, Faculty of Agriculture, IPB University, Bogor, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (327.718 KB) | DOI: 10.24831/jai.v47i3.25902

Abstract

Increasingly limited land in the high elevation and increasing of global temperature needed breeding of cauliflower plants originating from temperate regions to be adaptively planted in low elevation. This study aimed to identify the morphological variability and yield component of cauliflower planted in the high elevation and low elevation. The experiment was conducted in Pasir Sarongge (1,117 m asl) and Tajur II (340 m asl) from June to December 2016. This experiment was conducted with a randomized complete block design single-factor (12 genotypes of cauliflower) with three replications. The results showed that BOB 021 genotype was not flowering in Tajur. Qualitative characteristics that are stable in two locations include leaf attitude, leaf color, curd color, leaf lobing, and curd covering by inner leaves. Vegetative characters and yields in low elevation were higher than high elevation, time of flowering and harvesting in high elevation was earlier than in low elevation. Based on the correlation analysis, an increase in the yield characters can be seen from the increase in vegetative character and increase in longevity time of flowering and harvesting. Keywords: correlation, flowering, qualitative, quantitative
Sterilisasi dan Pertumbuhan In Vitro Tunas Aksilar Pepaya Kultivar Callina dan Caliso Rahmi Fajri; Darda Efendi; Diny Dinarti
Indonesian Journal of Agronomy Vol. 49 No. 1 (2021): Jurnal Agronomi Indonesia
Publisher : Indonesia Society of Agronomy (PERAGI) and Department of Agronomy and Horticulture, Faculty of Agriculture, IPB University, Bogor, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (625.698 KB) | DOI: 10.24831/jai.v49i1.33914

Abstract

Pepaya tipe sedang dan kecil sudah digemari di Indonesia sejak satu dekade lalu. Sebagian besar tanaman pepaya yang diperbanyak dari biji menghasilkan profit yang rendah karena heterogenitas dan variasi genetik yang diakibatkan oleh penyerbukan silang, sehingga diperlukan kegiatan secara kultur in vitro. Penelitian dilakukan di Laboratorium Kultur Jaringan Pusat Kajian Hortikultura Tropika (PKHT) IPB, Bogor, dari November 2018 hingga Januari 2020. Eksplan merupakan tunas aksilar pepaya kultivar Callina dan Caliso umur 2 minggu. Penelitian dirancang secara faktorial dalam lingkungan Rancangan Acak Kelompok (RAK). Penelitian ini dibagi menjadi dua percobaan: a) Percobaan pertama bertujuan untuk mengetahui pengaruh metode sterilisasi dengan faktor sumber eksplan (rumah kaca dan lapangan) dan metode sterilisasi (M1, M2, M3, dan M4), dan b) Percobaan kedua bertujuan untuk optimalisasi konsentrasi BAP dan GA3 pada pertumbuhan tunas dengan konsentrasi BAP 0.0, 0.5, 1.0, 1.5, dan 2.0 mg L-1, dan konsentrasi GA3 0.0, 0.3, dan 0.4 mg L-1. Hasil penelitian menunjukkan bahwa eksplan dari rumah kaca pada sterilisasi metode M4 menghasilkan tingkat kontaminasi terendah yaitu 19.9% untuk Caliso dan 29.9% untuk Callina. Media terbaik untuk menghasilkan tinggi tunas optimum adalah BAP 0.5 mg L-1 dan GA3 0.3 mg L-1 untuk Caliso dan BAP 0.5 mg L-1 dan GA3 0.4 mg L-1 untuk Callina dengan tinggi rata-rata 1.6 dan 1.8 cm, sehingga tunas dapat dipindahkan ke tahap pengakaran. Kata kunci: Asam giberelat, Benzyl amino purine, Carica papaya, kontaminasi, sterilisasi
Pengelolaan Pemangkasan Tanaman Kakao (Theobroma Cacao L.) Di Cilacap, Jawa Tengah . Angela; Darda Efendi
Buletin Agrohorti Vol. 3 No. 3 (2015): Buletin Agrohorti
Publisher : Departemen Agronomi dan Hortikultura

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (600.46 KB) | DOI: 10.29244/agrob.v3i3.15800

Abstract

Penelitian ini berlangsung di daerah Cilacap, Jawa Tengah mulai dari 14 Februari sampai 14 Juni 2011. Tujuan penelitian ini yaitu untuk pengetahuan, pembelajaran dan memahami manajemen pemangkasan kakao di kebun. Aktivitas penelitian terdiri atas teknikal dan aspek manajerial yaitu sebagai karyawan harian lepas selama satu bulan, asisten mandor selama satu bulan, dan sebagai pendamping asisten afdeling selama dua bulan. Data primer diperoleh dari semua aktivitas penelitian dan pengamatan langsung di lapang, sedangkan data sekunder diperoleh dari catatan laporan perusahaan. Pemangkasan yang dilakukan selama penelitian yaitu pemangkasan pemeliharaan. Pemangkasan mempengaruhi jumlah tunas air, bantalan yang berbunga, ketahanan cherelle (pentil buah) dan buah terhadap hama dan penyakit tanaman. Rotasi pemangkasan juga mempengaruhi kestabilan produksi biji tahunan kakao.
Konservasi In Vitro Pisang Kepok Unti Sayang (Musa balbisiana) Melalui Pertumbuhan Minimal pada Berbagai Media Ogie Satriadi; Darda Efendi; . Sulassih
Buletin Agrohorti Vol. 5 No. 1 (2017): Buletin Agrohorti
Publisher : Departemen Agronomi dan Hortikultura

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (426.488 KB) | DOI: 10.29244/agrob.v5i1.15888

Abstract

Pisang kepok Unti Sayang memiliki kandungan karbohidrat 30% sehingga berpotensi sebagai bahan pangan alternatif. Pisang kepok Unti Sayang juga merupakan tanaman yang lebih tahan terhadap serangan penyakit layu darah. Ketersediaan bibit dari anakan pisang di lapang yang terbatas jumlahnya berpotensi menyebabkan punahnya pisang jenis ini. Konservasi secara in vitro merupakan solusi dalam memelihara ketersediaan bibit yang lebih aman, lebih efektif dan efesien. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan konsentrasi media yang optimal dalam upaya penyimpanan eksplan pisang kepok Unti Sayang dengan cara meminimumkan pertumbuhan menggunakan retardan paclobutrazol dan osmoregulator manitol serta mengevaluasi daya regenerasi pasca penyimpanan. Penelitian ini menggunakan rancangan kelompok lengkap teracak satu faktor berupa komposisi media yang terdiri dari dua macam media, yang  pertama adalah  MS+ PVP (Polivinylpyrrolidone ) +  paclobutrazol ( 0, 2, 4 dan  6 ppm),  serta  MS+ PVP  + manitol (0, 20 dan 40 ppm). Eksplan disimpan selama 18 minggu pengamatan pada media pertumbuhan minimal, selanjutnya eksplan disubkultur dalam media regenerasi   MS + 2 ppmBA dan diamati selama 4 minggu. Konsentrasi media terbaik untuk meminumkan pertumbuhan eksplan adalah MS+ PVP ditambah paclobutrazol 6 ppm memberikan nilai rata-rata pertumbuhan yang paling rendah dengan  jumlah tunas sebanyak 0.33, tinggi eksplan  0.39 cm,  jumlah akar  0.22 dan  jumlah daun 0.00.  Jika dibandingkan dengan pertumbuhan tertinggi yang terdapat pada tunas 1.11 (kontrol), tinggi 1.73 cm (kontrol),  jumlah akar 1.11 (paclobutrazol 2 ppm) dan jumlah daun 0.44 (kontrol).  Jadi konservasi in vitro pada perlakuan 6 ppm adalah perlakuan yang paling optimal dalam meminimumkan pertumbuhan eksplan hingga 18 minggu.
Pengelolaan Panen Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Pelantaran Agro Estate, Kota Waringin Timur, Kalimantan Tengah Fajar Dianto; Darda Efendi; Ade Wachjar
Buletin Agrohorti Vol. 5 No. 3 (2017): Buletin Agrohorti
Publisher : Departemen Agronomi dan Hortikultura

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (385.906 KB) | DOI: 10.29244/agrob.v5i3.19574

Abstract

Kegiatan yang dilaksanakan di Pelantaran Agro Estate (PAGE), Kota Waringin Timur, Center Borneo dimulai dari 14 Februari 2011 hingga 14 Juni 2011. Tujuan kegiatan ini adalah menganalisa pengelolaan panen pada perkebunan Kelapa Sawit. Pengelolaan panen Kelapa Sawit penting dalam upaya mencapai kuantitas dan kualitas minyak kelapa sawit yang tinggi. Data primer diperoleh dengan mengikuti keseluruhan kegiatan di perkebunan ini, pengamatan di lapangan, wawancara, dan diskusi langsung atau tidak langsung dengan staf. Data sekunder diperoleh dari laporan manajemen. Berdasarkan pengamatan selama kegiatan di PAGE dapat disimpulkan bahwa sudah memiliki pemahaman yang baik tentang kriteria buah masak. Ini bisa dilihat dengan buah mentah yang dipanen 0%, 1,5% di bawah matang, lebih matang 4,9%, 1,7% abnormal dan 91,9% buah matang. Namun masih ada kesalahan dengan pemanen seperti tangkai panjang yang masih lebih dari 2,5 cm, buah yang tidak dikutip masih 77 buah / ha, dan tandan yang tidak dipanen. Proses pengangkutan buah di PAGE sudah cukup baik. Hal itu bisa dilihat dengan mempercepat proses pengangkutan TBS (Fresh Bunch) dan buah-buahan ke PKS (pabrik kelapa sawit) dengan menggunakan bantuan kontraktor pengangkutan buah sehingga tidak ada buah yang tidak ditranspor.
Induksi Akar dan Tunas Setek Batang Tanaman Pohpohan (Pilea trinervia Wight) dalam Media Air dengan Perlakuan IBA dan Aerasi Katerin Ninariyani; Darda Efendi; E. Gunawan
Buletin Agrohorti Vol. 6 No. 3 (2018): Buletin Agrohorti
Publisher : Departemen Agronomi dan Hortikultura

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (396.868 KB) | DOI: 10.29244/agrob.v6i3.21103

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh penggunaan aerasi dan hormon pertumbuhan tanaman Indol -3-butiryc acid (IBA) pada induksi tunas dan akar setek Pohpohan (Pilea trinervia Wight.) dalam media air. Penelitian dilaksanakan di Rumah Kaca Kebun Percobaan Pasir Kuda, Pusat Kajian Holtikultura Tropika (PKHT) IPB pada bulan Juni-Oktober 2016. Penelitian menggunakan rancangan split-plot dua faktor dengan empat ulangan. Faktor pertama sebagai petak utama adalah aerasi terdiri dari dua taraf yaitu aerasi dan tanpa aerasi. Faktor kedua sebagai anak petak adalah IBA dengan empat taraf konsentrasi yaitu 0.0, 0.5, 1.0, dan 2.0 mg L-1. Hasil penelitian menunjukan bahwa perlakuan aerasi dan IBA berpengaruh terhadap persentase setek bertunas, jumlah akar, panjang akar, jumlah tunas, dan panjang tunas, namun tidak berpengaruh pada persentase setek hidup dan setek berakar. Kombinasi perlakuan tanpa aerasi dan IBA 0.5, 1.0, dan 2.0 mgL-1 menghasilkan jumlah akar paling banyak.
Induksi Pembungaan Jeruk Keprok Garut Melalui Pemangkasan Akar, Penyungkupan Tajuk, dan Strangulasi Mohamad Akhbar Maulana; Roedhy Poerwanto; Darda Efendi
Buletin Agrohorti Vol. 7 No. 2 (2019): Buletin Agrohorti
Publisher : Departemen Agronomi dan Hortikultura

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (552.268 KB) | DOI: 10.29244/agrob.7.2.200-206

Abstract

Induksi pembungaan menggunakan paclobutrazol secara berlebihan dapat mematikan tanaman jeruk akibat penumpukan residu dalam tanah. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan teknik induksi pembungaan tanaman jeruk yang efektif dalam menggantikan paclobutrazol untuk induksi pembungaan. Penelitian dilaksanakan di kebun percobaan Institut Pertanian Bogor Sindangbarang pada bulan Februari hingga bulan Juli 2017. Percobaan menggunakan Rancangan Kelompok Lengkap Teracak (RKLT) faktor tunggal yang terdiri dari 5 perlakuan yaitu kontrol, strangulasi, pemangkasan akar, penyungkupan tajuk, dan paclobutrazol. Data dianalisis dengan analisis sidik ragam yang kemudian dilanjutkan dengan uji lanjut Duncan. Semua perlakuan termasuk kontrol mempengaruhi munculnya tunas vegetatif, perlakuan penyungkupan tajuk tanaman menghasilkan jumlah tunas paling banyak dan panjang tunas paling panjang. Aplikasi paclobutrazol menunjukkan panjang daun paling pendek dan lebar daun paling sempit. Curah hujan yang tinggi menyebabkan semua perlakuan fisik dan kimia tidak menghasilkan bunga. Perlakuan fisik pada tanaman dapat menggantikan paclobutrazol namun perlu dilakukan penelitian lebih lanjut untuk mendapatkan perlakuan fisik yang dapat menginduksi pembungaan pada tanaman jeruk.
Co-Authors . Angela . Rudiyanto Ade Wachjar Ade Wachjar Alfia Annur Aini Azizi and Gustaaf Adolf Wattimena Andria Agusta ANDRIA AGUSTA Andria Agusta Angela, . Anneke Pesik Asti Kusriyanti Azizi, Alfia Annur Aini Azizi, Alfia Annur Aini Bambang S PURWOKO Bambang S. Purwoko Bambang S. Purwoko C Hanny Wijaya Cece Suhara dan Joko Ridho Witono Dede Robiatul Adawiyah Deden Derajat Matra Deden Sukmadjaja Dewi Sukma Dianto, Fajar Didy Sopandie DINARTY, DINY Diny Dinarti Djoko Santoso Djoko Santoso Don R LaBonte Dorly Dorly Dwi Utami Nur Usmani Dyra Haryanti E. Gunawan Edi Santosa Entit Hermawan Erwin Al-Hafiizh Evan Maulana Fajar Dianto Fajarudin, A Fitri Fatma Wardani Fitri Fatma Wardani Furqoni, Hafith Gunawan, E. Gustaaf A Wattimena Hanifah Muthmainnah heliyana hermawati Ika Mariska Ika Roostika Ika Roostika Ika Roostika IKA ROOSTIKA Ika Roostika Ika Roostika Tambunan Imanullah Dacholfany Imron Riyadi Inanpi Hidayati Sumiasih, Inanpi Hidayati Indah Wulandari Iswari S Dewi Joko Ridho Witono Jollanda Effendy Jollanda Effendy Kasutjianingati . Katerin Ninariyani Ketty Suketi Kusriyanti, Asti Laela Sari laela Sari, laela Lisnandar, Dea Silvia Lolliani MASKROMO, ISMAIL Maulana, Mohamad Akhbar Maya Melati Mayasari Yamin Mohamad Akhbar Maulana Mutiara Utami Naimatul Farida Ninariyani, Katerin Nindita, Anggi NOVARIANTO, HENGKY Nurul Khumaida Nurul Khumaida Nurul Khumaida Odit Ferry Kurniadinata Ogie Satriadi Putra, Mirza R Rahmat Budiarto Rahmi Fajri RARA PUSPITA DEWI LIMA WATI RARA PUSPITA DEWI LIMA WATI, RARA PUSPITA Reflinur Reflinur Resa Sri Rahayu Resa Sri Rahayu Riry Prihatini ROEDHY POERWANTO Rudiyanto Rudiyanto Rudiyanto Rudiyanto, Rudiyanto S Noorrohmah Satriadi, Ogie Sedyo Harsono SEDYO HARTONO Slamet Susanto Sobir Sobir Soekisman Tjitrosemito Sony Hartono Wijaya SRI HENDRASTUTI HIDAYAT Sri Yuliani Sri Yuliani Sri Yuliani Sudarsono Sukma, Dewi Sulassih, . Surya Diantina Susetio, Muhammad Tambunan, Ika Roostika Tambunan, Ika Roostika Tanari, Yulinda Taruna Shafa Arzam TENDA, ELSJE T. Tiara, Dede TRI ASMIRA DAMAYANTI Tri Istianingsih Tri Muji Ermayanti Tri Muji Ermayanti Tri Muji Ermayanti Trikoesoemaningtyas Triokoesoemaningtyas Triokoesoemaningtyas Vandra Kurniawan Wachjar, Ade Wahyu Fikrinda Wida W. Khumaero Willy Bayuardi Suwarno Winarso D. Widodo Yamin, Mayasari Yande Artha Gautama Yosi Zendra Joni Yosi Zendra Joni Yundari, Yundari